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View Full Version : Portugueses no Global25



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rxavierflima
11-14-2018, 09:39 PM
Dedicado a tudo o que é relacionado com o G25 (https://bga101.blogspot.com/2018/02/the-powerful-global-25-now-available.html) do Davidski.

PCA (https://anthrogenica.com/showthread.php?15359-G25-PCA-Plots) em 13/11/2018:

https://www.dropbox.com/s/zhfn7ghnh7tvjbe/G25%20PCA%2013-11-2018.png

Pelo que sei, até ao momento estão plotados 9 portugueses. Pede-se a quem for plotado, que diga aqui para ser sinalizado na imagem.
Idealmente destinado a quem só tem ascendência portuguesa nas últimas 4 ou 5 gerações.

rxavierflima
11-14-2018, 09:59 PM
Scaled:

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rxavierflima
11-14-2018, 10:09 PM
27093

Lado paterno: joaoflima
Lado materno: modeteftlima

Ruderico
01-09-2019, 11:38 AM
Xavier, apanhaste rodeiros na tua genealogia?
Estive a procurar em Cinfães no século XIX e quase metade dos baptizados na freguesia da minha avó materna eram da Roda de Piães. Ou a zona era muitíssimo pobre (ainda hoje Cinfães é o 2º concelho com menor PIB/capita do continente) ou as pessoas gostavam muito de se enrolarem sem estarem casadas. Uns trisavós meus, também de Piães, eram tão pobres que não pagaram pelo casamento

Tenho uma trisavó da Casa da Roda do Porto, apesar de ter casado e tido filhos em Cinfães

rxavierflima
01-09-2019, 11:01 PM
Xavier, apanhaste rodeiros na tua genealogia?
Estive a procurar em Cinfães no século XIX e quase metade dos baptizados na freguesia da minha avó materna eram da Roda de Piães. Ou a zona era muitíssimo pobre (ainda hoje Cinfães é o 2º concelho com menor PIB/capita do continente) ou as pessoas gostavam muito de se enrolarem sem estarem casadas. Uns trisavós meus, também de Piães, eram tão pobres que não pagaram pelo casamento

Tenho uma trisavó da Casa da Roda do Porto, apesar de ter casado e tido filhos em Cinfães

Até ao momento só encontrei 1 exposto (Roda do Porto). Mas nos registos da minha freguesia encontrei dezenas de casos de expostos na Roda.
A ideia que essa prática tornou-se comum no século XIX. O que tenho visto antes dessa altura (para além de filhos de mãe solteira e pai incógnito) são bebés deixados à porta de casas mais abastadas.
Com a crescente perda de influência da igreja no século XIX, muitas mulheres solteiras que tinham filhos optavam por os deixar na Roda.

Isso de metade dos baptizados da freguesia serem da Roda é estranho. Não sei como funcionava a distribuição das crianças expostas na Roda, mas talvez as colocassem em freguesias mais despopuladas. Talvez nessa freguesia houvessem famílias mais disponíveis para receber as crianças expostas das redondezas. Talvez tenha a ver com as amas de leite. Não sei. Mas podes por a questão no grupo do fb "Genealogia FB". É o maior grupo português de genealogia documental.

Ruderico
01-10-2019, 02:02 AM
Isso de metade dos baptizados da freguesia serem da Roda é estranho. Não sei como funcionava a distribuição das crianças expostas na Roda, mas talvez as colocassem em freguesias mais despopuladas. Talvez nessa freguesia houvessem famílias mais disponíveis para receber as crianças expostas das redondezas. Talvez tenha a ver com as amas de leite. Não sei. Mas podes por a questão no grupo do fb "Genealogia FB". É o maior grupo português de genealogia documental.

Há folhas em que 4 de 5 indivíduos listados eram da "Roda de Piaens". Por comparação em Mangualde isso era muitíssimo menos comum (mas havia mais mães solteiras, tenho uma trisavó assim). Pelo que a minha avó e tia-avó me contaram Piães estava longe de ter muita gente abastada, mesmo malta com nomes menos plebeus "Pinto de Vasconcellos" eram jornaleiros, lavradores etc. Não havia grande riqueza ali, é só montanha e o Rio Douro, nem cidade tens ao pé.

Eu suponho que as crianças eram transferidas para outros locais porque ali vivia pouca gente e eram pobres. Ao menos viviam num sítio bonito

rxavierflima
01-10-2019, 01:46 PM
Há folhas em que 4 de 5 indivíduos listados eram da "Roda de Piaens". Por comparação em Mangualde isso era muitíssimo menos comum (mas havia mais mães solteiras, tenho uma trisavó assim). Pelo que a minha avó e tia-avó me contaram Piães estava longe de ter muita gente abastada, mesmo malta com nomes menos plebeus "Pinto de Vasconcellos" eram jornaleiros, lavradores etc. Não havia grande riqueza ali, é só montanha e o Rio Douro, nem cidade tens ao pé.

Eu suponho que as crianças eram transferidas para outros locais porque ali vivia pouca gente e eram pobres. Ao menos viviam num sítio bonito

Atenção que lavrador e jornaleiro é muito diferente. Os lavradores tinham terras ou alugavam-nas aos abastados, os jornaleiros eram gente pobre que trabalhava à jorna nas propriedades outros.


Não percebi bem o teu relato. Essas crianças expostas na Roda de Piães eram crianças abandonadas nas freguesias em redor de Piães. Dali eram depois distribuidas por famílias disponíveis para as receber e mães de leite dessas freguesias, onde eram baptizadas. Certo?

Ruderico
01-10-2019, 01:51 PM
Não percebi bem o teu relato. Essas crianças expostas na Roda de Piães eram crianças abandonadas nas freguesias em redor de Piães. Dali eram depois distribuidas por famílias disponíveis para as receber e mães de leite dessas freguesias, onde eram baptizadas. Certo?

Suponho que sim, mas sem quaisquer certezas. O que te posso dizer de relatos de pessoas da geração da minha avó é que ali as pessoas eram bastante pobres, inclusive que a minha bisavó foi afastada da família por casar com o meu bisavô que era jornaleiro. A minha avó e as irmãs eram tratadas por "as filhas do Augusto" pelo próprio avô materno (que ironicamente também apareceu no registo de casamento como "jornaleiro", só quando teve as duas filhas foi "portador de malas de correio" ou simplesmente "correio")


Edit: exemplo https://digitarq.advis.arquivos.pt/viewer?id=1054766 tiff 19 e 20. No 26 todos (6) são da Roda

rxavierflima
01-10-2019, 02:13 PM
Suponho que sim, mas sem quaisquer certezas. O que te posso dizer de relatos de pessoas da geração da minha avó é que ali as pessoas eram bastante pobres, inclusive que a minha bisavó foi afastada da família por casar com o meu bisavô que era jornaleiro. A minha avó e as irmãs eram tratadas por "as filhas do Augusto" pelo próprio avô materno (que ironicamente também apareceu no registo de casamento como "jornaleiro", só quando teve as duas filhas foi "portador de malas de correio" ou simplesmente "correio")

Olha eu já vou com 11 filhos de pai incógnito, sendo que 2 deles têm também mãe incógnita https://www.dropbox.com/s/a2vxenqnl33iome/Inc%C3%B3gnitos%26padres.png XD

rxavierflima
01-10-2019, 02:19 PM
Suponho que sim, mas sem quaisquer certezas. O que te posso dizer de relatos de pessoas da geração da minha avó é que ali as pessoas eram bastante pobres, inclusive que a minha bisavó foi afastada da família por casar com o meu bisavô que era jornaleiro. A minha avó e as irmãs eram tratadas por "as filhas do Augusto" pelo próprio avô materno (que ironicamente também apareceu no registo de casamento como "jornaleiro", só quando teve as duas filhas foi "portador de malas de correio" ou simplesmente "correio")


Edit: exemplo https://digitarq.advis.arquivos.pt/viewer?id=1054766 tiff 19 e 20. No 26 todos (6) são da Roda

Então essa freguesia era um destino muito importante das crianças expostas na Roda de Piães. Como disse, talvez essa freguesia não tivesse muita gente e a intenção fosse aumentar a população dessa freguesia.

Ruderico
01-10-2019, 02:20 PM
Olha eu já vou com 11 filhos de pai incógnito, sendo que 2 deles têm também mãe incógnita https://www.dropbox.com/s/a2vxenqnl33iome/Inc%C3%B3gnitos%26padres.png XD

Já agora, duas perguntas:

1-Que programa usaste para essa árvore e para o mapa com os locais de nascença dos teus antepassados?
2-Se eu não tiver a certeza do local de nascimento do meu avô materno (dizem que ou era de Melres, Gondomar ou de Raiva, Castelo de Paiva), nem da data exacta (1917 ou 1918), posso simplesmente ir ao IRN na loja do cidadão e pedir uma fotocópia simples da certidão que eles procuram? Ou tenho de lhes dar mais informação, tipo a identificação da minha mãe?



Então essa freguesia era um destino muito importante das crianças expostas na Roda de Piães. Como disse, talvez essa freguesia não tivesse muita gente e a intenção fosse aumentar a população dessa freguesia.

A freguesia era a mesma onde estava localizada a Roda. Estou a ver que metade dos velhotes de lá não devem conhecer pelo menos um avô lol
edit: o tiff que queria mostrar com todos da Roda era afinal o 22

rxavierflima
01-10-2019, 02:43 PM
A freguesia era a mesma onde estava localizada a Roda. Estou a ver que metade dos velhotes de lá não devem conhecer pelo menos um avô lol
edit: o tiff que queria mostrar com todos da Roda era afinal o 22

Ah, então já faz mais sentido. As crianças abandonadas das redondezas iam para a Roda de Piães e em Piães eram distribuidas.



Já agora, duas perguntas:

1-Que programa usaste para essa árvore e para o mapa com os locais de nascença dos teus antepassados?
2-Se eu não tiver a certeza do local de nascimento do meu avô materno (dizem que ou era de Melres, Gondomar ou de Raiva, Castelo de Paiva), nem da data exacta (1917 ou 1918), posso simplesmente ir ao IRN na loja do cidadão e pedir uma fotocópia simples da certidão que eles procuram? Ou tenho de lhes dar mais informação, tipo a identificação da minha mãe?

A árvore foi feita no MacFamilyTree (só para Mac) e o mapa fiz no googlemaps https://www.google.com/maps/d/?hl=pt-PT
Eu pediria primeiro uma cópia da certidão de baptismo da tua mãe. Normalmente vem lá a freguesia do pai dela. Depois com essa informaçao pediria a cópia da certidão de baptismo do teu avô.

Ruderico
01-10-2019, 05:51 PM
Mas podes por a questão no grupo do fb "Genealogia FB". É o maior grupo português de genealogia documental.

Já pedi para entrar, ainda não tive autorização.
Por falar nisso, eles lá ajudam a descobrir antepassados? Como tenho um yDNA muito raro e como a minha família paterna tem uma grande tradição de moleiros ando a tentar procurar a origem mais remota possível, mas quando chego ao meu 8º avô paterno as coisas ficam complicadas porque não sei se estou a lidar com o mesmo Domingos Rodrigues morador nos Moinhos em Pindo ou não. É que não há propriamente muitos, ainda menos casados com uma Maria, o apelido dela aparece como Rodrigues num dos assentos, e noutro não, mas não seria a primeira fez que vejo estas omissões/mudanças na mesma pessoa, até em casos bem mais recentes...mas em 1700 as coisas são mais complicadas de verificar.

Se o que eu estou a ver não está errado, parece que nos finais de 1600s a minha família paterna veio do Bispado de Braga (do lugar blablabla (https://i.postimg.cc/Dfh0j40T/onde.png) freguesia de São Miguel) para Penalva do Castelo, e uns 100 e picos anos depois para Mangualde. Não há grandes alternativas, só vi mais um Domingos Rodrigues com ligações a Moinhos em Pindo que casou com uma Maria, mas foi em 1694. O filho (Manuel) nasceu em 1715 também nos Moinhos, duvido que estivessem casados e sem ter um filho durante 21 anos lol

rxavierflima
01-10-2019, 10:10 PM
Já pedi para entrar, ainda não tive autorização.
Por falar nisso, eles lá ajudam a descobrir antepassados? Como tenho um yDNA muito raro e como a minha família paterna tem uma grande tradição de moleiros ando a tentar procurar a origem mais remota possível, mas quando chego ao meu 8º avô paterno as coisas ficam complicadas porque não sei se estou a lidar com o mesmo Domingos Rodrigues morador nos Moinhos em Pindo ou não. É que não há propriamente muitos, ainda menos casados com uma Maria, o apelido dela aparece como Rodrigues num dos assentos, e noutro não, mas não seria a primeira fez que vejo estas omissões/mudanças na mesma pessoa, até em casos bem mais recentes...mas em 1700 as coisas são mais complicadas de verificar.

Se o que eu estou a ver não está errado, parece que nos finais de 1600s a minha família paterna veio do Bispado de Braga (do lugar blablabla (https://i.postimg.cc/Dfh0j40T/onde.png) freguesia de São Miguel) para Penalva do Castelo, e uns 100 e picos anos depois para Mangualde. Não há grandes alternativas, só vi mais um Domingos Rodrigues com ligações a Moinhos em Pindo que casou com uma Maria, mas foi em 1694. O filho (Manuel) nasceu em 1715 também nos Moinhos, duvido que estivessem casados e sem ter um filho durante 21 anos lol

Nesse grupo ajudam a decifrar assentos, mas ninguém vai os procurar por ti lol

É natural que os apelidos da mesma pessoa variem ou sejam omitidos entre assentos. Eu tenho alguns casos (do seculo XIX) em que a mesma pessoa aparece com 3 ou 4 apelidos diferentes.

Que assentos tens que referem esse casal? Presumo que tenhas o casamento deles, o baptismo de um filho, o casamento desse filho e o baptismo de um neto. Tenta encontrar o baptismo dos outros filhos desse casal, os casamentos desses filhos e mais baptismos de netos. Com tudo isso terás mais certezas de que se trata do mesmo casal.

Quanto à freguesia de São Miguel em Braga, há imensas possibilidades…https://onedrive.live.com/view.aspx?resid=CBAB4092355AD3AB!2297&ithint=file%2cxlsx&app=Excel&authkey=!ADPFcBzKhNwYlKw

Talvez esta: https://tombo.pt/f/brg05

Conseguir chegar ao nome do lugar já era um bom começo. Parece-me "Fonteira" mas duvido que seja isso.

Ruderico
01-10-2019, 10:15 PM
Nesse grupo ajudam a decifrar assentos, mas ninguém vai os procurar por ti lol

É natural que os apelidos da mesma pessoa variem ou sejam omitidos entre assentos. Eu tenho alguns casos (do seculo XIX) em que a mesma pessoa aparece com 3 ou 4 apelidos diferentes.

Que assentos tens que referem esse casal? Presumo que tenhas o casamento deles, o baptismo de um filho, o casamento desse filho e o baptismo de um neto. Tenta encontrar o baptismo dos outros filhos desse casal, os casamentos desses filhos e mais baptismos de netos. Com tudo isso terás mais certezas de que se trata do mesmo casal.

Quanto à freguesia de São Miguel em Braga, há imensas possibilidades…https://onedrive.live.com/view.aspx?resid=CBAB4092355AD3AB!2297&ithint=file%2cxlsx&app=Excel&authkey=!ADPFcBzKhNwYlKw
Perguntei porque no geneall procuram, encontraram umas coisas por mim que eu não tinha conseguido ver :)
Neste caso Braga até é o Bispado, que é bem maior

https://i.postimg.cc/8NTcqMyj/bispadobraga.png

rxavierflima
01-10-2019, 10:33 PM
Perguntei porque no geneall procuram, encontraram umas coisas por mim que eu não tinha conseguido ver :)
Neste caso Braga até é o Bispado, que é bem maior

https://i.postimg.cc/8NTcqMyj/bispadobraga.png

Arcebispado de Braga
Inclui:
Amares
Barcelos
Braga
Cabeceiras de Basto
Celorico de Basto
Esposende
Fafe
Guimarães e Vizela
Póvoa de Lanhoso
Terras de Bouro
Vieira do Minho
Vila do Conde/Póvoa de Varzim
Vila Nova de Famalicão
Vila Verde

Ruderico
01-11-2019, 09:38 AM
Arcebispado de Braga
Inclui:
Amares
Barcelos
Braga
Cabeceiras de Basto
Celorico de Basto
Esposende
Fafe
Guimarães e Vizela
Póvoa de Lanhoso
Terras de Bouro
Vieira do Minho
Vila do Conde/Póvoa de Varzim
Vila Nova de Famalicão
Vila Verde

Isso é hoje, certo? Os limites dos Bispados mudaram ao longo dos séculos. Se não estou em erro os seus limites eram estes:

Hoje
https://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/7/77/Provincia_eclesi%C3%A1stica_de_Braga.svg

1758
https://i.postimg.cc/8NTcqMyj/bispadobraga.png

Ruderico
01-11-2019, 11:35 AM
Parece que é mesmo Fontoura como disseram lá no Genealogia FB, já tinha lido que o meu yDNA E-M123* só tinha sido descoberto na região Norte e não no Centro, parece que as coisas estão a bater certo. Curiosamente a maioria dos meu matches no FTDNA são na América Latina, se calhar a linhagem era inicialmente Galega e um ramo saltou cá para Portugal. Rodriguez também é o apelido mais comum lá, mas isso não quer dizer nada


Com esta coisa toda desviei o objectivo do tópico lol
Aqui estão as minhas coordenadas e as da patroa



,PC1,PC2,PC3,PC4,PC5,PC6,PC7,PC8,PC9,PC10,PC11,PC1 2,PC13,PC14,PC15,PC16,PC17,PC18,PC19,PC20,PC21,PC2 2,PC23,PC24,PC25
Ruderico_scaled,0.099026,0.150298,0.036958,-0.010659,0.04647,0.001394,-0.004935,0.006231,0.029451,0.030798,-0.004547,0.008243,-0.016353,-0.012661,0.015608,-0.013922,-0.016559,-0.003421,0.004399,-0.004377,0.000374,-0.003462,0.004807,-0.002169,-0.002275

,PC1,PC2,PC3,PC4,PC5,PC6,PC7,PC8,PC9,PC10,PC11,PC1 2,PC13,PC14,PC15,PC16,PC17,PC18,PC19,PC20,PC21,PC2 2,PC23,PC24,PC25
Ruderico,0.0087,0.0148,0.0098,-0.0033,0.0151,0.0005,-0.0021,0.0027,0.0144,0.0169,-0.0028,0.0055,-0.011,-0.0092,0.0115,-0.0105,-0.0127,-0.0027,0.0035,-0.0035,0.0003,-0.0028,0.0039,-0.0018,-0.0019


,PC1,PC2,PC3,PC4,PC5,PC6,PC7,PC8,PC9,PC10,PC11,PC1 2,PC13,PC14,PC15,PC16,PC17,PC18,PC19,PC20,PC21,PC2 2,PC23,PC24,PC25
MrsRuderico_scaled,0.103579,0.140143,0.031301,-0.006137,0.042469,-0.002789,-0.00658,0.008307,0.031088,0.033896,-0.002436,0.001649,-0.01219,-0.021332,0.013301,-0.001724,0.000522,0.007728,-0.00264,0.005253,-0.001622,-0.011376,0.000123,-0.004217,-0.008263

,PC1,PC2,PC3,PC4,PC5,PC6,PC7,PC8,PC9,PC10,PC11,PC1 2,PC13,PC14,PC15,PC16,PC17,PC18,PC19,PC20,PC21,PC2 2,PC23,PC24,PC25
MrsRuderico,0.0091,0.0138,0.0083,-0.0019,0.0138,-0.001,-0.0028,0.0036,0.0152,0.0186,-0.0015,0.0011,-0.0082,-0.0155,0.0098,-0.0013,0.0004,0.0061,-0.0021,0.0042,-0.0013,-0.0092,0.0001,-0.0035,-0.0069

rxavierflima
01-11-2019, 12:01 PM
Faz sentido. Também me cheira a linhagem galega. Pena os assentos ainda não estarem disponiveis no tombo.pt

rxavierflima
01-12-2019, 12:09 PM
Parece que é mesmo Fontoura como disseram lá no Genealogia FB, já tinha lido que o meu yDNA E-M123* só tinha sido descoberto na região Norte e não no Centro, parece que as coisas estão a bater certo. Curiosamente a maioria dos meu matches no FTDNA são na América Latina, se calhar a linhagem era inicialmente Galega e um ramo saltou cá para Portugal. Rodriguez também é o apelido mais comum lá, mas isso não quer dizer nada

Eu tenho 24 matches com 37 marcadores: 15 Martin, 3 Todd, 1 Lamberton, 1 Chinchio, 1 Ailman, 1 Maxwell, 1 Button e 1 Boyd. Com 67 (estranhamente) não me aparece nada e com 111 tenho um Sam Martin cujo EKA é um Thomas Martin, nascido em 1715 na Carolina do Norte.

Ruderico
01-12-2019, 12:26 PM
Eu não sei bem como funcionam os matches de haplogrupos no FTDNA porque às vezes uns aparecem e outros não, consoante a número de marcadores, com 37 só aparece um

Com 111 marcadores tenho dois, ambos com origem no México, com nomes claramente Espanhóis. No total, com diferentes marcadores, tenho apenas oito matches. Dois com nomes Portugueses (um Brasileiro e um Americano com origens na Madeira, com 67 e 12 respectivamente), um Norueguês (12), quatro Mexicanos com nomes Espanhóis e um Rigueiro (67 marcadores), que parece ser Galego, mas não tenho a certeza. o INE Espanhol (http://www.ine.es/apellidos/formGeneralresult.do;jsessionid=698B613FCE8D630375 C8B9DE778055EB.apellidos03?vista=1) mostra que o nome é raro, mas a sua maior frequência é de longe em Lugo, portanto faz algum sentido que seja Galego. Em Portugal nunca vi o nome, mas a palavra existe na língua Mirandesa e significa ribeiro (http://www.mirandadodouro.com/dicionario/traducao-mirandes-portugues/rigueiro/). Daí que eu diga que a linhagem deva ser Galega, mas sem poder ir mais atrás no registo não tenho certezas


Edit: Estou no projecto do E-M35, eu e o Brasileiro fazemos parte de uma nova subclade, de certeza que o Galego e os dois Mexicanos também fazem, mas infelizmente não estão no projecto

Ruderico
01-25-2019, 02:36 PM
Decidi fazer um mapa janota como o teu. A maior parte das pessoas indicadas nasceram algures em 1700s, com excepção dos amarelos que são de meados de 1800. Nisto tudo falta um trisavô paterno - o tal Francisco Teixeira que falei no outro dia - que é de local incerto, mas o nome Teixeira é bastante raro naquele local e bem mais frequente mais a norte, na região do Douro e Trás-os-Montes.


Verde escuro é o meu antepassado paterno mais antigo - finais de 1600;
Cores quentes o lado da minha mãe;
Cores frias o lado do meu pai.


Mapa nacional
28618

Close up
28620


Ou seja basicamente meio Beira Alta, meio Douro (mais Litoral que Alto)

rxavierflima
01-25-2019, 03:56 PM
Decidi fazer um mapa janota como o teu. A maior parte das pessoas indicadas nasceram algures em 1700s, com excepção dos amarelos que são de meados de 1800. Nisto tudo falta um trisavô paterno - o tal Francisco Teixeira que falei no outro dia - que é de local incerto, mas o nome Teixeira é bastante raro naquele local e bem mais frequente mais a norte, na região do Douro e Trás-os-Montes.


Verde escuro é o meu antepassado paterno mais antigo - finais de 1600;
Cores quentes o lado da minha mãe;
Cores frias o lado do meu pai.


Mapa nacional
28618

Close up
28620


Ou seja basicamente meio Beira Alta, meio Douro (mais Litoral que Alto)

Tá fixório! Já agora, de que freguesia de Sta Mª da Feira tens antepassados?

Ruderico
01-25-2019, 04:10 PM
Tá fixório! Já agora, de que freguesia de Sta Mª da Feira tens antepassados?

Eram de Vale, são os pais de um 5º avô que nasceram aproximadamente em 1740/50. O apelido era (de) Azevedo (http://locatemyname.com/portugal/Azevedo)

rxavierflima
01-25-2019, 04:20 PM
Eram de Vale, são os pais de um 5º avô que nasceram aproximadamente em 1740/50. O apelido era (de) Azevedo (http://locatemyname.com/portugal/Azevedo)


Tenho alguns em Vale mas nenhum Azevedo até agora. Ainda só fui até fins do séc XVIII nesse ramo.

Gil Vicente
06-16-2019, 09:44 PM
Boas,

Tenho as minha coordenadas G25. O que recomendam a partir daqui?
Já agora, e se interessar, tenho raízes conhecidas no Alentejo Litoral e Baixo Alentejo.

Lusitano
06-16-2019, 10:03 PM
Boas,

Tenho as minha coordenadas G25. O que recomendam a partir daqui?
Já agora, e se interessar, tenho raízes conhecidas no Alentejo Litoral e Baixo Alentejo.

Já sabes usar o nMonte?

Gil Vicente
06-16-2019, 10:15 PM
Já sabes usar o nMonte?

Sim, o que fiz até agora foi correr no R o exemplo que ele me deu no mail para as coordenadas scaled e encontrei também esta thread para coordenadas unscaled:

https://anthrogenica.com/showthread.php?16882-New-improved-World-Medieval-G25-unscaled-calculator-(for-fun-of-course)

Falta estar no plot G25 penso eu?

Lusitano
06-16-2019, 10:36 PM
Sim, o que fiz até agora foi correr no R o exemplo que ele me deu no mail para as coordenadas scaled e encontrei também esta thread para coordenadas unscaled:

https://anthrogenica.com/showthread.php?16882-New-improved-World-Medieval-G25-unscaled-calculator-(for-fun-of-course)

Falta estar no plot G25 penso eu?

Por aqui irás encontrar muitas calculadoras e podes sempre criar as tuas próprias calculadoras também usando as coordenadas G25 das milhares de samples que já existem. Essa que mencionaste é apenas uma das várias que o ph2ter engendrou. Esses plots não sei fazer mas podes sempre pedir que façam por ti.

Um pequeno tutorial:

Cria dois documentos no bloco de notas, um irás nomear de data.txt e irás colocar as coordenadas que pretendes (neste caso as coordenadas World Medieval que mandaste no teu link). No outro documento que vais nomear de target.txt irás colocar as tuas coordenadas G25. Como são unscaled deverás usar as tuas coordenadas unscaled também. Grava os dois documentos e copia\cola na pasta R onde instalaste o nMonte.

Abre o nMonte, vai ao Archive no topo esquerdo da janela > Change dir. -> Open the nMonte folder -> OK.


- Copia\cola na janela principal:

source('nMonte3.R')

- Clica na tecla "Enter"

- De seguida copia\cola:

getMonte('data.txt', 'target.txt', pen=0)


- Clica "Enter" novamente

Aguarda pelos resultados.

Ruderico
06-21-2019, 08:44 AM
Não uses pen=0, que só em alguns modelos é aconselhável, por exemplo os que têm componentes muito distintas e pequenas em número. Por norma usa-se a penalidade standard, ou seja o comando é apenas getMonte('data.txt', 'target.txt')


Se puderem, à medida que forem tendo os vossos resultados, metam aqui as vossas coordenadas bem como uma pequena nota das vossas origens.

Gil Vicente
06-21-2019, 06:10 PM
Baixo Alentejo (do que sei, pesquisa não exaustiva):

,PC1,PC2,PC3,PC4,PC5,PC6,PC7,PC8,PC9,PC10,PC11,PC1 2,PC13,PC14,PC15,PC16,PC17,PC18,PC19,PC20,PC21,PC2 2,PC23,PC24,PC25
Gil_Vicente,0.097888,0.148267,0.032432,0.007106,0. 041854,-0.004183,-0.00329,0.002769,0.015135,0.027518,-0.003735,0.004646,-0.011596,-0.011836,0.011672,-0.006629,-0.010952,0.001267,-0.002388,-0.01013,0.00025,-0.000618,-0.003944,-0.002892,0.005269

,PC1,PC2,PC3,PC4,PC5,PC6,PC7,PC8,PC9,PC10,PC11,PC1 2,PC13,PC14,PC15,PC16,PC17,PC18,PC19,PC20,PC21,PC2 2,PC23,PC24,PC25
Gil_Vicente,0.0086,0.0146,0.0086,0.0022,0.0136,-0.0015,-0.0014,0.0012,0.0074,0.0151,-0.0023,0.0031,-0.0078,-0.0086,0.0086,-0.005,-0.0084,0.001,-0.0019,-0.0081,0.0002,-0.0005,-0.0032,-0.0024,0.0044

O ph2ter já me adicionou a um dos plots:

https://www.dropbox.com/s/q0clpcqc0xbr6u3/G25GilAndThracian.png?dl=0

rxavierflima
06-21-2019, 07:21 PM
Estás colado a mim e no entanto eu sou do norte. Interessante...

Gil Vicente
06-21-2019, 08:50 PM
Estás colado a mim e no entanto eu sou do norte. Interessante...

Sim, mas já percebi que Portugal não segue nenhum padrão nesse aspecto. Seria interessante se desse para ver padrões regionais.

rxavierflima
06-21-2019, 08:57 PM
Sim, mas já percebi que Portugal não segue nenhum padrão nesse aspecto. Seria interessante se desse para ver padrões regionais.

Segundo o Ruderico as diferenças são mais Litoral vs Interior do que Norte vs Sul.

Gil Vicente
06-21-2019, 09:06 PM
Segundo o Ruderico as diferenças são mais Litoral vs Interior do que Norte vs Sul.

Precisamos de samples regionais.

Lusitano
06-21-2019, 10:03 PM
Eu pareço ser o outlier entre os Portugueses. Fico sempre encalhado entre o cluster Ibérico e o Norte da Itália.

Ruderico
06-21-2019, 10:50 PM
Segundo o Ruderico as diferenças são mais Litoral vs Interior do que Norte vs Sul.

Talvez sim, talvez não. Há umas semanas saiu um estudo com amostras de Lisboa e Porto e eram virtualmente iguais, e muito semelhantes aos Galegos. Por sua vez os restantes Espanhóis já eram um pouco diferentes, portanto é possível que haja maior proximidade a Espanha no interior (eu sou um desses), mas não há certezas nenhumas...suspeito que haja mais variação pessoal que regional



Eu pareço ser o outlier entre os Portugueses. Fico sempre encalhado entre o cluster Ibérico e o Norte da Itália.

Não és outlier, há que seja mais "estranho", repara num plot com amostras do Oeste Euroasiático. Eu gosto de usar este dataset porque mostra bem diferenças entre os grupos, apanhando muita variação sem sobrecarregar o plot com grupos que são muito diferentes de nós e nos forçam todos a ficar uns em cima dos outros.

https://i.postimg.cc/jRrVnFwj/gilvicente-fullplot.png

https://i.postimg.cc/nFwbsVB8/gilvicente.png

Lusitano
06-21-2019, 10:55 PM
Como é que fazes para fazer "zoom" nos clusters Ibéricos? (segunda imagem).

Ruderico
06-21-2019, 11:00 PM
Tens de ir a Graph settings e introduzir as fronteiras do gráfico em viewport

Lusitano
06-21-2019, 11:04 PM
Tens de ir a Graph settings e introduzir as fronteiras do gráfico em viewport

Vou experimentar.

Se não tiver interpretado mal o teu PCA, tu estás no cluster de Castela e Leão, a tua namorada em Castela Leão e Portugal, eu na Galiza\Portugal e o Gil Vicente e rxavierflima nas Baleares?

Ruderico
06-21-2019, 11:14 PM
Vou experimentar.

Se não tiver interpretado mal o teu PCA, tu estás no cluster de Castela e Leão, a tua namorada em Castela Leão e Portugal, eu na Galiza\Portugal e o Gil Vicente e rxavierflima nas Baleares?

Nim, o problema é que o dataset só tem 3/4 referências por região de Espanha, portanto pode não significar grande coisa. Para além do mais o plot varia consoante as referências usadas.
O K7 do outro estudo ajuda a interpretar
https://i.postimg.cc/XjmfdQvh/admixturek7.png

Tecnicamente eu estou dentro do cluster de Castilla La Mancha, mas repara que uma das amostras plota com a Cantábria, as outras estão longe, então eu acabo por ficar ali dentro mas sem estar próximo de nenhum.
A minha patroa está próxima do grosso do mesmo cluster, mas mais a sul (também dentro do cluster Português).
Tu estás dentro do de Portugal, próximo da Andalusia, Galiza e Baleares.
O Xavier e o Gil estão fora, mas só porque não há referências suficientes.

Lusitano
06-21-2019, 11:20 PM
Eu já pedi ao David para fazer o G25 da minha namorada e em breve devo fazer o do meu pai também. Vão ser mais duas coordenandas Portuguesas para juntar ao resto.


Entretanto tentei fazer as alterações no Graphic Settings mas não percebi quais as coordenadas que devo introduzir para fazer zoom numa área específica. Não sei se é por tentativa e erro ou se simplesmente eu é que não pesco daquilo mas obrigado.

Ruderico
06-21-2019, 11:40 PM
Tens de olhar para os eixos do gráfico, depois é mais ou menos a olhometro.

Lusitano
06-22-2019, 10:27 AM
https://i.imgur.com/eZR0y7q.jpg

Lusitano
06-22-2019, 11:16 PM
Deixo aqui as minhas coordenadas e as da minha namorada:


,PC1,PC2,PC3,PC4,PC5,PC6,PC7,PC8,PC9,PC10,PC11,PC1 2,PC13,PC14,PC15,PC16,PC17,PC18,PC19,PC20,PC21,PC2 2,PC23,PC24,PC25
Lusitano_scaled,0.105855,0.144205,0.034318,-0.003553,0.040315,-0.004741,-0.003995,0.006,0.024134,0.028064,-0.00747,0.007943,-0.011893,-0.008257,0.008822,-0.009944,-0.013951,-0.003167,-0.000126,-0.007003,-0.001622,-0.010016,0.004314,-0.008314,0.002395

,PC1,PC2,PC3,PC4,PC5,PC6,PC7,PC8,PC9,PC10,PC11,PC1 2,PC13,PC14,PC15,PC16,PC17,PC18,PC19,PC20,PC21,PC2 2,PC23,PC24,PC25
Lusitano,0.0093,0.0142,0.0091,-0.0011,0.0131,-0.0017,-0.0017,0.0026,0.0118,0.0154,-0.0046,0.0053,-0.008,-0.006,0.0065,-0.0075,-0.0107,-0.0025,-0.0001,-0.0056,-0.0013,-0.0081,0.0035,-0.0069,0.002

,PC1,PC2,PC3,PC4,PC5,PC6,PC7,PC8,PC9,PC10,PC11,PC1 2,PC13,PC14,PC15,PC16,PC17,PC18,PC19,PC20,PC21,PC2 2,PC23,PC24,PC25
Trebaruna_scaled,0.099026,0.140143,0.039975,0.0006 46,0.044931,0.001673,-0.012221,0.000692,0.022293,0.029704,0.002436,0.003 747,-0.01665,-0.019542,0.012486,0.01896,0.009257,-0.007221,-0.006285,0.005628,0.002121,0.001113,0.001109,-0.008194,-0.012095

,PC1,PC2,PC3,PC4,PC5,PC6,PC7,PC8,PC9,PC10,PC11,PC1 2,PC13,PC14,PC15,PC16,PC17,PC18,PC19,PC20,PC21,PC2 2,PC23,PC24,PC25
Trebaruna,0.0087,0.0138,0.0106,0.0002,0.0146,0.000 6,-0.0052,0.0003,0.0109,0.0163,0.0015,0.0025,-0.0112,-0.0142,0.0092,0.0143,0.0071,-0.0057,-0.005,0.0045,0.0017,0.0009,0.0009,-0.0068,-0.0101






E só pela piada, fiz um datasheet com todas as coordenadas que foram postadas nesta thread e corri com as minhas:


[1] "1. CLOSEST SINGLE ITEM DISTANCE%"
rxavierflima matiasnlima joaoflima Ruderico
0.9318798 1.2333288 1.2830822 1.3192043
Gil_Vicente elisabetenjoaquim modeteftlima armandoejoaquim
1.4802365 1.9406700 2.0105969 2.1786693

[1] "distance%=0.8244"

Lusitano

rxavierflima,47
Ruderico,18
joaoflima,16.6
Gil_Vicente,9.8
matiasnlima,8
MrsRuderico,0.6

Ruderico
06-23-2019, 03:18 PM
Meti-a no PCA com o dataset do costume, ela plota próximo da referência nacional aqui também

https://i.postimg.cc/Q8jTzSks/Trebaruna.png

Lusitano
06-23-2019, 03:33 PM
Fixe.

Tens de actualizar o Global25 PCA West Eurasia dataset close up plot da tua assinatura :biggrin1:

Ruderico
06-23-2019, 04:22 PM
Fixe.

Tens de actualizar o Global25 PCA West Eurasia dataset close up plot da tua assinatura :biggrin1:

Bem visto, obrigado!



Vou postar uns modelozitos simples para efeitos de comparação.

Essencialmente é um modelo ligeiramente modificado dos que publiquei em "España y Portugal en modelos simples" na secção Espanhola, as únicas diferenças são uma referência composta germânica criada com samples do período migratório de Collegno, Szollad e Alemanha a que dei o nome pomposo de "Suebi" (nota: nenhuma das samples é de facto Sueva). Tenho um com as referências Visigóticas do Olalde2019 que mostro depois.
Também tem uma referência da Arménia do final do Bronze para quem tenha maiores influências mediterrânicas do oeste Asiático, visto que reparei que algumas pessoas beneficiam disso (outros nem tanto, e ficam com piores fits)..provavelmente também chegou cá durante o período Romano ou pouco antes dele, eu vejo-os como sendo complementares de influências do Centro/Leste do mediterrâneo.

Corri o modelo algumas vezes para cada um, postei o que teve a melhor fit. Isto foi feito com pen=0.001 (daí os resultados variáveis por cada run). Lembrem-se que os resultados podem variar um pouco consoante as referências usadas, o importante aqui é ver as tendências de cada um relativamente às referências. Acho sempre que as referências germânicas são um problema..às vezes parece que são irrelevantes, outras comem um grande pedaço dos modelos em alguns indivíduos.



[1] "distance%=0.9411"

Portuguese

Celtiberian,61.8
North_African,13.2
Roman_Imperial_proxy,10.6
Suebi_proxy,9.8
Armenia_LBA,4.6


[1] "distance%=1.9052"

Ruderico

Celtiberian,77.4
North_African,11
Armenia_LBA,7
Roman_Imperial_proxy,4.6


[1] "distance%=1.6194"

Lusitano

Celtiberian,70.2
North_African,13.6
Armenia_LBA,9.2
Roman_Imperial_proxy,7


[1] "distance%=1.7178"

rxavierflima

Celtiberian,70
North_African,12.6
Roman_Imperial_proxy,9
Armenia_LBA,7.6
Suebi_proxy,0.8


[1] "distance%=1.5664"

Gil_Vicente

Celtiberian,71.2
Armenia_LBA,9.8
Roman_Imperial_proxy,8.4
North_African,7.2
Suebi_proxy,3.4



E aqui das nossas patroas


[1] "distance%=1.7294"

MrsRuderico

Celtiberian,72.8
North_African,16
Roman_Imperial_proxy,6.8
Armenia_LBA,4.2
Suebi_proxy,0.2


[1] "distance%=2.3586"

Trebaruna

Celtiberian,68
North_African,10.4
Suebi_proxy,10.2
Roman_Imperial_proxy,8.8
Armenia_LBA,2.6


[1] "distance%=0.9569"

elisabetenjoaquim

Celtiberian,57
Suebi_proxy,16.8
North_African,12.8
Roman_Imperial_proxy,10.4
Armenia_LBA,3



O mesmo modelo, mas a referência germânica agora é feita com a média das samples góticas do Olalde2019. A fit piora um pouco, talvez estes indivíduos não sejam os mais adequados apesar de serem da península Ibérica. Podem ser um dead end, por exemplo.


[1] "distance%=0.9853"

Portuguese

Celtiberian,63.4
North_African,12.8
Roman_Imperial_proxy,11.2
Visigothic,8.8
Armenia_LBA,3.8


[1] "distance%=1.9114"

Ruderico

Celtiberian,77
North_African,10.6
Roman_Imperial_proxy,7.2
Armenia_LBA,5.2


[1] "distance%=1.6351"

Lusitano

Celtiberian,72.6
North_African,12.6
Armenia_LBA,9.2
Roman_Imperial_proxy,5.6


[1] "distance%=1.7272"

rxavierflima

Celtiberian,70.6
North_African,12.2
Roman_Imperial_proxy,9
Armenia_LBA,6.6
Visigothic,1.6


[1] "distance%=1.5772"

Gil_Vicente

Celtiberian,72.6
Armenia_LBA,9.2
Roman_Imperial_proxy,9
North_African,7.2
Visigothic,2

Patroas

[1] "distance%=1.7286"

MrsRuderico

Celtiberian,72
North_African,16
Roman_Imperial_proxy,6.6
Armenia_LBA,4.4
Visigothic,1


[1] "distance%=2.3763"

Trebaruna

Celtiberian,69.6
North_African,10.4
Visigothic,8.8
Roman_Imperial_proxy,8.2
Armenia_LBA,3


[1] "distance%=1.0306"

elisabetenjoaquim

Celtiberian,58.6
Visigothic,17.2
North_African,12.2
Roman_Imperial_proxy,8.4
Armenia_LBA,3.6



Edit: Espanha

[1] "distance%=0.9522"

Spanish_Castilla_Y_Leon

Celtiberian,74
North_African,11.2
Roman_Imperial_proxy,7
Armenia_LBA,5.4
Visigothic,2.4


[1] "distance%=1.5084"

Spanish_Galicia

Celtiberian,56.4
Visigothic,18.4
North_African,12.2
Roman_Imperial_proxy,12
Armenia_LBA,1


[1] "distance%=0.8777"

Spanish_Extremadura

Celtiberian,62.4
North_African,13
Roman_Imperial_proxy,10.2
Visigothic,9.6
Armenia_LBA,4.8


[1] "distance%=1.0123"

Spanish_Andalucia

Celtiberian,73.2
Roman_Imperial_proxy,10.8
North_African,8
Armenia_LBA,7
Visigothic,1


[1] "distance%=1.3576"

Spanish_Cantabria

Celtiberian,84
Roman_Imperial_proxy,6.4
North_African,5.4
Armenia_LBA,3
Visigothic,1.2


[1] "distance%=0.8204"

Spanish_Castilla_La_Mancha

Celtiberian,77.6
Roman_Imperial_proxy,10.4
North_African,6.2
Armenia_LBA,3
Visigothic,2.8


[1] "distance%=1.0973"

Spanish_Aragon

Celtiberian,79.6
North_African,7.2
Roman_Imperial_proxy,7
Armenia_LBA,3.2
Visigothic,3


[1] "distance%=1.4476"

Spanish_Pais_Vasco

Celtiberian,97.6
North_African,1.6
Armenia_LBA,0.8

Lusitano
06-23-2019, 04:44 PM
Essa média Portuguesa é meio estranha, não? É apenas coincidência acusarmos todos em média mais de 10% Celtiberian que a média nacional, mesmo sendo todos nós de reigões distintas?

Ruderico
06-23-2019, 04:58 PM
O modelo seguinte tem samples mais antigas, maioritariamente da idade do Bronze.
Substitui o Romano por Micénico, mudei o Arménio por uma referência ligeiramente mais antiga, substitui o Celtiberian por um Iberia_BA e Hallstatt (a única referência celta continental que temos, datada de 850-700BC), e finalmente mudei o germânico para uma referência nórdica também da idade do bronze (http://eurogenes.blogspot.com/2019/05/who-were-people-of-nordic-bronze-age.html). Nenhum de nós ficou com nada daquilo, no entanto algumas das raparigas ficaram com uma tonelada...se calhar tenho de usar outra referência? Como disse o germânico às vezes é errático e difícil de estimar..

Os modelos foram corridos nas mesmas condições dos anteriores.



[1] "distance%=0.9131"

Portuguese

Iberia_BA,28.4
Hallstatt_Bylany,24.6
North_African,14.8
Nordic_BA,14.4
Mycenaean,11.4
Armenia_MBA,6.4


[1] "distance%=1.559"

Ruderico

Hallstatt_Bylany,64.6
Iberia_BA,14.6
North_African,11.4
Mycenaean,7.4
Armenia_MBA,2


[1] "distance%=1.4671"

Lusitano

Hallstatt_Bylany,54
Iberia_BA,16
North_African,13.6
Mycenaean,10.2
Armenia_MBA,6.2


[1] "distance%=1.5156"

rxavierflima

Hallstatt_Bylany,53
Iberia_BA,18.2
North_African,13.4
Mycenaean,10.8
Armenia_MBA,4.6


[1] "distance%=1.3591"

Gil_Vicente

Hallstatt_Bylany,50.2
Iberia_BA,22
Armenia_MBA,10.2
Mycenaean,9
North_African,8.6


Ironicamente o Alentejano é quem tem menos North African de nós :lol:

Patroas:


[1] "distance%=1.4587"

MrsRuderico

Iberia_BA,36.2
Hallstatt_Bylany,20.4
North_African,16.6
Nordic_BA,14.4
Mycenaean,10.2
Armenia_MBA,2.2


[1] "distance%=2.1694"

Trebaruna

Iberia_BA,40.6
Nordic_BA,39.6
North_African,11
Mycenaean,6.4
Armenia_MBA,2.4


[1] "distance%=1.062"

elisabetenjoaquim

Hallstatt_Bylany,42.4
Iberia_BA,16.2
North_African,14.8
Nordic_BA,12.4
Mycenaean,8.8
Armenia_MBA,5.4

O Hallstatt da Trebaruna foi comido pelo Iberia e Nordic, não sei se isso quer dizer alguma coisa ou não



Regiões de Espanha, para comparação. Lembrem-se que cada região tem apenas 3/4 amostras e pode não ser verdadeiramente representativo. Tal como com a Trebaruna, o Hallstatt da Galiza foi comido pela Iberia+Nordic.


[1] "distance%=0.9043"

Spanish_Castilla_Y_Leon

Hallstatt_Bylany,47.2
Iberia_BA,21.4
North_African,14
Mycenaean,7.4
Nordic_BA,5.2
Armenia_MBA,4.8


[1] "distance%=1.1574"

Spanish_Galicia

Iberia_BA,44.4
Nordic_BA,27.2
North_African,13
Mycenaean,9.8
Armenia_MBA,5.6


[1] "distance%=0.8063"

Spanish_Extremadura

Iberia_BA,34
Hallstatt_Bylany,21.4
North_African,14.2
Nordic_BA,11.4
Mycenaean,10.2
Armenia_MBA,8.8


[1] "distance%=0.8129"

Spanish_Andalucia

Hallstatt_Bylany,31
Iberia_BA,29.8
Mycenaean,12.8
North_African,9.6
Armenia_MBA,8.4
Nordic_BA,8.4


[1] "distance%=1.2206"

Spanish_Cantabria

Iberia_BA,42.2
Hallstatt_Bylany,27.4
Nordic_BA,10
Mycenaean,9.6
North_African,6
Armenia_MBA,4.8


[1] "distance%=0.7339"

Spanish_Castilla_La_Mancha

Hallstatt_Bylany,39
Iberia_BA,32.2
Mycenaean,9.8
North_African,8
Armenia_MBA,6.2
Nordic_BA,4.8


[1] "distance%=0.9146"

Spanish_Aragon

Hallstatt_Bylany,37
Iberia_BA,34.8
Mycenaean,9.2
North_African,8.8
Nordic_BA,6
Armenia_MBA,4.2


[1] "distance%=1.1407"

Spanish_Pais_Vasco

Hallstatt_Bylany,50.8
Iberia_BA,46
North_African,1.8
Armenia_MBA,1.4


[1] "distance%=1.06"

Basque_Spanish

Iberia_BA,67.8
Hallstatt_Bylany,25.6
Nordic_BA,5.6
North_African,0.6
Armenia_MBA,0.4





Essa média Portuguesa é meio estranha, não? É apenas coincidência acusarmos todos em média mais de 10% Celtiberian que a média nacional, mesmo sendo todos nós de reigões distintas?

A média foi apenas calculada pelas 15 referências que o David tinha, vale o que vale. Mas opr outro lado não tem tantao variação pessoal e drift que cada um de nós tem, daí que eu diga que os Portugueses não são asism tão homogéneos quanto isso - eu tenho quase mais 20% celtiberian que a referência. No k7 do outro estudo pode ver-se resultados bastante diferentes dentro dos Portugueses: uns têm muito "verde", outros não..uns têm quase nada de "laranja", outros têm tanto quanto Espanha, etc. Deve ser esta variação que faz com que nós e a referência tenhamos resultados diferentes

Lusitano
06-23-2019, 05:07 PM
A média foi apenas calculada pelas 15 referências que o David tinha, vale o que vale. Mas opr outro lado não tem tantao variação pessoal e drift que cada um de nós tem, daí que eu diga que os Portugueses não são asism tão homogéneos quanto isso. No k7 do outro estudo pode ver-se resultados bastante diferentes dentro dos Portugueses: uns têm muito "verde", outros não..uns têm quase nada de "laranja", outros têm tanto quanto Espanha, etc. Deve ser esta variação que faz com que nós e a referência tenhamos resultados diferentes

Tendo em conta que existem muitas samples dos Açores e Madeira de forma desproporcional comparativamente com as do Continente nessas médias Portuguesas e à semelhança do que vejo no 23andMe e YTree, eu diria que ainda precisamos de bem mais samples.

Deixo aqui o G25 de um Açoreano. Podes ver se está mais próximo da média nacional do David?


,PC1,PC2,PC3,PC4,PC5,PC6,PC7,PC8,PC9,PC10,PC11,PC1 2,PC13,PC14,PC15,PC16,PC17,PC18,PC19,PC20,PC21,PC2 2,PC23,PC24,PC25
Azor_scaled,0.094473,0.15436,0.034695,-0.011628,0.043085,-0.006414,-0.0094,0.000692,0.016975,0.028247,0.002111,0.00644 4,-0.015758,-0.010322,0.003664,-0.009944,0.000652,-0.005448,-0.003142,-0.002626,0.003119,0.000124,-0.001849,-0.001205,-0.003233

,PC1,PC2,PC3,PC4,PC5,PC6,PC7,PC8,PC9,PC10,PC11,PC1 2,PC13,PC14,PC15,PC16,PC17,PC18,PC19,PC20,PC21,PC2 2,PC23,PC24,PC25
Azor,0.0083,0.0152,0.0092,-0.0036,0.014,-0.0023,-0.004,0.0003,0.0083,0.0155,0.0013,0.0043,-0.0106,-0.0075,0.0027,-0.0075,0.0005,-0.0043,-0.0025,-0.0021,0.0025,0.0001,-0.0015,-0.001,-0.0027

Ruderico
06-23-2019, 05:20 PM
Tendo em conta que existem muitas samples dos Açores e Madeira de forma desproporcional comparativamente com as do Continente nessas médias Portuguesas e à semelhança do que vejo no 23andMe e YTree, eu diria que ainda precisamos de bem mais samples.

Deixo aqui o G25 de um Açoreano. Podes ver se está mais próximo da média nacional do David?


,PC1,PC2,PC3,PC4,PC5,PC6,PC7,PC8,PC9,PC10,PC11,PC1 2,PC13,PC14,PC15,PC16,PC17,PC18,PC19,PC20,PC21,PC2 2,PC23,PC24,PC25
Azor_scaled,0.094473,0.15436,0.034695,-0.011628,0.043085,-0.006414,-0.0094,0.000692,0.016975,0.028247,0.002111,0.00644 4,-0.015758,-0.010322,0.003664,-0.009944,0.000652,-0.005448,-0.003142,-0.002626,0.003119,0.000124,-0.001849,-0.001205,-0.003233

,PC1,PC2,PC3,PC4,PC5,PC6,PC7,PC8,PC9,PC10,PC11,PC1 2,PC13,PC14,PC15,PC16,PC17,PC18,PC19,PC20,PC21,PC2 2,PC23,PC24,PC25
Azor,0.0083,0.0152,0.0092,-0.0036,0.014,-0.0023,-0.004,0.0003,0.0083,0.0155,0.0013,0.0043,-0.0106,-0.0075,0.0027,-0.0075,0.0005,-0.0043,-0.0025,-0.0021,0.0025,0.0001,-0.0015,-0.001,-0.0027

Ele está de facto um pouco a sul, talvez a malta das ilhas tenha uns pós de SSA extra que os atira um pouco para baixo, mas não há-de ser algo importante (digo eu). Aparentemente o Rui também tem, apesar de ser nortenho, e não plota ali. Há um Extremeño ainda mais abaixo, portanto ele não parece ser particularmente um outlier

https://i.postimg.cc/jx8tsyC0/azor.png

Gil Vicente
06-23-2019, 05:39 PM
Ironicamente eu faço parte da referência inicial do David, sou o PT2. Agora o que seria interessante era termos acesso aquela sample de Porto e Lisboa do estudo que o Ruderico postou.

Ruderico
06-23-2019, 05:51 PM
Ironicamente eu faço parte da referência inicial do David, sou o PT2. Agora o que seria interessante era termos acesso aquela sample de Porto e Lisboa do estudo que o Ruderico postou.

Engraçado, ficaste com coordenadas diferentes, não faço ideia porquê. As tuas plotagens noutros PCAs constumam ser coerentes? Eu costumo ter, estou sempre a norte/noroeste do cluster ibérico


Quanto às outras amostras, a única forma de as termos é pedindo a rawdata aos autores, duvido que eles as partilhem com amadores que não conhecem de lado nenhum. Olhando para o PCA do ancestry, parece que existe grande variação dentro de Portugal, tanto que o nosso cluster quase que tem um overlap total com Espanha, e eles são 5x mais que nós
https://www.ancestrycdn.com/dna/static/images/ethnicity/help/PCA.jpg

Lusitano
06-23-2019, 05:56 PM
Ele está de facto um pouco a sul, talvez a malta das ilhas tenha uns pós de SSA extra que os atira um pouco para baixo, mas não há-de ser algo importante (digo eu). Aparentemente o Rui também tem, apesar de ser nortenho, e não plota ali. Há um Extremeño ainda mais abaixo, portanto ele não parece ser particularmente um outlier

Por acaso nem referia-me ao SSA no caso dos Açores mas sim por algumas das ilhas terem hotspots de herança genética Francesa.

Gil Vicente
06-23-2019, 06:03 PM
Engraçado, ficaste com coordenadas diferentes, não faço ideia porquê. As tuas plotagens noutros PCAs constumam ser coerentes? Eu costumo ter, estou sempre a norte/noroeste do cluster ibérico

Penso que sim. Mas também 1/15 da sample tem pouco peso.
Se bem que no k13 tenho distância de 2.48. Já no k15 nem tanto, tenho 4.27.


Quanto às outras amostras, a única forma de as termos é pedindo a rawdata aos autores, duvido que eles as partilhem com amadores que não conhecem de lado nenhum. Olhando para o PCA do ancestry, parece que existe grande variação dentro de Portugal, tanto que o nosos cluster quase que tem um overlap total com Espanha, e eles são 5x mais que nós
https://www.ancestrycdn.com/dna/static/images/ethnicity/help/PCA.jpg

Pois. Só se houvesse um "projecto Portugal". Eu pensei que estas samples fossem públicas, como é que users de forums fazem plots com todas aquelas populações?

Ruderico
06-23-2019, 06:09 PM
Por acaso nem referia-me ao SSA no caso dos Açores mas sim por algumas das ilhas terem hotspots de herança genética Francesa.

É difícil de ver no g25, também se diz que houve colonização de Franceses do Sul na região de Castelo Branco, por causa de expressões/palavras/dialectos, mas até agora não consigo ver se isso aconteceu ou não. O calculador moderno do Tolan dá um pouco disso à minha namorada (de Idanha) mas é daquelas coisas que pode variar de pessoa para pessoa.
Os modelos anteriores não foram feitos para Franceses, mas há uma grande parcela germânica neles que o Azor não aparenta ter


[1] "distance%=1.1234"

Azor

Celtiberian,63.2
Roman_Imperial_proxy,25.4
North_African,8
Armenia_LBA,3.4

[1] "distance%=1.3064"

French

Celtiberian,56.4
Visigothic,33.4
Armenia_LBA,8.6
Roman_Imperial_proxy,1.2
North_African,0.4




[1] "distance%=1.1238"

Azor

Celtiberian,63
Roman_Imperial_proxy,25.2
North_African,8.6
Armenia_LBA,3.2

[1] "distance%=1.1611"

French

Celtiberian,53
Suebi_proxy,32.6
Armenia_LBA,8.4
Roman_Imperial_proxy,4.8
North_African,1.2



[1] "distance%=1.1149"

Azor

Hallstatt_Bylany,36.2
Mycenaean,20.8
Iberia_BA,18.8
North_African,11
Armenia_MBA,9.4
Nordic_BA,3.8

[1] "distance%=1.2034"

French

Hallstatt_Bylany,34.2
Nordic_BA,33.8
Iberia_BA,12.4
Mycenaean,7.8
Armenia_MBA,7.6
North_African,4.2





Penso que sim. Mas também 1/15 da sample tem pouco peso.
Se bem que no k13 tenho distância de 2.48. Já no k15 nem tanto, tenho 4.27.



Pois. Só se houvesse um "projecto Portugal". Eu pensei que estas samples fossem públicas, como é que users de forums fazem plots com todas aquelas populações?
Se calhar não faz muita diferença? O K15 dá sempre piores distâncias a Portugal, mas não quer dizer que seja pior, cada um é como é..como podes ver no g25 eu não esotu particularmente perto da referência, no K15 tenho uma distância de 9 e tal.

Podemos sempre pedir a rawdata num email aos autores, pode ser que sejam simpáticos, também não se perde nada em tentar

Lusitano
06-23-2019, 06:22 PM
Mesmo que vos cedessem o raw data de 50 Portugueses de que adianta? A 12 dólares cada um é só fazer as contas :lol:

Ruderico
06-23-2019, 06:25 PM
Mesmo que vos cedessem o raw data de 50 Portugueses de que adianta? A 12 dólares cada um é só fazer as contas :lol:

O David se calhar fazia isso á borla, ele quer sempre mais amostras académicas para a datasheet dele. Há uma semanas fiquei com a ideia que se lhe arranjasse amostras Espanholas ele as convertia para o G25 de bom grado. Pessoalmente até preferia Espanhois a Portugueses, cada região de Espanha ter só 3 ou 4 amostras é quase absurdo. Em Portugal sempre temos as 15 de base mais as nossas, já é qualquer coisa

Lusitano
06-23-2019, 06:27 PM
O David se calhar fazia isso á borla, ele quer sempre mais amostras académicas para a datasheet dele. Há uma semanas fiquei com a ideia que se lhe arranjasse amostras Espanholas ele as convertia para o G25 de bom grado. Pessoalmente até preferia Espanhois a Portugueses, cada região de Espanha ter só 3 ou 4 amostras é quase absurdo. Em Portugal sempre temos as 15 de base mais as nossas, já é qualquer coisa

Não podemos pedir para ele adicionar as nossas e as que já foram sendo postadas aqui? Se é que ele já não as adicionou, mas pelo menos quando eu fiz as minhas e as da minha namorada ele não perguntou a nossa origem.

Gil Vicente
06-23-2019, 06:33 PM
Eu por mim gostava de ver samples regionais. Nem que fosse Continente + Ilhas, ou Norte, Centro e Sul. Mas o ideal seria assim + ilhas:

https://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/5/55/Provincias_Portugal_legenda.png

Ruderico
06-23-2019, 06:35 PM
Não podemos pedir para ele adicionar as nossas e as que já foram sendo postadas aqui? Se é que ele já não as adicionou, mas pelo menos quando eu fiz as minhas e as da minha namorada ele não perguntou a nossa origem.

Não faço ideia, é uma questão de pedir. Mas também podemos recalcular a nova referência, é uma questão de ter pachorra para fazer isso no excel, não custa muito, mas também não vejo grande benefício. Uma referência pode não significar muito, porque teoricamente ninguém há-de ser exactamente igual a ela. Por vezes o mais interessante são os outliers, não quem tem resultados "medianos"


Eu por mim gostava de ver samples regionais. Nem que fosse Continente + Ilhas, ou Norte, Centro e Sul. Mas o ideal seria assim + ilhas:

https://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/5/55/Provincias_Portugal_legenda.png

Eu continuo a achar que o mais interessante é separar o norte (a norte da serra da Estela) em litoral e interior. Para mim o problema do outro estudo foi só incidir em Lisboa e Porto, esquecendo Bragança, Viseu ou Vila Real. Grandes cidades costeiras são exactamente onde se esperaria que houvesse muitas semelhanças, é nas mais pequenas e isoladas que podem haver diferenças

Lusitano
06-23-2019, 06:49 PM
https://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/7/71/Comunidades_intermunicipais.png

A dividir o país por regiões, eu penso que assim seria mais preciso. Eu sou da Beira-Baixa mas se virmos bem, da Sertã até à Idanha (terra da Sra. Ruderico) são mais de 100 km. Pode não parecer muito mas há uns duzentos anos atrás seriam vários dias de viagem e as populações do interior não eram muito intenerantes (a minha bisavó só viu o mar pela primeira vez na década de 70 ou 80).

Neste mapa que eu postei, eu tanto eu como a minha namorada somos oriundos da região do Médio Tejo.

Ruderico
06-23-2019, 06:58 PM
O problema é que para esse tipo de divisão íamos precisar de pelo menos 100 amostras e isso não é algo que se consiga tão cedo. Eu nesse aspecto seria uma mistura, porque a minha família paterna é toda de Lafões, mas a materna é do Tâmega, Douro e AMPorto (provavelmente a freguesia mais remota de toda a região, a Lomba) e isso inviabilizaria alguém como eu de ser usado. Tal como eu, muitos outros o seríam, portanto era estar a dificultar algo que já é complicado à partida.

Se for algo que queiramos fazer, mais vale irmos devagar e fazer divisões em regiões grandes para ser mais inclusivo, e só depois partir para algo mais micro

rxavierflima
06-23-2019, 08:38 PM
Eu estou a isto de dar os meus irmãos um teste para saber se se confirma o que suspeito -> que isto é mais variação pessoal do que outra coisa.

Ruderico
06-23-2019, 10:22 PM
Eu acho que geralmente é esse o caso, ainda que possam haver algumas tendências regionais menos significativas

Ruderico
06-25-2019, 03:14 PM
Para vermos como as plotagens mudam consoante o dataset usado, fiz um plot novo apenas com referências Europeias (e médias, em vez de todas as disponíveis).
O segundo - aquele que uso sempre - tem todas as amostras individuais do Ocidente da Eurásia. Alguns mudam um pouco, porque as referências não Europeias acabam por ser mais relevantes do que para outros




https://i.postimg.cc/SqLsnFcN/g25europe.png


https://i.postimg.cc/Mw9X7d1w/magovalle.png

Lusitano
07-02-2019, 09:01 AM
https://i.imgur.com/PbvoLxx.png

Ruderico
07-02-2019, 09:07 AM
Está mais ou menos onde o K13 o meteu, não está? Se quiseres envia/posta as coordenadas que eu o meto no meu PCA standard

Lusitano
07-02-2019, 09:13 AM
Está mais ou menos onde o K13 o meteu, não está? Se quiseres envia/posta as coordenadas que eu o meto no meu PCA standard

Segue a minha tendência e está um pouco mais a Leste da referência nacional. Já no K13 tinha uns resultados meio incomuns a puxar para os Eslavos.

Admix Results (sorted):

# Population Percent
1 North_Atlantic 35.7
2 West_Med 24.57
3 East_Med 15.64
4 Baltic 15.45
5 Northeast_African 2.51
6 Red_Sea 1.8
7 Oceanian 1.04
8 Sub-Saharan 0.96
9 Siberian 0.79
10 West_Asian 0.58
11 South_Asian 0.58
12 Amerindian 0.38

Single Population Sharing:

# Population (source) Distance
1 Portuguese 5.25
2 Spanish_Galicia 6.28
3 Spanish_Castilla_Y_Leon 6.92
4 Spanish_Cataluna 7.06
5 Spanish_Extremadura 7.26
6 Spanish_Valencia 7.28
7 Spanish_Murcia 7.34
8 North_Italian 8.64
9 Spanish_Andalucia 8.87
10 Spanish_Castilla_La_Mancha 8.91
11 Spanish_Cantabria 9.25
12 French 10.24
13 Southwest_French 10.46
14 Spanish_Aragon 11.37
15 Tuscan 14.17
16 West_German 15.19
17 South_Dutch 15.5
18 Serbian 17.17
19 Romanian 17.44
20 Austrian 18.14

Mixed Mode Population Sharing:

# Primary Population (source) Secondary Population (source) Distance
1 90.5% Portuguese + 9.5% Southwest_Russian @ 3.82
2 86.5% Portuguese + 13.5% Croatian @ 3.84
3 91.8% Portuguese + 8.2% Erzya @ 3.86
4 89.3% Portuguese + 10.7% Ukrainian @ 3.86
5 86.3% Portuguese + 13.7% Moldavian @ 3.86
6 90.8% Portuguese + 9.2% Estonian_Polish @ 3.86
7 82.5% Portuguese + 17.5% Serbian @ 3.87
8 91% Portuguese + 9% Belorussian @ 3.91
9 91.4% Portuguese + 8.6% Kargopol_Russian @ 3.92
10 91% Portuguese + 9% Ukrainian_Belgorod @ 3.95
11 92.1% Portuguese + 7.9% Lithuanian @ 3.98
12 89.4% Portuguese + 10.6% Ukrainian_Lviv @ 3.99
13 84.4% Portuguese + 15.6% Bulgarian @ 3.99
14 91.1% Portuguese + 8.9% Russian_Smolensk @ 3.99
15 83.3% Portuguese + 16.7% Romanian @ 4
16 89.3% Portuguese + 10.7% South_Polish @ 4
17 90.5% Portuguese + 9.5% Polish @ 4.06
18 92.1% Portuguese + 7.9% East_Finnish @ 4.09
19 73.5% Spanish_Valencia + 26.5% Serbian @ 4.1
20 85.6% Portuguese + 14.4% Hungarian @ 4.11


Coordenadas G25:


,PC1,PC2,PC3,PC4,PC5,PC6,PC7,PC8,PC9,PC10,PC11,PC1 2,PC13,PC14,PC15,PC16,PC17,PC18,PC19,PC20,PC21,PC2 2,PC23,PC24,PC25
Pai_Lusitano_scaled,0.101303,0.139128,0.034695,0.0 05491,0.035391,-0.004462,-0.0094,0.006692,0.022293,0.021868,-0.000162,0.01079,-0.010704,-0.019267,0.00095,0.004641,0.001304,0.002027,-0.002011,-0.008629,0.002745,0.003091,-0.000739,-0.000843,0.000599

,PC1,PC2,PC3,PC4,PC5,PC6,PC7,PC8,PC9,PC10,PC11,PC1 2,PC13,PC14,PC15,PC16,PC17,PC18,PC19,PC20,PC21,PC2 2,PC23,PC24,PC25
Pai_Lusitano,0.0089,0.0137,0.0092,0.0017,0.0115,-0.0016,-0.004,0.0029,0.0109,0.012,-0.0001,0.0072,-0.0072,-0.014,0.0007,0.0035,0.001,0.0016,-0.0016,-0.0069,0.0022,0.0025,-0.0006,-0.0007,0.0005

Ruderico
07-02-2019, 09:23 AM
Sim, está onde se esperava, mesmo ao lado do Rui

West Eurasian - plot total aqui (https://i.postimg.cc/8THRqW0F/g25weurasiafull.png)
https://i.postimg.cc/4s2L96B6/lusitano-pai.png


European averages - plot total aqui (https://i.postimg.cc/92pG0GmJ/g25europeaveragefull.png)
https://i.postimg.cc/LRNvckdc/lusitano-pai-europe.png

Lusitano
07-02-2019, 09:31 AM
O Rui é de que região?

Ruderico
07-02-2019, 09:40 AM
O Rui é de que região?

É o Pedro Rúben do TA, a família dele é de Amarante. Novamente parece não interessar muito se alguém é do norte centro ou sul

Lusitano
07-02-2019, 09:43 AM
É o Pedro Rúben do TA, a família dele é de Amarante. Novamente parece não interessar muito se alguém é do norte centro ou sul

Podes correr aquele teste dos Visigodos e Suevos? Ou então mete aqui a data se quiseres para eu não ter de estar sempre a chatear-te.

Ruderico
07-02-2019, 09:58 AM
Podes correr aquele teste dos Visigodos e Suevos? Ou então mete aqui a data se quiseres para eu não ter de estar sempre a chatear-te.

Claro que sim.

"Suebi", feito com averages, penalidade standard:

[1] "distance%=1.6971"

Pai_Lusitano

Celtiberian,59.6
Roman_Imperial_proxy,18.2
Suebi_proxy,12.2
North_African,5.8
Armenia_LBA,4.2


[1] "distance%=0.9464"

Portuguese

Celtiberian,61.8
North_African,12.6
Roman_Imperial_proxy,11.2
Suebi_proxy,10.6
Armenia_LBA,3.8




Com Visigodos, feito com averages, penalidade standard:

[1] "distance%=1.6918"

Pai_Lusitano

Celtiberian,59.2
Roman_Imperial_proxy,16.4
Visigothic,14.6
North_African,5.4
Armenia_LBA,4.4


[1] "distance%=0.9916"

Portuguese

Celtiberian,63.8
North_African,12.6
Roman_Imperial_proxy,9.8
Visigothic,9
Armenia_LBA,4.8

Lusitano
07-02-2019, 10:04 AM
Não percebo como é que o meu pai pontua Suevo e Visigodo acima da média nacional e eu nicles.

Ruderico
07-02-2019, 10:07 AM
Não percebo como é que o meu pai pontua Suevo e Visigodo acima da média nacional e eu nicles.

Ya, daí que eu diga que as componentes germanicas sejam bizarras e difíceis de estimar, às vezes são comidas por outras, às vezes é o contrário e aparecem sobreestimadas (presumivelmente). Por outro lado, tendo em conta onde ele plota, até faz sentido


O melhor para saber se temos disso ou não deve ser o Celtic VS Germanic do David. Eu fiz, e fiquei no local mais bizarro de sempre (https://i.postimg.cc/Pqbv3nQ6/Ruderico-celt-germ.png), ainda que seja coerente com os meus resultados

Lusitano
07-02-2019, 10:14 AM
Como é que é suposto interpretar esse PCA? Quem estiver à esquerda da média Francesa é mais Germánico e quem estiver à direita é mais Celta?

Ruderico
07-02-2019, 10:20 AM
É difícil de dizer para nós, porque foi feito essencialmente para Europeus do Noroeste, mas basicamente quem está para a esquerda claramente tem mais Germânico do que quem está para a direita. O meu caso é muito extremo, se tiver alguma coisa de Germânico deve ser muito abaixo da média. Por outro lado, tal como no G25, também tenho pouco em comum com a Itália (e por extensão o resto do Mediterrâneo).

Metendo mais as referências Ibéricas do Olalde tens isto (https://i.postimg.cc/hKQ3qPnX/cvg.png). Se vires só os Ibéricos no PCA o resultado é este (https://i.postimg.cc/0xL5CcNk/cvg-sw-euro-pca.png). Aqui (https://i.postimg.cc/RMq2yxPj/cvg-sw-euro-lda.png) é o LDA (em vez de PCA) das mesmas referências - o LDA tenta agrupar amostras iguais na mesma zona, daí que os clusters aparecam mais redondos.
Eu tenho a sorte de, apesar de ter resultados pouco comuns para Portugal, são sempre muito consensuais em todas as análises. Se te interessas por ascendência germânica aconselho, mas muito provavelmente não vais ter grandes surpresas. Não sei se é dinheiro bem gasto. Eu só fiz para mim, para a patroa não.

Lusitano
07-02-2019, 10:28 AM
Acho que esse teste não vale a pena para nós então. Exceptuando algumas regiões da península, seremos sempre mais celta.

Ruderico
07-02-2019, 11:20 AM
Acho que esse teste não vale a pena para nós então. Exceptuando algumas regiões da península, seremos sempre mais celta.

Acho que quem tiver resultados muito pouco comuns no que diz respeito a suposta ascendência "germânica" pode beneficiar dele, daí que eu tenha pago o meu, mas não o da namorada que deveria ser um desperdício de dinheiro. Para a maioria de nós não deve servir de nada.
Por outro lado repara que os próprios Ibéricos da Idade do Ferro (incluíndo Celtiberos) estão ou muito virados para França, ou muito para o meu lado, apesar de não serem germânicos. Para tornar tudo mais confuso o Celtibero que está mais a "norte", e mais afastado de França - mais próximo de mim aqui (https://i.postimg.cc/RMq2yxPj/cvg-sw-euro-lda.png) - é também o que tem mais Steppe dos três

rxavierflima
07-02-2019, 08:00 PM
Eu sinceramente ainda não cheguei a nenhuma conclusão que me permita dizer num jantar de família quem na mesa é "o mais português" ou "o mais nórdico" ou "o mais médio-oriental". Na maior parte dos PCAs a família da minha mulher (Pombal e Peniche) tende mais para fora de Portugal em direcção à França, o que, presumo eu, quer dizer que têm mais componente germânica. Mas no celtic vs germanic não é bem assim:

31410

Mais vale voltar daqui a 10 anos quando tudo isto estiver mais maduro.

Lusitano
07-02-2019, 08:44 PM
Eu sinceramente ainda não cheguei a nenhuma conclusão que me permita dizer num jantar de família quem na mesa é "o mais português" ou "o mais nórdico" ou "o mais médio-oriental". Na maior parte dos PCAs a família da minha mulher (Pombal e Peniche) tende mais para fora de Portugal em direcção à França, o que, presumo eu, quer dizer que têm mais componente germânica. Mas no celtic vs germanic não é bem assim:

31410

Mais vale voltar daqui a 10 anos quando tudo isto estiver mais maduro.

Eu interpreto esse PCA desta forma:

Quem estiver a puxar em direcção à média Francesa é provavelmente mais celta e\ou tendencialmente mais germânico e terá provavelmente WHG acima da média;

Quem estiver a puxar em direcção aos Bascos tem mais afinidade genética com os povos ibéricos pré-romanos não indo-europeus;

Quem estiver a puxar em direcção ao Norte de Itália é provavelmente mais germânico e\ou celta e terá um pouco mais de Early European Farmer ou East Med\West Asian que a média Ibérica;

Quem estiver mais próximo das médias Portuguesas\Espanholas é um misto mais equilibrado de todas as compenentes que referi anteriormente.

Ruderico
07-02-2019, 09:01 PM
Eu interpreto esse PCA desta forma:

Quem estiver a puxar em direcção à média Francesa é provavelmente mais celta e\ou tendencialmente mais germânico e terá provavelmente WHG acima da média;

Quem estiver a puxar em direcção aos Bascos tem mais afinidade genética com os povos ibéricos pré-romanos não indo-europeus;

Quem estiver a puxar em direcção ao Norte de Itália é provavelmente mais germânico e\ou celta e terá um pouco mais de Early European Farmer ou East Med\West Asian que a média Ibérica;

Quem estiver mais próximo das médias Portuguesas\Espanholas é um misto mais equilibrado de todas as compenentes que referi anteriormente.

Eu vejo mais ou menos dessa forma também, mas há sempre o caso daquela malta da Idade do Ferro estar tanto mais próxima dos Franceses como mais longe, sem que nenhum deles seja germânico. O problema aqui é ADN em comum, ou muito semelhante, com origem no centro da Europa que já cá existia bem antes de qualquer germânico aqui meter os pés. O que é comum neles é estarem mais afastados dos Italianos, isso parece-me um claro sinal da fraca ligação desses nossos antepassados aos povos do Mediterrâneo Centro/Leste (a tal tendência pseudo-Basca/Atlantica/etc)

Lusitano
07-02-2019, 09:19 PM
Eu vejo mais ou menos dessa forma também, mas há sempre o caso daquela malta da Idade do Ferro estar tanto mais próxima dos Franceses como mais longe, sem que nenhum deles seja germânico. O problema aqui é ADN em comum, ou muito semelhante, com origem no centro da Europa que já cá existia bem antes de qualquer germânico aqui meter os pés. O que é comum neles é estarem mais afastados dos Italianos, isso parece-me um claro sinal da fraca ligação desses nossos antepassados aos povos do Mediterrâneo Centro/Leste (a tal tendência pseudo-Basca/Atlantica/etc)

E há sempre outros factores envolvidos, como ter mais ou menos Iberomaurussian, ter mais ou menos Steppe e outras tantas componentes que afectam a posição no PCA. Já para não dizer que os ditos povos Germânicos que andaram por aqui não eram homogéneos entre si e provávelmente pouco se assemelham aos Germânicos modernos.

rxavierflima
07-03-2019, 07:00 AM
Eu interpreto esse PCA desta forma:

Quem estiver a puxar em direcção à média Francesa é provavelmente mais celta e\ou tendencialmente mais germânico e terá provavelmente WHG acima da média;

Quem estiver a puxar em direcção aos Bascos tem mais afinidade genética com os povos ibéricos pré-romanos não indo-europeus;

Quem estiver a puxar em direcção ao Norte de Itália é provavelmente mais germânico e\ou celta e terá um pouco mais de Early European Farmer ou East Med\West Asian que a média Ibérica;

Quem estiver mais próximo das médias Portuguesas\Espanholas é um misto mais equilibrado de todas as compenentes que referi anteriormente.

Não sei se estes dados estão desatualizados ou não mas daqui não concluo que os franceses têm uma componente WGH particularmente alta nem que os bascos têm uma componente yamnaya particularmente baixa...

31418

31419

Lusitano
07-03-2019, 07:35 AM
Não precisa de ser elevado para puxar para o lado Francês, como podes ver entre os Espanhóis WHG é praticamente não existente. Alto WHG e baixo ANE normalmente é uma "assinatura" dos bascos.

Ruderico
07-03-2019, 09:32 AM
O estudo do Haak2015 foi revolucionário, mas em 2019 está um pouco desactualizado porque entretanto "decifraram-se" melhor as componentes..em 2015 usava-se a teoria do triângulo no que dizia respeito à ascendência Europeia (WHG, Yamnaya, EEF) hoje sabe-se que houve mais grupos responsáveis, não apenas três, e mesmo cada um destes poderia ter o seu drift específico consoante a região. Lembrem-se que duas populações isoladas uma da outra por alguns milhares de anos começam a divergir, para além de migrações de certos grupos criarem founder effects, etc. Por exemplo os Bascos não têm mais Steppe/Yamnaya que os restantes Ibéricos, têm menos, isso apesar de nós termos mais umas camadas de ascendência com pouca/nenhuma Steppe que eles não têm, por exemplo o Norte Africano. Os Italianos da Toscana também não têm mais que nós. Os Bascos são basicamente Ibéricos da Idade do Bronze com uma subsequente camada Indo-Europeia menor que a nossa, o que os torna muito semelhantes a algumas das amostras da Idade do Ferro que vimos no estudo do Olalde2019.

Pessoalmente não gosto muito de pensar em componentes tão ancestrais, para mim são tão antigas que acabam por me parecer quase abstractas, daí que todos os meus modelos sejam bem mais recentes. Também não ajuda que as amostras mais antigas tenham mais ruído, e que os modelos sejam ainda menos fiáveis.


Quanto ao CvG, acho que as conclusões que tiramos dele (relativamente aos Ibéricos) são semelhantes à que se tira do plot regular do G25, mas o CvG foi desenhado para apanhar drift recente específico de grupos germânicos, daí que as amostras inquestionavelmente germânicas da Idade do Ferro e do início da Idade Média fiquem plotadas no extremo esquerdo. Isto só demonstra o quão difícil ainda é distinguir ascendência Celta de Germânica com as ferramentas amadoras que hoje temos (aliás, foi essa a razão pela qual o David fez o CvG) - as suas origens ancestrais não são muito diferentes. Os modelos do G25 com germânicos a aparecerem ou não é um bom exemplo disso. Este PCA não foi feito para nós, foi feito para Europeus do Noroeste/Centro que claramente têm ascendência tanto Celta como Germânica em maiores quantidades que nós..nós fomos incluídos para "esticar" o plot e ajudar a ver melhor quem plotava mais ou menos para a esquerda. Isso não quer dizer que seja totalmente inútil para nós, mas acredito que possa ser enganador para Portugueses/Espanhóis que tenham resultados "regulares" nos outros PCAs. O meu caso em particular parece relativamente consensual (razão pela qual eu fiquei satisfeito com ele), já o do Xavier e a família dele não são. Deve haver casos que vão ser o oposto do meu - pessoas que no G25 plotem muito a "nordeste" no cluster Ibérico que aqui acabem por ficar muito em cima de Franceses, porque claramente partilham mais ADN com eles do que a maioria de nós, e ainda mais do que eu partilho.
Por outro lado, num caso hipotético, se uma pessoa tiver herança de cruzados/cavaleiros Ingleses/Franceses/etc da Reconquista e ninguém saiba, não seria de estranhar que também fossem plotar para a esquerda. Aí poderíamos pensar que teria simplesmente mais antepassados Suevos/Visigodos, mas a realidade não seria essa. Como distinguimos? Com o G25 acho que não dá, nesse caso o melhor talvez seja procurar matches com segmentos de ADN em comum com estrangeiros (em especial os segmentos de maior dimensão) e tentar tirar conclusões, mas ainda há muito caminho a percorrer.

Ainda há arestas a limar na nossa história, por exemplo saber se o norte Africano chegou no período Romano ou um pouco antes, ou se os Suevos tiveram muito impacto ou não, mas grosso modo não creio que vão haver mudanças drásticas naquilo que hoje sabemos. Já os casos pessoais podem ser diferentes e mais interessantes devido a repopulações e migrantes oriundos de França ou da Cochinchina em épocas mais recentes

Lusitano
07-03-2019, 11:49 AM
Apesar de ser uma calculadora de 2014 eu continuo a usar a Eurogenes ANE K7 no caso dos Portugueses para perceber se um individuo é mais "Basco" ou não. Quem tiver WHG-UHG entre os 55%-65% por norma sai um pouco da média Portuguesa e aproxima-se mais do País Basco, Cantabria, Aragão, etc.

rxavierflima
07-05-2019, 08:00 PM
Não percebo como é que o meu pai pontua Suevo e Visigodo acima da média nacional e eu nicles.

Pior estou eu com o myOrigins do FTDNA lol

https://anthrogenica.com/attachment.php?attachmentid=27036&d=1541891839

Já agora, mais alguém fez o teste com o FTDNA e obteve absurdos destes?

Lusitano
07-05-2019, 09:32 PM
Nunca cheguei a testar com o FTDNA, só transferi o raw data do 23andMe para o FTDNA há uns dois anos atrás por 20 dólares para ver os resultados do teste de autossomos deles. Nem conhecia esse MyOrigins.

A minha raw data é V4 e a do meu pai é V5, talvez esse seja o principal motivo. O 23andMe diz que eu partilho cerca de 49% dos genomas do meu pai depois de ter faseado os dados dos dois, por isso é virtualmente impossível qualquer tipo de diferença significativa entre nós.

Nos PCAs pelo menos o meu pai segue sempre a mesma tendência que eu e costuma estar no mesmo eixo, apenas um pouco mais afastado.

Ruderico
07-05-2019, 09:43 PM
Acho que o problema é mais dos modelos que da rawdata :) distinguir o germânico do resto é complicado com estas ferramentas, há sempre quem queira saber o quão "germânico" ou "nórdico" é

rxavierflima
07-06-2019, 11:14 AM
Nunca cheguei a testar com o FTDNA, só transferi o raw data do 23andMe para o FTDNA há uns dois anos atrás por 20 dólares para ver os resultados do teste de autossomos deles. Nem conhecia esse MyOrigins.

O myOrigins é exactamente a plataforma do FTDNA que permite ver a composição étnica do teste autossomal (Family Finder).



O 23andMe diz que eu partilho cerca de 49% dos genomas do meu pai depois de ter faseado os dados dos dois, por isso é virtualmente impossível qualquer tipo de diferença significativa entre nós.

Não sei se é assim tão impossível. É isso que quero verificar ao testar os meus 2 irmãos. O mais fácil e barato seria mandar vir mais 2 testes do FTDNA, já que foi com o FTDNA que me testei. Mas não sei se não seria melhor mandar vir 3 do 23&Me. Parece-me que o FTDNA está a ficar pra trás.

Hyoga7
07-06-2019, 03:43 PM
Pior estou eu com o myOrigins do FTDNA lol

https://anthrogenica.com/attachment.php?attachmentid=27036&d=1541891839

Já agora, mais alguém fez o teste com o FTDNA e obteve absurdos destes?


Aqui vai o meu:

31476

Lusitano
07-06-2019, 07:03 PM
O myOrigins é exactamente a plataforma do FTDNA que permite ver a composição étnica do teste autossomal (Family Finder).

Ah sim, como meteste esse gráfico nem associei para dizer a verdade, pensava que era uma funcionalidade nova qualquer do FTDNA que não havia quando eu fiz o meu.

Lusitano
07-06-2019, 11:17 PM
Mais umas coordenadas:


,PC1,PC2,PC3,PC4,PC5,PC6,PC7,PC8,PC9,PC10,PC11,PC1 2,PC13,PC14,PC15,PC16,PC17,PC18,PC19,PC20,PC21,PC2 2,PC23,PC24,PC25
Defski_scaled,0.110408,0.144205,0.036204,-0.000323,0.037545,0.000279,0.000705,-0.000923,0.023725,0.033531,-0.005846,0.001349,-0.006095,-0.023121,0.0038,0.00769,0.000782,0.00228,-0.009553,-0.004127,0.002995,-0.007543,-0.000986,-0.008073,-0.002634

,PC1,PC2,PC3,PC4,PC5,PC6,PC7,PC8,PC9,PC10,PC11,PC1 2,PC13,PC14,PC15,PC16,PC17,PC18,PC19,PC20,PC21,PC2 2,PC23,PC24,PC25
Defski,0.0097,0.0142,0.0096,-0.0001,0.0122,0.0001,0.0003,-0.0004,0.0116,0.0184,-0.0036,0.0009,-0.0041,-0.0168,0.0028,0.0058,0.0006,0.0018,-0.0076,-0.0033,0.0024,-0.0061,-0.0008,-0.0067,-0.0022

Toda a família é originária de Belmonte/Cabeço das Fráguas.

Ruderico
07-06-2019, 11:38 PM
https://i.postimg.cc/vYyCKq2g/defski.png

Um pouco a sul da referência nacional, nem muito para ocidente nem oriente. É engraçado como a maioria das pessoas que fomos acrescentando não plotam muito perto de onde bastantes das referências do G25 estão

Hyoga7
07-08-2019, 09:29 AM
Ah sim, como meteste esse gráfico nem associei para dizer a verdade, pensava que era uma funcionalidade nova qualquer do FTDNA que não havia quando eu fiz o meu.

Eu fiz no Geno 2.0 e depois paguei 39 USD para fazer a transferência para a FTDNA. Se calhar agora não tinha pago esse dinheiro todo (deve ter rondado os 180 euros) e tinha só feito o 23andMe.

31490

Hyoga7
07-08-2019, 09:33 AM
Já agora, fica aqui o Ancient Origins da FTDNA:

31491

Lusitano
07-08-2019, 01:02 PM
[IMi.png[/IMG]

Um pouco a sul da referência nacional, nem muito para ocidente nem oriente. É engraçado como a maioria das pessoas que fomos acrescentando não plotam muito perto de onde bastantes das referências do G25 estão

A requisição da praxe: podes correr com Celtibéricos\Suevos\Visigodos?

Ruderico
07-08-2019, 01:47 PM
A requisição da praxe: podes correr com Celtibéricos\Suevos\Visigodos?

Claro, aqui vai

[1] "distance%=1.7533"

Defski

Celtiberian,71.4
Guanche_Canary_Islands,14
Roman_Imperial_proxy,11.6
Visigothic,3

[1] "distance%=0.9916"

Portuguese

Celtiberian,63.8
North_African,12.6
Roman_Imperial_proxy,9.8
Visigothic,9
Armenia_LBA,4.8




[1] "distance%=1.8148"

Defski

Celtiberian,70.4
North_African,14.4
Roman_Imperial_proxy,8.2
Armenia_LBA,4.6
Suebi_proxy,2.4

[1] "distance%=0.9464"

Portuguese

Celtiberian,61.8
North_African,12.6
Roman_Imperial_proxy,11.2
Suebi_proxy,10.6
Armenia_LBA,3.8

rxavierflima
07-12-2019, 12:02 PM
Apesar de ser uma calculadora de 2014 eu continuo a usar a Eurogenes ANE K7 no caso dos Portugueses para perceber se um individuo é mais "Basco" ou não. Quem tiver WHG-UHG entre os 55%-65% por norma sai um pouco da média Portuguesa e aproxima-se mais do País Basco, Cantabria, Aragão, etc.

Já viste esta (https://anthrogenica.com/showthread.php?16255-G25-calculator-of-ancient-basic-components-(for-fun))?

Aqui estou eu:

EEF = 53.6
STEPPE = 32
WHG = 9.4
AFRICA-NORTHWEST = 5

O FTDNA tenta fazer uma calculadora deste género com o AncentOrigins mas falha miseravelmente. Basicamente, trocam os valores de Hunter-Gatherers (WHG) com os de Metal Age Invaders (Steppe):

Metal Age Invader = 10%
Farmer = 57%
Hunter-Gatherer = 33%
non-European = 0%

:noidea:

Ruderico
11-19-2019, 12:13 PM
Decidi meter aqui todos os mapas de distâncias regionais do G25 feitas pelo Ph2ter. Acho que é uma boa forma de visualizar os dados e variação de cada um.

Segundo percebi o vermelho mais escuro é a região mais próxima, a intensidade das restantes depende do quão afastadas desse máximo cada um está. Isto significa que quem tem a maioria da península a vermelho tem resultados Ibéricos mais genéricos, enquanto que quem tem zonas muito a vermelho e outras bastante mais claras apresenta um resultado mais regional. Pelo menos é assim que interpreto.




https://i.imgur.com/QBsvcA8.png

https://i.imgur.com/UkxJjEH.png

https://i.imgur.com/7qNxLN1.png

https://i.imgur.com/wX4qlB7.png

https://i.imgur.com/1gAIsuH.png

https://i.imgur.com/vKpVFHq.png

https://i.imgur.com/qVNQerV.png



E de um amigo nosso Espanhol da Extremadura

https://i.imgur.com/e1K3kwn.png

Edit:
https://i.imgur.com/tO8PrSJ.png

https://i.imgur.com/wxRvWiL.png

https://i.imgur.com/uJoxcX1.png




Achei curioso o resultado da Trebaruna, então decidi ver as suas distâncias. É realmente incomum


[1] "1. CLOSEST SINGLE ITEM DISTANCE%"
Spanish_Galicia Spanish_Soria
0.1671481 0.1750707
Spanish_La_Rioja Spanish_Catalunya_Central
0.2051439 0.2140293
Spanish_Camp_de_Tarragona Spanish_Castello
0.2179082 0.2232099
Spanish_Girona Spanish_Penedes
0.2249518 0.2280009
Spanish_Extremadura Portuguese
0.2282368 0.2337859
Spanish_Baleares Spanish_Mallorca
0.2356294 0.2417017
Spanish_Cataluna Spanish_Peri-Barcelona
0.2426945 0.2431095
Spanish_Pirineu Spanish_Lleida
0.2436429 0.2453311
Spanish_Alacant French_South
0.2492698 0.2499395
Spanish_Eivissa Spanish_Castilla_La_Mancha
0.2507565 0.2530151
Spanish_Murcia Spanish_Valencia
0.2545471 0.2551871
Spanish_Cantabria Spanish_Navarra
0.2555036 0.2586648
Spanish_Aragon Spanish_Menorca
0.2591774 0.2609731
Spanish_Terres_de_l'Ebre Spanish_Andalucia
0.2628205 0.2642765
Spanish_Castilla_Y_Leon French
0.2754011 0.2767970
Spanish_Barcelones Basque_Spanish
0.2817752 0.2869900
French_East Basque_French
0.3035304 0.3313753
Spanish_Pais_Vasco French_Brittany
0.3441555 0.3598112
Spanish_Asturias
0.3889769


A mesma tendência se aplica às amostras da idade do Ferro. Ela parece preferir as amostras Iberas, enquanto que a maioria de nós prefere as Celtiberas. Não faço ideia porquê.

[1] "1. CLOSEST SINGLE ITEM DISTANCE%"
Iberia_IA:Iberian
2.564085
Iberia_IA:Celtiberian
2.777508
Germanic_IA
4.525572
ITA_Rome_Imperial
4.528239
Iberia_IA:Iberia_Northeast_Empuries_Local
4.854892
Levant_Roman
5.610287
North_African
9.515323

Soria

[1] "1. CLOSEST SINGLE ITEM DISTANCE%"
Iberia_IA:Iberian
1.834674
Iberia_IA:Celtiberian
2.644319
Germanic_IA
4.564074
ITA_Rome_Imperial
4.649640
Iberia_IA:Iberia_Northeast_Empuries_Local
4.780797
Levant_Roman
6.081601
North_African
9.856362

La Rioja

[1] "1. CLOSEST SINGLE ITEM DISTANCE%"
Iberia_IA:Iberian
1.476221
Iberia_IA:Celtiberian
2.287367
ITA_Rome_Imperial
4.318100
Iberia_IA:Iberia_Northeast_Empuries_Local
4.454636
Germanic_IA
4.953241
Levant_Roman
5.639736
North_African
9.951437

Portugal

[1] "1. CLOSEST SINGLE ITEM DISTANCE%"
Iberia_IA:Celtiberian
2.046983
Iberia_IA:Iberian
2.240559
ITA_Rome_Imperial
3.724886
Iberia_IA:Iberia_Northeast_Empuries_Local
3.937985
Germanic_IA
4.390134
Levant_Roman
5.338855
North_African
8.990539

Castilla-y-León

[1] "1. CLOSEST SINGLE ITEM DISTANCE%"
Iberia_IA:Celtiberian
1.787865
Iberia_IA:Iberian
2.463053
ITA_Rome_Imperial
3.887197
Iberia_IA:Iberia_Northeast_Empuries_Local
4.089875
Germanic_IA
4.543559
Levant_Roman
5.521659
North_African
9.076688

Endovelicus
11-19-2019, 02:18 PM
Óptimo trabalho, Ruderico! :thumb:
Fica a faltar o mapa do Defski.

Com efeito, o mapa da Trebaruna é o mais distinto. Apesar de existirem pequenas variações os mapas são todos muito semelhantes.
À primeira vista diria que o mapa do Gil Vicente é o mais parecido com o meu.

Ruderico
11-19-2019, 02:48 PM
Óptimo trabalho, Ruderico! :thumb:
Fica a faltar o mapa do Defski.

Com efeito, o mapa da Trebaruna é o mais distinto. Apesar de existirem pequenas variações os mapas são todos muito semelhantes.
À primeira vista diria que o mapa do Gil Vicente é o mais parecido com o meu.

Acho que o Ph2ter se esqueceu, mas seja como for as distâncias dele são estas. Parece-me bastante equilibrado pelas regiões todas


[1] "1. CLOSEST SINGLE ITEM DISTANCE%"
Spanish_Extremadura Spanish_Pirineu
0.1409649 0.1605609
Spanish_Andalucia Spanish_Galicia
0.1636655 0.1641301
Spanish_Castello Spanish_Catalunya_Central
0.1660514 0.1672582
Spanish_Murcia Spanish_Camp_de_Tarragona
0.1710285 0.1718189
Spanish_Cantabria Spanish_Alacant
0.1719871 0.1720764
Spanish_Girona Portuguese
0.1737450 0.1742546
Spanish_Penedes Spanish_Valencia
0.1758306 0.1758419
Spanish_Peri-Barcelona Spanish_Baleares
0.1773219 0.1796592
Spanish_Cataluna Spanish_Mallorca
0.1806736 0.1907588
Spanish_Eivissa Spanish_Lleida
0.1910724 0.1916568
Spanish_Castilla_La_Mancha Spanish_Soria
0.1926139 0.1970806
Spanish_Castilla_Y_Leon Spanish_Menorca
0.2005914 0.2010339
Spanish_Barcelones Spanish_Terres_de_l'Ebre
0.2034834 0.2035751
French_South Spanish_Aragon
0.2046858 0.2080071
Spanish_La_Rioja Spanish_Navarra
0.2166403 0.2245006
Basque_Spanish French_East
0.2555057 0.2593039
French Basque_French
0.2593155 0.2625665
Spanish_Pais_Vasco Spanish_Asturias
0.2688478 0.2981241
French_Brittany
0.3472839

JJJ
11-19-2019, 04:25 PM
Decidi meter aqui todos os mapas de distâncias regionais do G25 feitas pelo Ph2ter. Acho que é uma boa forma de visualizar os dados e variação de cada um.

Eu mantive meus olhos cruzados tentando ver as diferenças.

Ruderico
11-19-2019, 04:53 PM
Eu mantive meus olhos cruzados tentando ver as diferenças.

Penso que a melhor forma de comparar é ver se há regiões específicas em Espanha que sejam fáceis de ver (no caso da Trebaruna a Galiza), e comparar a intensidade em França, Itália, etc entre cada um de nós (a minhas são pouco intensas). Mas sim, somos todos muito semelhantes, o que seria de esperar :)

Gil Vicente
11-19-2019, 09:32 PM
A mim parece-me estranho ter mais proximidade a Valencia ou Catalunha do que à Galiza. Mas é o que é.


Distance to: Gil_Vicente
0.02298917 Spanish_Andalucia
0.02488614 Spanish_Extremadura
0.02589305 Spanish_Alacant
0.02597823 Portuguese
0.02627439 Spanish_Castilla_Y_Leon
0.02845471 Spanish_Eivissa
0.02973615 Spanish_Castilla_La_Mancha
0.03028934 Spanish_Valencia
0.03034411 Spanish_Mallorca
0.03062782 Spanish_Murcia
0.03140340 Spanish_Barcelones
0.03148799 Spanish_Cataluna
0.03172354 Spanish_Asturias
0.03199310 Spanish_Camp_de_Tarragona
0.03214734 Spanish_Baleares
0.03237051 Spanish_Menorca
0.03258607 Spanish_Terres_de_l'Ebre
0.03268666 Spanish_Cantabria
0.03279146 Spanish_Peri-Barcelona
0.03296248 Spanish_Penedes
0.03384714 Spanish_Aragon
0.03456525 Spanish_Girona
0.03470729 Spanish_Pirineu
0.03485722 Spanish_Lleida
0.03517430 Spanish_Galicia

Ruderico
11-19-2019, 10:05 PM
Só temos 3 ou 4 amostras na maioria das regiões, podem não ser muito representativas, suponho que as Galegas sejam menos. Mas mesmo que sejam isso não impede que haja mais segmentos IBD com a Galiza do que com Valência (sabemos que há)

Endovelicus
11-19-2019, 10:14 PM
A mim parece-me estranho ter mais proximidade a Valencia ou Catalunha do que à Galiza. Mas é o que é.


Só temos 3 ou 4 amostras na maioria das regiões, podem não ser muito representativas, suponho que as Galegas sejam menos. Mas mesmo que sejam isso não impede que haja mais segmentos IBD com a Galiza do que com Valência (sabemos que há)

A título de exemplo, eu tenho maior proximidade às Canárias do que à Galiza. :D


Distance to: Endovelicus_scaled

0.02875895 Spanish_Extremadura
0.02931457 Portuguese
0.02974940 Spanish_Canarias
0.03059652 Spanish_Castilla_Y_Leon
0.03130927 Spanish_Andalucia
0.03362421 Spanish_Murcia
0.03429102 Spanish_Eivissa
0.03557503 Spanish_Castilla_La_Mancha
0.03572557 Spanish_Menorca
0.03583045 Spanish_Alacant
0.03680051 Spanish_Galicia
0.03889188 Spanish_Baleares
0.03910024 Spanish_Valencia
0.03980500 Spanish_Mallorca
0.04027963 Spanish_Cataluna
0.04143737 Spanish_Camp_de_Tarragona
0.04143885 Spanish_Navarra
0.04165053 Italian_Liguria
0.04199268 Spanish_Aragon
0.04209758 Spanish_Terres_de_l'Ebre
0.04231481 Spanish_Asturias
0.04297899 Spanish_Peri-Barcelona
0.04314702 Spanish_Barcelones
0.04418926 Spanish_Girona
0.04426052 Spanish_Lleida
0.04480257 Spanish_Castello
0.04482463 Spanish_Pirineu
0.04517492 Spanish_Penedes
0.04558894 Spanish_Cantabria
0.04569867 French_Corsica_o
0.04688076 Italian_Bergamo
0.04695358 Spanish_Catalunya_Central
0.04714804 Italian_Lombardy
0.04764313 Italian_Trentino-Alto-Adige
0.04795488 French_Provence
0.04893543 Italian_Veneto
0.04911074 French_Corsica
0.04962236 Italian_Piedmont
0.05102626 Swiss_Italian
0.05165186 Italian_Tuscany
0.05411819 Italian_Northeast
0.05422095 Italian_Aosta_Valley
0.05492716 Swiss_French
0.05545104 French_South
0.05582099 Spanish_La_Rioja
0.05644168 Sicilian_West
0.05703033 Italian_Marche
0.05834631 Italian_Umbria
0.05928526 Spanish_Soria
0.05988044 French
0.06012791 Italian_Lazio
0.06018394 Spanish_Pais_Vasco
0.06208771 Basque_French
0.06245931 French_East
0.06251908 Swiss_German
0.06493038 Albanian
0.06552840 Italian_Abruzzo
0.06590038 Greek
0.06673698 Italian_Molise
0.06679145 Moldavian
0.06719813 Maltese
0.06763901 Basque_Spanish
0.06788111 Romanian
0.06823665 Belgian
0.06834399 Sicilian_East
0.06899541 Bulgarian
0.06980157 Gagauz
0.07013820 Italian_South
0.07122685 Italian_Apulia
0.07212398 Macedonian
0.07248361 Italian_Basilica
0.07326414 Serbian
0.07385658 Montenegrin
0.07402243 Italian_Campania
0.07643648 Ashkenazi_Jew
0.07864545 Italian_Calabria
0.07899595 Austrian
0.08201316 German
0.08431572 Turkish_Balkans
0.08459362 Bosnian
0.08497928 English_Cornwall
0.08526328 Croatian
0.08612562 Italian_Jew
0.08658728 Hungarian
0.08684411 French_Brittany
0.08723622 English
0.08768085 Slovenian
0.08824484 Moroccan_Jew
0.08833603 Italian_Trentino-Alto-Adige_o
0.08904603 Dutch
0.08966937 Sephardic_Jew
0.09034872 Greek_Crete
0.09060257 Scottish
0.09062549 Orcadian
0.09329075 Irish
0.09453393 Welsh
0.09463838 German_East
0.09647706 Shetlandic
0.09692117 Romaniote_Jew
0.09760691 Italian_Northeast_o

Ruderico
11-19-2019, 10:49 PM
Urgh scaled. Mas sim, é normal, acho que a maior parte de nós tem

Lusitano
11-19-2019, 11:14 PM
Pelo que estou a perceber neste mapa tenho maior afinidade com as samples de Castela e Leão? Aliás, vários membros parecem ter.

Ruderico
11-20-2019, 12:29 AM
Pelo que estou a perceber neste mapa tenho maior afinidade com as samples de Castela e Leão? Aliás, vários membros parecem ter.
Sim alguns de nós têm Castela primeiro (acho que as amostras são de Valladolid), já nos modelos os resultados mostravam isso. A diferença está na distância às outras referências. Por exemplo o Gil Vicente tem distâncias próximas em grande parte da península, já eu só nas Astúrias e pouco mais, o resto está comparativamente mais distante.

Se virem os plots feitos com TSNE também ficamos todos (os que têm Castela primeiro) próximos porque aí o algoritmo tenta manter amostras com distancias pequenas todas juntas, em vez de analisar relações entre amostras também distantes. De certa forma tenta fazer cluster com amostras próximas umas das outras.


Edit:
Num plot em TSNE ficamos próximos porque temos distâncias baixas uns dos outros.

https://i.postimg.cc/nhSkbs5r/tsne-sample.png



No PCA plot ficamos mais afastados.

https://i.postimg.cc/nnnpLss5/pcaexemplo.png


Edit2:
Para dar um exemplo desta coisa das distâncias e dos plots em PCA (apesar da análise ser feita com as coordendas, não com distâncias em si, mas vamos simplificar).
Eu fico mais a "norte" (direcção dos Bascos) comparativamente ao Lusitano - apesar de termos distâncias próximas - porque tenho piores relações com Itália/etc, isso faz com que eu seja plotado mais longe de Itália. O PCA faz este tipo de análise para todas as amostras envolvidas, daí que para um bom plot convém ter um número significativo de amostras, e com variação genética suficiente para ser mais preciso.

Ou em números para ser fácil comparar distâncias, já que temos Castilla-y-Leon como a melhor referência e distâncias semelhantes a ela. Meti uns em bold para saltar mais à vista.
Distâncias do Lusitano a algumas referências

[1] "1. CLOSEST SINGLE ITEM DISTANCE%"
Spanish_Castilla_Y_Leon Spanish_Asturias Portuguese
0.1442658 0.1721888 0.1794629
Spanish_Extremadura Spanish_Pais_Vasco French_South
0.1849670 0.2130179 0.2269915
Italian_Bergamo Basque_French French_Provence
0.2310284 0.2453332 0.2482286
Italian_Tuscany Basque_Spanish Italian_South
0.2781917 0.2876964 0.3179729
French_Rennes_Bretagne Austrian Scottish
0.3297886 0.3349774 0.3818895
Swedish
0.4162901

Mesma coisa comigo

[1] "1. CLOSEST SINGLE ITEM DISTANCE%"
Spanish_Castilla_Y_Leon Spanish_Asturias Portuguese
0.1357091 0.1580823 0.1928235
Spanish_Pais_Vasco Spanish_Extremadura French_South
0.1982680 0.2217004 0.2255446
Basque_French Italian_Bergamo Basque_Spanish
0.2307241 0.2571621 0.2686181
French_Provence Italian_Tuscany French_Rennes_Bretagne
0.2729477 0.3036201 0.3200135
Italian_South Scottish Austrian
0.3586806 0.3643600 0.3809172
Swedish
0.4203295

Endovelicus
11-21-2019, 04:17 PM
Ainda fica a faltar o mapa do nosso estimado colega Hyoga, embora creio que ele nunca chegou a pedir o Global25.

rxavierflima
11-21-2019, 09:05 PM
Erm... e os meus 7 kits?

Ruderico
11-22-2019, 10:14 AM
Erm... e os meus 7 kits?

Tens de pedir ao ph2ter, mas no fundo é só um mapa de distâncias relativas

https://anthrogenica.com/showthread.php?18960-G25-Distance-Maps-To-Modern-Europeans

Aqui está a tua lista

[1] "1. CLOSEST SINGLE ITEM DISTANCE%"
Spanish_Castilla_Y_Leon Spanish_Barcelones
0.1319313 0.1626287
Spanish_Andalucia Portuguese
0.1636157 0.1660443
Spanish_Valencia Spanish_Asturias
0.1661470 0.1689053
Spanish_Castilla_La_Mancha Spanish_Terres_de_l'Ebre
0.1698577 0.1703486
Spanish_Aragon Spanish_Eivissa
0.1747210 0.1772952
Spanish_Menorca Italian_Lombardy
0.1818446 0.1825284
Spanish_Peri-Barcelona Spanish_Extremadura
0.1832955 0.1836775
Spanish_Pirineu Spanish_Murcia
0.1844099 0.1846273
Spanish_Camp_de_Tarragona Spanish_Cataluna
0.1871183 0.1913025
Spanish_Alacant Spanish_Lleida
0.1937205 0.1946451
Spanish_Penedes Spanish_Mallorca
0.1965634 0.1977682
Spanish_Girona Spanish_Baleares
0.1993678 0.2012520
Spanish_Catalunya_Central Italian_Liguria
0.2031688 0.2080409
Spanish_Pais_Vasco Spanish_Cantabria
0.2098441 0.2098871
French_Auvergne French_Occitanie
0.2099316 0.2134262
Italian_Bergamo Italian_Trentino-Alto-Adige
0.2141414 0.2154818
French_South French_Provence
0.2248604 0.2308962
Italian_Aosta_Valley French_Prov_Marseille
0.2323946 0.2369557
Italian_Piedmont Italian_Veneto
0.2370649 0.2382795
Spanish_Castello French_Corsica
0.2397758 0.2399776
Basque_French Spanish_Galicia
0.2505574 0.2589407
French_Nord French_Alsace
0.2601452 0.2612510
Italian_Northeast Italian_Tuscany
0.2635188 0.2653300
Spanish_Navarra Italian_Marche
0.2701583 0.2715013
Basque_Spanish French_Paris
0.2812929 0.2837150
Italian_Umbria Italian_Lazio
0.2885279 0.2907315
Italian_Abruzzo French_Rennes_Bretagne
0.3028523 0.3113840
Italian_South Italian_Apulia
0.3183783 0.3242790
Italian_Molise French_Brittany
0.3248754 0.3270884
Italian_Naples Spanish_La_Rioja
0.3283914 0.3320030
Italian_Campania Italian_Basilica
0.3341436 0.3394197
French_Corsica_o Spanish_Soria
0.3400691 0.3412986
Italian_Jew Italian_Calabria
0.3569026 0.3599326


Edit: actualizei a lista com os vossos resultados

Endovelicus
11-28-2019, 06:29 PM
https://i.imgur.com/jOpoWjp.png

Ibiza a vermelho... quase passava despercebido :lol:. Depois Castilla-Léon e Castilla-la-Mancha.

Ruderico
11-28-2019, 06:38 PM
Ibiza a vermelho... quase passava despercebido :lol:. Depois Castilla-Léon e Castilla-la-Mancha.

Nem tinha reparado :lol:



O meu é o que já se esperava Castela-e-Leão, Astúrias e pouco mais
https://i.imgur.com/fTEA9YL.png

Endovelicus
11-28-2019, 06:41 PM
^^sim, Asturias e Castilla-Léon.

JJJ
11-28-2019, 06:59 PM
Endovelicus não gosta de Astúrias :(

E quão pouco pontuam os portugueses na área galega. (tradução um pouco ruim do google translator)

O meu:

https://i.imgur.com/ru1KK3f.png

Ruderico
11-28-2019, 07:28 PM
E quão pouco pontuam os portugueses na área galega.

É verdade, parece que só pessoas como a Trebaruna é que são mais próximas..talvez por causa de mais antepassados germânicos/Suevos? Ou então é um artefacto do G25, o que não me parece provavel. O problema é só termos 3 amostras Galegas, é muito pouco

Endovelicus
11-29-2019, 11:08 AM
Endovelicus não gosta de Astúrias :(

E quão pouco pontuam os portugueses na área galega. (tradução um pouco ruim do google translator)

O meu:

https://i.imgur.com/ru1KK3f.png

De facto, geneticamente tenho pouca afinidade com o noroeste da Ibéria.
Sobre o teu mapa, boa aproximação às amostras do Norte de Itália (Ligúria).



É verdade, parece que só pessoas como a Trebaruna é que são mais próximas..talvez por causa de mais antepassados germânicos/Suevos? Ou então é um artefacto do G25, o que não me parece provavel. O problema é só termos 3 amostras Galegas, é muito pouco

Ainda há muito para estudar sobre o ocidente peninsular.

Defski
11-29-2019, 11:22 PM
35051

Extremadura em destaque depois Galiza e Val d'Aran :)

tatals
11-30-2019, 01:40 AM
35051

Extremadura em destaque depois Galiza e Val d'Aran :)

Embora meu mapa seja bem diferente dos de vocês por causa da miscigenação, o seu é o que mais se assemelha por causa da Extremadura e da Galícia:

35053

Mal posso esperar para ter o resultado da minha avó portuguesa em mãos e poder comparar com vocês.

rxavierflima
11-30-2019, 12:35 PM
O meu é o que já se esperava Castela-e-Leão, Astúrias e pouco mais
https://i.imgur.com/fTEA9YL.png


Dá uma olhadela nos mapas (https://anthrogenica.com/showthread.php?18960-G25-Distance-Maps-To-Modern-Europeans&p=626550&viewfull=1#post626550http://) dos pais da minha mulher.

O que achas?

JJJ
11-30-2019, 12:58 PM
Dá uma olhadela nos mapas (https://anthrogenica.com/showthread.php?18960-G25-Distance-Maps-To-Modern-Europeans&p=626550&viewfull=1#post626550http://) dos pais da minha mulher.

O que achas?

Que existem dois tipos de ibéricos: os que odeiam as Astúrias e os que os amam. Com a Galiza, acontece o mesmo com curiosidade.

Ruderico
11-30-2019, 02:07 PM
Dá uma olhadela nos mapas (https://anthrogenica.com/showthread.php?18960-G25-Distance-Maps-To-Modern-Europeans&p=626550&viewfull=1#post626550http://) dos pais da minha mulher.

O que achas?

Que existem dois tipos de ibéricos: os que odeiam as Astúrias e os que os amam. Com a Galiza, acontece o mesmo com curiosidade.

Parece que sim, seja lá porque razão..

Os mapas dos pais da mulher do Xavier parecem dos mais próximos da média Portuguesa, o Matias é relativamente parecido comigo..um pouco mais mediterrânico (edit:e com maior afinidade com germânicos), talvez. Existe tanta variedade que é difícil dizer grande coisa.

https://i.postimg.cc/PJYXnmQh/outropcaplot.png

https://i.imgur.com/AkP0OFX.png
https://i.imgur.com/fTEA9YL.png

[1] "distance%=1.1719"

matiasnlima

Iberia_IA,54.8
ISL_Viking_Age_Gaelic,22.8
North_African,11.4
ITA_Rome_Imperial,7.8
Levant_Roman,3.2

[1] "distance%=1.5675"

matiasnlima

Iberia_IA,66.6
North_African,11.8
Germanic_IA,9.8
ITA_Rome_Imperial,8.6
Levant_Roman,3.2



[1] "distance%=1.6157"

Ruderico

Iberia_IA,55.2
ISL_Viking_Age_Gaelic,26.2
ITA_Rome_Imperial,8.8
North_African,8.6
Levant_Roman,1.2

[1] "distance%=1.9665"

Ruderico

Iberia_IA,79.6
North_African,8.4
ITA_Rome_Imperial,8.2
Germanic_IA,2.4
Levant_Roman,1.4

rxavierflima
11-30-2019, 07:37 PM
Os mapas dos pais da mulher do Xavier parecem dos mais próximos da média Portuguesa, o Matias é relativamente parecido comigo..um pouco mais mediterrânico (edit:e com maior afinidade com germânicos), talvez. Existe tanta variedade que é difícil dizer grande coisa.


Era mais em relação à relativa proximidade deles à zona dos Pirinéus e França. Ainda não vi muitos "mapas azuis" de portugueses mas, dos que vi, eles parecem destacar-se nesse aspecto.

Ruderico
11-30-2019, 08:57 PM
Era mais em relação à relativa proximidade deles à zona dos Pirinéus e França. Ainda não vi muitos "mapas azuis" de portugueses mas, dos que vi, eles parecem destacar-se nesse aspecto.

Sim, eles têm boas distâncias a algumas referências Catalãs, a razão real não sei, mas tendo em conta que também têm com Portugal eu diria que têm relações com as referências germânicas e mediterrânicas mais semelhantes do que a maioria de nós. A maior diferença com essas zonas provavelmente será o norte Africano deles, que será maior

Gil Vicente
11-30-2019, 09:41 PM
Aqui fica o meu mapa azul. É diferente do resto da malta:

https://i.imgur.com/cJyU6Oy.png

Distancias unscaled para se perceber melhor o mapa:


Distance to: Gil_Vicente
0.01214676 Spanish_Andalucia
0.01252992 Spanish_Barcelones
0.01349974 Spanish_Alacant
0.01368290 Spanish_Valencia
0.01377884 Spanish_Castilla_Y_Leon
0.01382845 Spanish_Eivissa
0.01388756 Spanish_Terres_de_l'Ebre
0.01468030 Spanish_Castilla_La_Mancha
0.01476041 Spanish_Cantabria
0.01503225 Spanish_Peri-Barcelona
0.01555970 Spanish_Pirineu
0.01560907 Spanish_Penedes
0.01564732 Portuguese
0.01585384 Spanish_Aragon
0.01596293 Spanish_Camp_de_Tarragona
0.01617269 Spanish_Navarra
0.01619066 Spanish_Extremadura
0.01625490 French_Occitanie
0.01626296 Spanish_Mallorca
0.01645461 Spanish_Lleida
0.01647301 Spanish_Asturias
0.01655743 Spanish_Cataluna
0.01709048 French_Auvergne
0.01713708 Spanish_Catalunya_Central
0.01720581 Italian_Lombardy
0.01735158 Spanish_Girona
0.01740381 Spanish_Murcia
0.01776635 Spanish_Pais_Vasco
0.01781214 Spanish_Canarias
0.01781700 Spanish_Menorca
0.01807099 Spanish_Baleares
0.01871055 French_Provence
0.01900661 Italian_Bergamo
0.01916353 Spanish_Castello
0.01966170 Italian_Aosta_Valley
0.01983794 Italian_Trentino-Alto-Adige
0.02012349 French_South
0.02064592 Basque_French
0.02095790 Italian_Piedmont
0.02103503 Swiss_German
0.02145697 Italian_Veneto
0.02146416 Swiss_French
0.02150721 Italian_Liguria
0.02155142 French_Nord
0.02186320 French_Alsace
0.02265721 Belgian
0.02271692 French_Corsica
0.02320482 French_Paris
0.02425836 Italian_Tuscany
0.02428827 Italian_Northeast
0.02433667 Spanish_Galicia
0.02462591 Basque_Spanish
0.02511840 Swiss_Italian
0.02546285 Italian_Marche
0.02571928 Roma_Barcelona
0.02591106 Sicilian_West
0.02612596 French_Brittany
0.02689141 Italian_Umbria
0.02703134 Italian_Lazio
0.02892613 Italian_Abruzzo
0.02898549 German
0.02952486 Welsh
0.02998366 Italian_Molise
0.03000433 Orcadian
0.03000640 English_Cornwall
0.03021121 Spanish_Soria
0.03025145 Spanish_La_Rioja
0.03041020 English
0.03043096 Sicilian_East
0.03053446 Austrian
0.03068722 Greek_Thessaly
0.03115952 Maltese
0.03117384 Italian_Apulia
0.03128099 Scottish
0.03144230 Roma_Madrid
0.03187141 Italian_Campania
0.03255335 Irish
0.03286871 Italian_Basilicata
0.03288726 Dutch
0.03290480 Ashkenazi_Jew
0.03438727 Romanian
0.03448127 German_East
0.03482746 Italian_Calabria
0.03486495 Shetlandic
0.03489434 Gagauz
0.03524895 Bulgarian
0.03527119 Italian_Jew
0.03541189 Sephardic_Jew
0.03589183 Icelandic
0.03617709 Hungarian
0.03628033 Roma_Bilbao
0.03642202 Moldavian
0.03651125 Swedish
0.03654779 Albanian
0.03663837 Norwegian
0.03673930 Roma_Granada
0.03689452 Turkish_Balkans
0.03727631 Greek_Central_Macedonia
0.03767053 Serbian
0.03780478 Greek_Izmir

Ruderico
11-30-2019, 09:52 PM
Essas são escaladas, o mapa não.


Spanish_Andalucia Spanish_Barcelones
0.1214676 0.1252992
Spanish_Alacant Spanish_Valencia
0.1349974 0.1368290
Spanish_Castilla_Y_Leon Spanish_Eivissa
0.1377884 0.1382845
Spanish_Terres_de_l'Ebre Spanish_Castilla_La_Mancha
0.1388756 0.1468030
Spanish_Cantabria Spanish_Peri-Barcelona
0.1476041 0.1503225
Spanish_Pirineu Spanish_Penedes
0.1555970 0.1560907
Portuguese Spanish_Aragon
0.1564732 0.1585384
Spanish_Camp_de_Tarragona Spanish_Extremadura
0.1596293 0.1619066
French_Occitanie Spanish_Mallorca
0.1625490 0.1626296
Spanish_Lleida Spanish_Asturias
0.1645461 0.1647301
Spanish_Cataluna French_Auvergne
0.1655743 0.1709048
Spanish_Catalunya_Central Italian_Lombardy
0.1713708 0.1720581
Spanish_Girona Spanish_Murcia
0.1735158 0.1740381
Spanish_Pais_Vasco Spanish_Menorca
0.1776635 0.1781700
Spanish_Baleares French_Provence
0.1807099 0.1840132
Italian_Bergamo Spanish_Castello
0.1900661 0.1916353
French_Prov_Marseille Italian_Aosta_Valley
0.1927249 0.1966170
Italian_Trentino-Alto-Adige French_South
0.1983794 0.2012349
Spanish_Navarra Basque_French
0.2028583 0.2064592
Italian_Piedmont Italian_Veneto
0.2095790

Endovelicus
11-30-2019, 09:59 PM
Ibiza ftw

https://www.skyscrapercity.com/images/smilies/club.gif




https://i.imgur.com/jOpoWjp.png



[1] "1. CLOSEST SINGLE ITEM DISTANCE%"
Spanish_Eivissa Spanish_Castilla_La_Mancha
0.1142439 0.1300351
Spanish_Castilla_Y_Leon Spanish_Terres_de_l'Ebre
0.1303424 0.1403376
Spanish_Valencia Spanish_Menorca
0.1422939 0.1424366
Spanish_Andalucia Portuguese
0.1457304 0.1495834
Spanish_Barcelones Spanish_Aragon
0.1525834 0.1533703
Spanish_Extremadura Spanish_Camp_de_Tarragona
0.1542617 0.1570478
Spanish_Lleida Spanish_Alacant
0.1585221 0.1612029
Spanish_Peri-Barcelona Spanish_Mallorca
0.1612552 0.1655866
Spanish_Pirineu Spanish_Murcia
0.1672724 0.1673522
Spanish_Catalunya_Central Spanish_Cataluna
0.1696810 0.1718191
Spanish_Girona Spanish_Baleares
0.1737640 0.1760013
Spanish_Cantabria Spanish_Penedes
0.1784451 0.1793637
Spanish_Navarra Spanish_Castello
0.1850986 0.1867200
French French_South
0.2041469 0.2053448
Spanish_Asturias Basque_French
0.2085498 0.2241191
Spanish_Pais_Vasco Spanish_Galicia
0.2296161 0.2311358
French_East Basque_Spanish
0.2336273 0.2598929
Spanish_La_Rioja French_Brittany
0.2793600 0.2988981
Spanish_Soria
0.3054353

Ainda não apareceu mais ninguém que tenha Ibiza como população mais próxima... :lol:

Gil Vicente
11-30-2019, 10:08 PM
Onde está essa speadsheet unscaled? No eurogenes só encontro spreadsheets scaled.

https://bga101.blogspot.com/2019/07/getting-most-out-of-global25.html

Endovelicus
11-30-2019, 10:11 PM
Onde está essa speadsheet unscaled? No eurogenes só encontro spreadsheets scaled.

https://bga101.blogspot.com/2019/07/getting-most-out-of-global25.html

Devem ser estas (https://drive.google.com/file/d/1y49hyvviJpHj9esVqyeiFm32DhnPlfRQ/view). Pelo menos não vem a indicação de que são scaled.

Gil Vicente
11-30-2019, 10:18 PM
Devem ser estas (https://drive.google.com/file/d/1y49hyvviJpHj9esVqyeiFm32DhnPlfRQ/view). Pelo menos não vem a indicação de que são scaled.

É isso. Editei o meu post com o mapa e as respectivas distâncias.

Token
12-01-2019, 03:42 PM
I've seen that image on Lazarids twitter. A new paper? I can't read anything.

https://pbs.twimg.com/media/EIzFZohXsAAGhSd.jpg:large

Defski
12-01-2019, 09:55 PM
https://coursesandconferences.wellcomegenomecampus.org/wp-content/uploads/2019/10/Human-Evolution-2019-abstract-book.pdf

Post-Roman Iberia: A Genetic Journey There and Back AgainGonzalo Oteo-Garcia (1),Marina Silva(1), George Foody(1), Alessandro Fichera(1), Bobby Yau(1), Marisa Rovira(2), Vicente Palomar(3) Albert Ribera i Lacomba(4), Maria Pala(1), Ceiridwen Edwards(1), Martin B. Richards(1)

1) Department of Biological and Geographical Sciences, School of Applied Sciences, University of Huddersfield, Queensgate, Huddersfield HD1 3DH, UK2) Museu Arqueològic Municipal, La Vall d'Uixó 12600, Spain3) Museo Municipal de Arqueología y Etnología, Segorbe 12400, Spain4) Servicio de Investigacion Arqueologica Municipal, Ayuntamiento de Valencia, Valencia 46002, Spain

The post-Roman period in Iberia is yet to be studied in depth using ancient DNA. Our research focuses on understanding population genetic changes during this time in the Iberian Levante. This Mediterranean region is interesting because it became a cultural crossroads after intense Romanization, followed by a decline during the Visigothic era, a Byzantine invasion and later becoming a jewel of Islamic agriculture. The main focus of the research is on the Medieval Islamic period. During the five centuries of Islamic rule, and according to historical records, many Arab and North African settlers were attracted to Xarq Al-Andalus. We sequenced 13 early to late Medieval genomes with coverages ranging from 0.3X to 2.3X from the Valencian region in eastern Spain and discovered widespread North African admixture and foreign uniparental markers in the Andalusian Islamic rural society. These results are the more striking when compared to the modern Spanish population, which displays little surviving genomic evidence for this relatively recent admixture episode. We identify one major historical event in the 17th century, potentially responsible for the disappearance of the North African ancestry in eastern Spain. On the other hand, we did not find a clear Arab genetic contribution, consistent with the view that Arabs were a minority ruling elite. However, the genomic results of two samples dated to the 6th-7th century moment of the Byzantine invasion suggest that the admixture trend may have started earlier, during late Roman times. These two samples are father and daughter, found in a borderland territory between Visigothic and Byzantine rule, and display a significant degree of Near Eastern ancestry but with clear Iberian affinities. In conclusion, we see evidence that the Spanish Levante suffered two genetic transformations in a relatively short period of time -a few centuries -within the last thousand years. This dual genomic transformation saw the arrival of North African ancestry to eastern Iberia in high proportions only to later disappear almost completely. However, the North African genetic legacy in Spain survived in some ways until our days, mostly in the form of paternal lineages E1b and maternal lineages U6a which we clearly identified being introduced for the first time during the Islamic period.

Ruderico
12-01-2019, 10:08 PM
É o que se tinha visto no paper do Olalde, chegada durante o período Romano (no máximo) e contribuição limitada posteriormente. O problema é que estes estudos todos são feitos no Levante Espanhol, queria era ver no Algarve. Uma chegada há ~2000 anos poderia explicar porque os valores são homogéneos do norte ao sul do país, e porque razão aquele Ibérico do século IX do Zanzibar parece um Português moderno

Token
12-02-2019, 12:02 AM
Esperava ver algo sobre os visigodos. Duvido muito que eles não tenham contribuído em nada para a formação do perfil ibérico moderno.

alexfritz
12-02-2019, 03:37 AM
interesting abstract inlight of what is now known on who the romans really were and the question are the romans really the source of all east-med/levantine in their frm. empire it seems the answer, in conjunction with olalde et al, is more no than yes

while east-med/levantine ancestry(in olalde et al) was certainly there during the roman period it oddly did not show an effect, unlike something from the postroman era, I8343 from 6CE empuries remains strangely unaltered by the graeco-romans(empuries2) but then in postroman 6-8CE there appears a contribution of a good 20+ 'east-med' with empuries2 failing as the valid source and best proximate (!no jewish groups in outgroup) modern greeks, a mirage source; now this paper following suit with an actual postroman(tpq lateroman) introgression, styled as "byzantine", it seems the source to whatever east-med/levantine quantified is indeed not actually the romans but a later roman-like(east-med continuum) pop.

prob. likewise the case for the other frm. provs. when factchecking with the G25 distance-heatmap the three most densly "colonised" provs. cisalpina, narbonensis and baetica, it is view clear that actual roman colonisation never took place in the latter two and prob. the reason olalde et al conjectured that what was found in roman baetica is preroman punic; also most romans(stanford & empuries) were hg J not E1b though maybe i misread and that just alludes to the islamic rule

Ruderico
12-02-2019, 06:35 AM
Esperava ver algo sobre os visigodos. Duvido muito que eles não tenham contribuído em nada para a formação do perfil ibérico moderno.

Provavelmente não é algo de grande interesse para os investigadores, talvez por ser um periodo pouco conhecido e sem o impacto que teve no Reino Unido, França, etc



Evitem descarrilar o tópico, este é sobre o G25

Ruderico
12-08-2019, 01:25 PM
Há novas amostras Galegas, Andaluzes e das Canarias no G25. A nova referência média Galega já está muito mais próximo da nossa, era o problema de só termos 3 amostras

rxavierflima
03-20-2020, 10:21 PM
Mais 3 coordenadas (eu e os meus irmãos no 23andme)

rxavierflima23 scaled:
,PC1,PC2,PC3,PC4,PC5,PC6,PC7,PC8,PC9,PC10,PC11,PC1 2,PC13,PC14,PC15,PC16,PC17,PC18,PC19,PC20,PC21,PC2 2,PC23,PC24,PC25
rxavierflima23_scaled,0.112685,0.146236,0.036958,-0.002261,0.044008,-0.003068,-0.003995,0.004154,0.024134,0.027153,0.001786,0.006 444,-0.012636,-0.001514,0.009636,-0.010077,-0.01682,-0.002787,0.000377,0.001626,-0.004243,-0.007419,0.004437,0.001205,0.003592

telmodflima23 scaled:
,PC1,PC2,PC3,PC4,PC5,PC6,PC7,PC8,PC9,PC10,PC11,PC1 2,PC13,PC14,PC15,PC16,PC17,PC18,PC19,PC20,PC21,PC2 2,PC23,PC24,PC25
telmodflima23_scaled,0.103579,0.149283,0.0445,0.00 3553,0.041854,-0.005857,-0.00564,0.004384,0.021475,0.031709,-0.004872,-0.001649,-0.010258,-0.000963,0.00285,-0.011403,-0.012778,-0.004814,-0.004902,0.004377,-0.006738,-0.004699,0.002465,0.004217,0.003592

joaopauloflima23 scaled:
,PC1,PC2,PC3,PC4,PC5,PC6,PC7,PC8,PC9,PC10,PC11,PC1 2,PC13,PC14,PC15,PC16,PC17,PC18,PC19,PC20,PC21,PC2 2,PC23,PC24,PC25
joaopauloflima23_scaled,0.102441,0.144205,0.035449 ,-0.004199,0.037853,-0.000558,-0.013396,-0.000462,0.02168,0.027882,-0.002111,0.003147,-0.018285,-0.01156,0.008279,0.003845,0.004042,-0.004814,-0.008296,0.006003,-0.003619,-0.009027,0.000493,-0.005784,0.011616


rxavierflima23 unscaled:
,PC1,PC2,PC3,PC4,PC5,PC6,PC7,PC8,PC9,PC10,PC11,PC1 2,PC13,PC14,PC15,PC16,PC17,PC18,PC19,PC20,PC21,PC2 2,PC23,PC24,PC25
rxavierflima23,0.0099,0.0144,0.0098,-0.0007,0.0143,-0.0011,-0.0017,0.0018,0.0118,0.0149,0.0011,0.0043,-0.0085,-0.0011,0.0071,-0.0076,-0.0129,-0.0022,0.0003,0.0013,-0.0034,-0.006,0.0036,0.001,0.003

telmodflima23 unscaled:
,PC1,PC2,PC3,PC4,PC5,PC6,PC7,PC8,PC9,PC10,PC11,PC1 2,PC13,PC14,PC15,PC16,PC17,PC18,PC19,PC20,PC21,PC2 2,PC23,PC24,PC25
telmodflima23,0.0091,0.0147,0.0118,0.0011,0.0136,-0.0021,-0.0024,0.0019,0.0105,0.0174,-0.003,-0.0011,-0.0069,-0.0007,0.0021,-0.0086,-0.0098,-0.0038,-0.0039,0.0035,-0.0054,-0.0038,0.002,0.0035,0.003

joaopauloflima23 unscaled:
,PC1,PC2,PC3,PC4,PC5,PC6,PC7,PC8,PC9,PC10,PC11,PC1 2,PC13,PC14,PC15,PC16,PC17,PC18,PC19,PC20,PC21,PC2 2,PC23,PC24,PC25
joaopauloflima23,0.009,0.0142,0.0094,-0.0013,0.0123,-0.0002,-0.0057,-0.0002,0.0106,0.0153,-0.0013,0.0021,-0.0123,-0.0084,0.0061,0.0029,0.0031,-0.0038,-0.0066,0.0048,-0.0029,-0.0073,0.0004,-0.0048,0.0097

Ruderico
03-21-2020, 12:19 AM
As tuas coordenadas com os dados de um e de outro teste são semelhantes, os resultados no modelo que tenho na signature são bastante próximos. O exemplo abaixo tem a referencia Gaelica, que dá jeito para muitos de nós - acho que já sabemos todos isso, apesar de ser apenas um proxy para variação interna pre-Romana. Fico sempre com a sensação de que quando algo "atlantico" (neste caso o Gaelic) está em falta algumas pessoas compensam com germânico extra, mas o valor do Gaélico é claramente overfitted.

O JP parece ser o que mais gosta da referência germânica de entre vocês. E das Levantinas+norte Africanas também. Como de costume corri o mesmo modelo algumas vezes e tirei a melhor fit.



[1] "distance%=1.5145"

rxavierflima23

Iberia_IA,52.4
Gaelic_MA,22.6
Rome_Imperial,13.4
North_African,10.2
Levant_Roman,1.4


[1] "distance%=1.5055"

rxavierflima

Iberia_IA,56.8
Gaelic_MA,20
Rome_Imperial,12
North_African,9.8
Levant_Roman,1.4


O mesmo modelo para os teus irmãos

[1] "distance%=1.7268"

telmodflima23

Iberia_IA,51.6
Gaelic_MA,19.6
Rome_Imperial,17
North_African,11.2
Levant_Roman,0.6


[1] "distance%=1.3456"

joaopauloflima23

Iberia_IA,53.2
North_African,13.6
Germanic_IA,11.6
Rome_Imperial,9.8
Gaelic_MA,6.6
Levant_Roman,5.2


https://i.postimg.cc/Dm32SJ3f/Lima.png

Curiosamente no PCA os teus dados aparecem numa posição um pouco diferente (mas não muito, também só estamos a ver 2 dimensões), e mais próxima da posição dos teus irmãos. Se eu tirar o Gaelico das referências os teus dados começam a mostrar alguma diferença de um teste para o outro - em minha opinião isto é sinal de overfitting no modelo anterior - mas em linha com o que o PCA mostra. Parece que as parcelas germânicas e do centro/leste mediterrânico aumentam em detrimento da referência Ibérica. Não faço ideia do que seja o mais correcto, mas é sempre bom ver a tua posição e a dos teus irmãos relativamente próxima, e os resultados dos modelos a condizer.



[1] "distance%=1.748"

rxavierflima

Iberia_IA,71.2
Rome_Imperial,13
North_African,9.2
Germanic_IA,5.6
Levant_Roman,1


[1] "distance%=1.782"

rxavierflima23

Iberia_IA,61
Rome_Imperial,17
Germanic_IA,11.4
North_African,10.6


[1] "distance%=1.9192"

telmodflima23

Iberia_IA,60
Rome_Imperial,20.4
North_African,11.4
Germanic_IA,8.2


[1] "distance%=1.3811"

joaopauloflima23

Iberia_IA,54.6
Germanic_IA,16.2
Rome_Imperial,12
North_African,11.8
Levant_Roman,5.4







Edit: Já agora uma lista de distâncias a referências médias, só para dar uma ideia a despachar.

Xavier

[1] "1. CLOSEST SINGLE ITEM DISTANCE%"
Spanish_Castilla_Y_Leon Spanish_Andalucia
0.1319313 0.1458604
Spanish_Galicia Spanish_Barcelones
0.1553184 0.1626287
Portuguese Spanish_Valencia
0.1660443 0.1661470
Spanish_Asturias Spanish_Castilla_La_Mancha
0.1689053 0.1698577
Spanish_Terres_de_l'Ebre Spanish_Aragon
0.1703486 0.1747210
Spanish_Eivissa Spanish_Menorca
0.1772952 0.1818446
Italian_Lombardy Spanish_Peri-Barcelona
0.1825284 0.1832955
Spanish_Extremadura Spanish_Pirineu
0.1836775 0.1844099
Spanish_Murcia Spanish_Canarias
0.1846273 0.1866713
Spanish_Camp_de_Tarragona Spanish_Cataluna
0.1871183 0.1913025
Spanish_Alacant Spanish_Lleida
0.1937205 0.1946451
Spanish_Penedes Spanish_Mallorca
0.1965634 0.1977682
Spanish_Girona Spanish_Baleares
0.1993678 0.2012520
Spanish_Catalunya_Central Italian_Liguria
0.2031688 0.2080409
Spanish_Pais_Vasco Spanish_Cantabria
0.2098441 0.2098871
French_Auvergne French_Occitanie
0.2123134 0.2134262
Italian_Bergamo Italian_Trentino-Alto-Adige
0.2141414 0.2154818
Spanish_Navarra French_South
0.2222024 0.2248604
Italian_Aosta_Valley French_Provence
0.2323946 0.2326909
Italian_Piedmont Italian_Veneto
0.2370649 0.2382795
Spanish_Castello French_Corsica
0.2397758 0.2399776
Swiss_French Basque_French
0.2486177 0.2505574
Swiss_German French_Nord
0.2534611 0.2601452
French_Alsace Italian_Northeast
0.2612510 0.2635188
Italian_Tuscany Italian_Marche
0.2653300 0.2715013
Swiss_Italian Sicilian_West
0.2737888 0.2749219
Roma_Barcelona Belgian
0.2768398 0.2805181
Basque_Spanish French_Paris
0.2812929 0.2837150
Italian_Umbria Italian_Lazio
0.2885279 0.2907315
Italian_Abruzzo Greek_Thessaly
0.3028523 0.3036318
Maltese Sicilian_East
0.3041510 0.3098278
Ashkenazi_Ukraine French_Brittany
0.3120111 0.3137439
Italian_Apulia Ashkenazi_Poland
0.3202074 0.3234788
Austrian Italian_Molise
0.3242404 0.3248754
German Roma_Madrid
0.3280144 0.3296107
Italian_Campania Spanish_La_Rioja
0.3305287 0.3320030
Ashkenazi_Russia Ashkenazi_Belarussia
0.3333755 0.3375005
Italian_Basilicata Spanish_Soria
0.3394197 0.3412986
Welsh English_Cornwall
0.3424879 0.3443029
Romanian Ashkenazi_Lithuania
0.3445525 0.3487909
Gagauz Sephardic_Jew
0.3501079 0.3519494
Orcadian Italian_Calabria
0.3526712 0.3533555
Ashkenazi_Germany English
0.3552192 0.3560009
Italian_Jew Bulgarian
0.3569026 0.3605466
German_East Albanian
0.3605971 0.3626889
Scottish Hungarian
0.3627954 0.3699970
Moroccan_Jew Serbian
0.3700064 0.3705929
Moldavian Roma_Bilbao
0.3711889 0.3714181
Greek_Central_Macedonia Dutch
0.3718092 0.3726154
Irish Roma_Granada
0.3774049 0.3775687


Xavier23

[1] "1. CLOSEST SINGLE ITEM DISTANCE%"
Spanish_Asturias Spanish_Castilla_Y_Leon
0.1575849 0.1605380
Spanish_Andalucia Spanish_Galicia
0.1748319 0.1798291
Italian_Lombardy Portuguese
0.1810829 0.1849462
Italian_Liguria Spanish_Terres_de_l'Ebre
0.1897604 0.1900617
Spanish_Barcelones Spanish_Aragon
0.1905940 0.1909082
Spanish_Valencia Spanish_Eivissa
0.1929440 0.1942353
Spanish_Castilla_La_Mancha Spanish_Extremadura
0.1947348 0.1988001
Spanish_Canarias Spanish_Murcia
0.2023186 0.2077071
Spanish_Menorca Spanish_Peri-Barcelona
0.2082805 0.2092058
Spanish_Cataluna Spanish_Mallorca
0.2095201 0.2149781
Spanish_Camp_de_Tarragona Spanish_Pirineu
0.2156902 0.2193862
Spanish_Lleida French_Occitanie
0.2194266 0.2203205
French_Auvergne Italian_Aosta_Valley
0.2237350 0.2242705
Italian_Trentino-Alto-Adige Spanish_Alacant
0.2247699 0.2254395
Spanish_Penedes Italian_Bergamo
0.2260868 0.2261737
Spanish_Girona Spanish_Catalunya_Central
0.2288640 0.2323468
Spanish_Baleares Italian_Piedmont
0.2337984 0.2402735
French_Provence Spanish_Navarra
0.2423397 0.2436663
Spanish_Cantabria Spanish_Pais_Vasco
0.2440135 0.2458983
French_Alsace French_Nord
0.2490545 0.2503251
French_South Swiss_German
0.2504079 0.2512623
Italian_Veneto French_Corsica
0.2519425 0.2593276
Italian_Northeast Swiss_French
0.2618631 0.2659568
Spanish_Castello Italian_Marche
0.2666698 0.2676640
Italian_Tuscany Swiss_Italian
0.2683099 0.2725489
Belgian Sicilian_West
0.2739929 0.2788644
French_Paris Basque_French
0.2820760 0.2832264
Roma_Barcelona Italian_Umbria
0.2857104 0.2940340
Maltese Sicilian_East
0.2979280 0.2994394
Greek_Thessaly Italian_Lazio
0.2996836 0.3023811
French_Brittany Ashkenazi_Ukraine
0.3030624 0.3031096
Italian_Abruzzo Austrian
0.3053272 0.3113500
German Basque_Spanish
0.3115519 0.3144401
Ashkenazi_Poland Italian_Apulia
0.3145855 0.3193504
Ashkenazi_Russia English_Cornwall
0.3203917 0.3220311
Welsh Roma_Madrid
0.3295275 0.3306255
Italian_Campania Ashkenazi_Belarussia
0.3309498 0.3316318
Italian_Molise English
0.3343845 0.3369621
Romanian Orcadian
0.3377719 0.3397346
German_East Ashkenazi_Lithuania
0.3421086 0.3423757
Italian_Basilicata Sephardic_Jew
0.3429843 0.3439346
Gagauz Scottish
0.3450844 0.3465810
Ashkenazi_Germany Dutch
0.3500106 0.3518292
Italian_Calabria Italian_Jew
0.3521138 0.3524983
Hungarian Bulgarian
0.3569114 0.3595039
Moldavian Irish
0.3613948 0.3619779
Serbian Roma_Bilbao
0.3641982 0.3643879
Spanish_La_Rioja Albanian
0.3645326 0.3648420
Croatian Slovenian
0.3682826 0.3714585
Moroccan_Jew Greek_Central_Macedonia
0.3716393 0.3716760

Telmo

[1] "1. CLOSEST SINGLE ITEM DISTANCE%"
Italian_Liguria Spanish_Castilla_Y_Leon
0.1762328 0.1888210
Italian_Lombardy Spanish_Galicia
0.1898863 0.1964435
Spanish_Asturias Spanish_Andalucia
0.1987410 0.1996932
Spanish_Extremadura Portuguese
0.2028133 0.2041238
Spanish_Eivissa Spanish_Murcia
0.2075674 0.2105083
Spanish_Terres_de_l'Ebre Spanish_Canarias
0.2108185 0.2113323
Italian_Aosta_Valley Spanish_Barcelones
0.2135726 0.2140642
Spanish_Aragon Spanish_Valencia
0.2162809 0.2169199
Spanish_Mallorca Spanish_Peri-Barcelona
0.2179963 0.2184890
Italian_Trentino-Alto-Adige Spanish_Castilla_La_Mancha
0.2208989 0.2228377
Italian_Bergamo Spanish_Menorca
0.2229438 0.2261631
Spanish_Cataluna Spanish_Camp_de_Tarragona
0.2298396 0.2310314
Spanish_Pirineu French_Occitanie
0.2323589 0.2340948
French_Auvergne Italian_Piedmont
0.2341345 0.2343872
Spanish_Penedes Spanish_Baleares
0.2386950 0.2394507
Spanish_Alacant Spanish_Lleida
0.2401213 0.2428221
Spanish_Girona Spanish_Catalunya_Central
0.2429377 0.2433250
Italian_Veneto Italian_Northeast
0.2442965 0.2455909
French_Provence Spanish_Cantabria
0.2465546 0.2505612
French_Corsica French_Alsace
0.2553383 0.2576346
French_Nord Swiss_Italian
0.2594872 0.2612405
Swiss_German Italian_Tuscany
0.2615875 0.2632951
Italian_Marche French_South
0.2652948 0.2677648
Spanish_Navarra Spanish_Castello
0.2683211 0.2691714
Roma_Barcelona Swiss_French
0.2754156 0.2759977
Belgian Sicilian_West
0.2836697 0.2841039
Italian_Umbria French_Paris
0.2846924 0.2885365
Greek_Thessaly Spanish_Pais_Vasco
0.2891158 0.2900399
Maltese Italian_Lazio
0.2949912 0.2980366
Austrian Italian_Abruzzo
0.2997965 0.3002692
Sicilian_East Ashkenazi_Ukraine
0.3051310 0.3054004
Basque_French Romanian
0.3090540 0.3095068
German Ashkenazi_Russia
0.3101590 0.3112083
Ashkenazi_Poland Italian_Apulia
0.3121347 0.3125236
French_Brittany Italian_Campania
0.3158567 0.3238080
Roma_Madrid Gagauz
0.3254643 0.3279229
Italian_Molise Ashkenazi_Belarussia
0.3282986 0.3283259
Italian_Basilicata Bulgarian
0.3343266 0.3345033
German_East Ashkenazi_Lithuania
0.3356766 0.3374759
Hungarian Serbian
0.3376425 0.3387508
Moldavian Basque_Spanish
0.3398382 0.3406604
English_Cornwall Albanian
0.3413606 0.3431963
Ashkenazi_Germany Italian_Calabria
0.3438311 0.3439203
Greek_Central_Macedonia Sephardic_Jew
0.3478005 0.3480612
Croatian Italian_Jew
0.3482612 0.3486954
Welsh Montenegrin
0.3492105 0.3515069
Roma_Bilbao English
0.3518908 0.3537283
Slovenian Turkish_Balkans
0.3559056 0.3561112
Macedonian Roma_Porto
0.3579416 0.3591836
Orcadian Roma_Granada
0.3601991 0.3613432

João Paulo

[1] "1. CLOSEST SINGLE ITEM DISTANCE%"
Spanish_Extremadura Spanish_Galicia
0.1472068 0.1574350
Spanish_Canarias Portuguese
0.1652332 0.1665755
Spanish_Murcia Spanish_Cataluna
0.1724899 0.1795000
Spanish_Penedes Spanish_Pirineu
0.1818444 0.1825377
Spanish_Peri-Barcelona Spanish_Alacant
0.1834678 0.1838071
Spanish_Andalucia Spanish_Valencia
0.1855895 0.1896752
Spanish_Mallorca Spanish_Camp_de_Tarragona
0.1905970 0.1931275
Spanish_Catalunya_Central Spanish_Castello
0.1959815 0.2012113
Spanish_Girona Spanish_Aragon
0.2045061 0.2074655
Spanish_Terres_de_l'Ebre Spanish_Eivissa
0.2113103 0.2122084
Spanish_Cantabria Spanish_Lleida
0.2143367 0.2156114
Spanish_Castilla_La_Mancha Spanish_Castilla_Y_Leon
0.2158092 0.2184952
Spanish_Barcelones Spanish_Baleares
0.2206569 0.2207806
French_South French_Auvergne
0.2294138 0.2308432
French_Occitanie Swiss_French
0.2336245 0.2355005
Spanish_Menorca Spanish_Soria
0.2380264 0.2380898
French_Provence Spanish_Navarra
0.2383406 0.2392853
French_Corsica Italian_Aosta_Valley
0.2399211 0.2511718
Spanish_La_Rioja Swiss_Italian
0.2520496 0.2559829
Italian_Veneto Italian_Bergamo
0.2571608 0.2586293
Italian_Trentino-Alto-Adige Spanish_Asturias
0.2596507 0.2627470
Roma_Barcelona Italian_Piedmont
0.2646967 0.2654938
Italian_Tuscany Italian_Umbria
0.2685231 0.2688197
Italian_Lombardy Italian_Northeast
0.2719346 0.2735347
Basque_Spanish Italian_Liguria
0.2812987 0.2835031
French_Nord Spanish_Pais_Vasco
0.2859290 0.2863782
Swiss_German French_Alsace
0.2938218 0.2940013
Italian_Lazio Italian_Marche
0.2965667 0.2989069
French_Paris Belgian
0.3006880 0.3019104
Maltese Basque_French
0.3022492 0.3064147
Sicilian_West Italian_Abruzzo
0.3068957 0.3160332
French_Brittany Roma_Madrid
0.3261182 0.3277033
Ashkenazi_Belarussia Italian_Campania
0.3340077 0.3350739
Austrian Ashkenazi_Germany
0.3385864 0.3394682
Greek_Thessaly Italian_Molise
0.3410279 0.3417879
Italian_Apulia Italian_Basilicata
0.3418269 0.3421615
Ashkenazi_Russia Ashkenazi_Ukraine
0.3422242 0.3430075
Ashkenazi_Poland Ashkenazi_Lithuania
0.3458417 0.3476616
German Sicilian_East
0.3477748 0.3514397
Italian_Calabria Moroccan_Jew
0.3541713 0.3560256
Romanian Italian_Jew
0.3565940 0.3622381
Welsh Roma_Granada
0.3667077 0.3670812
Gagauz Greek_Central_Macedonia
0.3726672 0.3736015
Bulgarian Moldavian
0.3748766 0.3767925
Sephardic_Jew Greek_Izmir
0.3778814 0.3806092
English_Cornwall Montenegrin
0.3825275 0.3845318
Turkish_Balkans English
0.3856848 0.3869356
Albanian Greek_Peloponnese
0.3873656 0.3907471
Romaniote_Jew Orcadian
0.3913068 0.3913075
Libyan_Jew Roma_Bilbao
0.3949223 0.3951271

rxavierflima
03-21-2020, 12:49 PM
Muito obrigado! :)

(Mas o que quer dizer overfitted? lol

rxavierflima
03-21-2020, 12:51 PM
Se tirares Germanic, o João Paulo coincide mais com os outros 2, certo?

Já vi em qualquer lado que diferenciação celta vs germânico é duvidosa.

As populações de referência germanic são de que locais e séculos?

Ruderico
03-21-2020, 02:19 PM
Se tirares Germanic, o João Paulo coincide mais com os outros 2, certo?

Já vi em qualquer lado que diferenciação celta vs germânico é duvidosa.

As populações de referência germanic são de que locais e séculos?

Sim é muito complicado separar os dois, daí que o David tenha optado por fazer o tal PCA do Celtic VS Germanic que se foca na separação entre estes dois grupos partindo do pressuposto que os Irlandeses têm menos/pouco germânico e os Escandinavos os que mais têm (o que parece óbvio). São essencialmente populações com níveis de steppe alto, mas possivelmente as populações que deram origem a estes germânicos tinham um drift específico, e talvez (não me cites nisto, que eu não tenho a certeza) maior influência neolítica/mesolítica dos caçadores-recolectores próximos do Báltico, que era essencialmente inexistente aqui no Ocidente, inclusive nos Bell Beakers, etc, que são representam grande parte da ancestralidade das referências Ibéricas da Idade do Ferro e dos Gaélicos usados aqui.
Dando o meu caso como exemplo, o facto de eu aparentemente ter muito pouco drift germânico faz com que estas referências tenham sempre percentagens mínimas nos modelos, mas como a minha percentagem de steppe não é muito baixa o modelo compensa com outra referência qualquer, geralmente algo Beaker-like mais característico das antigas populações do Ocidente Europeu. Para certas pessoas parece acontecer o oposto, a tua mulher e a namorada do Lusitano aparentemente têm níveis acima da média deste possível drift, então o modelo atribui-lhes maior percentagem germânica e baixa ou a Ibérica ou a "Atlântica" (quando presente no modelo). O João Paulo também parece ter níveis apreciáveis disso, mas é difícil medir com um PCA.

A referência usada acima é uma Escandinava da Idade do Ferro, foram essencialmente com referências por volta do período Romano que usei. Se é uma boa referência ou não é sempre discutível. Queres que faça um modelo sem nada de germânico, com ou sem o gaélico?





Muito obrigado! :)

(Mas o que quer dizer overfitted? lol

Overfitting é basicamente quando o modelo que crias está "demasiado" próximo das referências usadas do que seria expectável, ou realista, e que não se volta a repetir da mesma forma quando mudas ligeiramente os dados devido por exemplo a ruído que possa existir nos diferentes conjuntos. Acho que é isso que acontece com a referência Gaélica, ela até pode ser boa mas aparentemente há algo nos dados que fazem com que o valor atribuído seja demasiado alto para o meu gosto (vê o meu caso). Se calhar uma imagem ajuda a explicar melhor o problema

https://media.geeksforgeeks.org/wp-content/cdn-uploads/20190523171258/overfitting_2.png

rxavierflima
03-21-2020, 08:59 PM
Estava a pensar em eliminar a componente germânica mantendo a gaélica ou então juntar as duas numa única gaelo-germânica.

Mas, pelo que percebo do que dizes, estes gaélicos estariam mais próximos dos ibéricos do que dos germânicos. Sendo assim não faz grande sentido a minha ideia.

Ruderico
03-22-2020, 01:55 PM
Não diria que estão mais próximos per se mas existem semelhanças devido a serem maioritariamente descendentes de antigas populações atlânticas e provavelmente terem mais WHG que outras amostras mais no interior da Europa, isso pode acabar por afectar um pouco as proporções que os modelos dão, daí que eu ache interessante ver o que acontece quando o Gaélico e o Germânico estão ambos presentes. O que eu eventualmente gostaria de ter era mais amostras da segunda metade da idade do Bronze e da primeira idade do Ferro de todo o Atlântico norte - desde o Sul de Portugal à Escócia

rxavierflima
03-25-2020, 01:26 PM
O PCA do ph2ter para comparação

36948

Estamos mais distanciados, parece-me.

Uma pergunta: se o João Paulo é o que "mais gosta da referência germânica", porque é que ele é o que aparece mais à esquerda, tanto no teu PCA como no do ph2ter?

Ruderico
03-25-2020, 01:42 PM
Esse é normal ou escalado? Um plot também depende sempre das referências que lhe dás, eu tento sempre incluir muitos Mediterrânicos não Europeus, não acho que ele use tantos quanto eu. Para muitos Europeus isso pouco importa, mas para nós aqui no sul a história é outra.

Fora isso não tenho a certeza, pode depender das referências usadas no nMonte (Germânica e não só), ou pode depender de só estarmos a ver 2 dimensões de algo que na realidade tem 25. Acontece a mesma coisa entre mim e a minha namorada, ela claramente fica com uma relativamente forte parcela germânica enquanto eu tenho virtualmente nada, no entanto eu estou mais na direção da Europa Ocidental que ela. Talvez por ela ter mais norte Africano e Levantino (apesar de este interferir com o "Romano"), por exemplo. Modelo anterior, sem Gaélico.


[1] "distance%=1.9592"

Ruderico

Iberia_IA,78.8
North_African,8.8
Rome_Imperial,8.8
Germanic_IA,2.6
Levant_Roman,1


[1] "distance%=1.5423"

MrsRuderico

Iberia_IA,65.2
Germanic_IA,11.2
North_African,11
Rome_Imperial,7
Levant_Roman,5.6

https://i.postimg.cc/KjMmJKjm/Sem-T-tulo.png


Edit: Uma coisa que também convém saber é que as amostras Ibéricas da Idade do Ferro são todas um bocado "Bascoides" e têm valores de WHG elevados, a maior parte delas são de povos não Indo-Europeus e as duas Celtiberas são do actual País Basco, daí que se acrescentarmos a referência Gaélica esta aparece muito pronunciada em alguns de nós (eu fico com 26%). Para já estou convencido que isto é consequência de diferenças dentro da península durante o período pre-Romano. Portanto o facto de um ter mais Iberia_IA e menos Germanico não implica necessariamente que vá plotar mais afastado da Europa Ocidental, pode ser apenas falta de variação/resolução nas referências Ibéricas pre-Romanas.

A consequência é que parte do Germânico que vemos nos modelos pode ser o algorítmo a tentar "desbasquizar" o modelo por causa do Iberia_IA (talvez, isto é especulação) apesar de isto acontecer mais para uns do que para outros. Se acrescentar a amostra de Hallstatt DA111 (supostamente Celta) no modelo acima vejam a diferença do Iberia_IA:


[1] "distance%=1.6226"

Ruderico

Hallstatt_Celt,61.4
Iberia_IA,22.4
North_African,9.6
Rome_Imperial,4
Levant_Roman,2.6


[1] "distance%=1.5205"

MrsRuderico

Iberia_IA,58.2
North_African,11.4
Hallstatt_Celt,10.6
Germanic_IA,8.2
Rome_Imperial,6
Levant_Roman,5.6



[1] "distance%=1.4266"

joaopauloflima23

Iberia_IA,58
North_African,12.4
Germanic_IA,12
Rome_Imperial,11.8
Levant_Roman,4.6
Hallstatt_Celt,1.2


[1] "distance%=1.6359"

telmodflima23

Hallstatt_Celt,64.2
Rome_Imperial,12.2
North_African,10.2
Iberia_IA,10
Levant_Roman,3.4

No entanto alguns de nós têm claramente maior proximidade a povos Germânicos, quer antigos quer modernos. Acho que não estou a ser controverso a dizer que podemos apontar o dedo a Suevos e Visigodos por esta variação. Já modelar com valores e segurança com estas ferramentas é complicado, não consigo dar um valor médio que me sinta confortável..pode ser 5% ou talvez 15%, quem sabe. Vou esperar por estudos profissionais.

Edit2: Por curiosidade aqui o mesmo para as referências Portuguesa e Galega. O Germânico continua presente, e até acho o valor plausível, mas sabe-se lá.


[1] "distance%=0.9202"

Portuguese

Iberia_IA,56.4
Hallstatt_Celt,11.2
North_African,10
Germanic_IA,9.2
Rome_Imperial,8
Levant_Roman,5.2


[1] "distance%=0.6966"

Spanish_Galicia

Iberia_IA,54.8
Hallstatt_Celt,14.8
North_African,9.4
Germanic_IA,8.2
Rome_Imperial,7
Levant_Roman,5.8

Sem Levante

[1] "distance%=0.8764"

Portuguese

Iberia_IA,55.4
Rome_Imperial,13.6
North_African,11
Germanic_IA,10.2
Hallstatt_Celt,9.8


[1] "distance%=0.6553"

Spanish_Galicia

Iberia_IA,54.4
Hallstatt_Celt,13.6
Rome_Imperial,13.4
North_African,10
Germanic_IA,8.6

Andour
03-25-2020, 11:21 PM
Caso alguém esteja interessado aqui: o G25 do meu genro, nascido em Melgaço, Minho, na fronteira entre Portugal e Galiza. Todos os seus antepassados conhecidos moravam em Parada do Monte ou nas aldeias do município.

AR_scaled,0.106994,0.148267,0.042615,0.003553,0.04 2469,-0.003347,-0.00047,0.003,0.025565,0.024055,-0.009581,0.005395,-0.009812,-0.010597,0.013708,0.00053,0.000652,-0.001014,-0.009176,0.003001,0.000749,-0.001607,0.000246,-0.001566,-0.007544

AR,0.0094,0.0146,0.0113,0.0011,0.0138,-0.0012,-0.0002,0.0013,0.0125,0.0132,-0.0059,0.0036,-0.0066,-0.0077,0.0101,0.0004,0.0005,-0.0008,-0.0073,0.0024,0.0006,-0.0013,0.0002,-0.0013,-0.0063


Y-Dna : R-P310*

MtDna : H1-T16189C!


Target: AR_scaled -- Distance: 2.4560% / 0.02456017

48.8 Anatolia_Barcin_N
33.2 Yamnaya_RUS_Samara
12.2 WHG
5.8 MAR_Taforalt

Target: AR_scaled -- Distance: 2.7547% / 0.02754745 | ADC: 0.25x

52.0 Anatolia_Barcin_N
33.8 Yamnaya_RUS_Samara
10.4 WHG
3.8 MAR_Taforalt

Ruderico
03-26-2020, 12:04 PM
Merci, Andour. Acrescentei o teu genro à minha lista de amostras Portuguesas no G25.


Por curiosidade corri os modelos anteriores para ele, parece ser mais germânico e menos mediterrânico que a média Portuguesa.

Primeiro um modelo básico pré-moderno só com Ibéria, Roma, Norte de África e Germânico.
Segundo também com Levante.
Terceiro com a referência Celta, sem Levante (não sei se ajuda muito).



[1] "distance%=1.2096"

AR

Iberia_IA,62.4
Germanic_IA,13.6
Rome_Imperial,13.6
North_African,10.4


[1] "distance%=1.2173"

AR

Iberia_IA,62.6
Germanic_IA,14.6
North_African,9.4
Rome_Imperial,6.8
Levant_Roman,6.6


[1] "distance%=1.1718"

AR

Iberia_IA,48.2
Hallstatt_Celt,17
Rome_Imperial,13.6
Germanic_IA,10.8
North_African,10.4

Igual para Portugal

[1] "distance%=0.8881"

Portuguese

Iberia_IA,62.6
Rome_Imperial,15.2
Germanic_IA,11.8
North_African,10.4


[1] "distance%=0.9426"

Portuguese

Iberia_IA,64.6
Germanic_IA,12
North_African,9.4
Rome_Imperial,8.2
Levant_Roman,5.8


[1] "distance%=0.8764"

Portuguese

Iberia_IA,55.4
Rome_Imperial,13.6
North_African,11
Germanic_IA,10.2
Hallstatt_Celt,9.8

Galiza

[1] "distance%=0.6771"

Spanish_Galicia

Iberia_IA,64.8
Rome_Imperial,15.4
Germanic_IA,10.4
North_African,9.4


[1] "distance%=0.74"

Spanish_Galicia

Iberia_IA,67.2
Germanic_IA,10.2
North_African,8.4
Rome_Imperial,8
Levant_Roman,6.2


[1] "distance%=0.6553"

Spanish_Galicia

Iberia_IA,54.4
Hallstatt_Celt,13.6
Rome_Imperial,13.4
North_African,10
Germanic_IA,8.6





https://i.postimg.cc/zXwWF7c9/AR.png

rxavierflima
03-26-2020, 09:04 PM
Esse é normal ou escalado?

Normal. Este é o escalado:

36970

Defski
03-30-2020, 09:44 PM
Boa noite a todos, recebi o G25 da minha mãe:

Regina_scaled,0.108132,0.14319,0.029415,-0.001615,0.037238,-0.001952,0.00282,-0.003692,0.022907,0.03426,-0.012666,0.003297,-0.012487,-0.013487,0.005972,0.013657,0.004824,-0.001267,-0.006662,-0.001126,0.007112,0.00136,-0.001725,-0.00253,0.000359
Regina,0.0095,0.0141,0.0078,-0.0005,0.0121,-0.0007,0.0012,-0.0016,0.0112,0.0188,-0.0078,0.0022,-0.0084,-0.0098,0.0044,0.0103,0.0037,-0.001,-0.0053,-0.0009,0.0057,0.0011,-0.0014,-0.0021,0.0003

Lusitano
04-01-2020, 12:16 AM
Boa noite a todos, recebi o G25 da minha mãe:

Regina_scaled,0.108132,0.14319,0.029415,-0.001615,0.037238,-0.001952,0.00282,-0.003692,0.022907,0.03426,-0.012666,0.003297,-0.012487,-0.013487,0.005972,0.013657,0.004824,-0.001267,-0.006662,-0.001126,0.007112,0.00136,-0.001725,-0.00253,0.000359
Regina,0.0095,0.0141,0.0078,-0.0005,0.0121,-0.0007,0.0012,-0.0016,0.0112,0.0188,-0.0078,0.0022,-0.0084,-0.0098,0.0044,0.0103,0.0037,-0.001,-0.0053,-0.0009,0.0057,0.0011,-0.0014,-0.0021,0.0003

De que região é a tua mãe?

Ruderico
04-01-2020, 11:19 AM
Boa noite a todos, recebi o G25 da minha mãe:

Regina_scaled,0.108132,0.14319,0.029415,-0.001615,0.037238,-0.001952,0.00282,-0.003692,0.022907,0.03426,-0.012666,0.003297,-0.012487,-0.013487,0.005972,0.013657,0.004824,-0.001267,-0.006662,-0.001126,0.007112,0.00136,-0.001725,-0.00253,0.000359
Regina,0.0095,0.0141,0.0078,-0.0005,0.0121,-0.0007,0.0012,-0.0016,0.0112,0.0188,-0.0078,0.0022,-0.0084,-0.0098,0.0044,0.0103,0.0037,-0.001,-0.0053,-0.0009,0.0057,0.0011,-0.0014,-0.0021,0.0003

Fiz a "análise do costume" aos dados da tua mãe. Os modelos são iguais ao que fiz com os dados do cunhado do nosso amigo Andour com a adição de um último que também tem a componente do Levante Romano.

Parece-me que com os dados da tua mãe o G25 tem alguns problemas com a parte Levantina/norte Africana que acabam por interferir uma na outra (Levantino muito alto, Magrebino muito baixo) - como se sabe os norte Africanos têm influência significativa do Médio Oriente, especialmente os que estão mais afastados do Atlântico. A adição desta componente parece sempre melhorar os modelos.

[1] "distance%=1.4159"

Regina

Iberia_IA,75.6
Rome_Imperial,19.4
North_African,5


[1] "distance%=1.3179"

Regina

Iberia_IA,77.6
Levant_Roman,12.4
Rome_Imperial,5.8
North_African,4.2


[1] "distance%=1.4161"

Regina

Iberia_IA,74.8
Rome_Imperial,19.2
North_African,5
Hallstatt_Celt,1


[1] "distance%=1.3284"

Regina

Iberia_IA,76.6
Levant_Roman,10.8
Rome_Imperial,7.8
North_African,4.2
Hallstatt_Celt,0.6



Para atenuar este efeito decidi substituir o North_African pelo mais convencional Guanche da alta Idade Média e ver o que acontece. Não parece fazer grande diferença, a percentagem sobe um pouco, mas nada do outro mundo..por vezes a fit até piora ligeiramente, talvez por a fonte do Levantino dela ser diferente (talvez algo com origem Sefardita em vez do norte de África?). Para além disto, parece que a tua mãe tem muito pouca afinidade com as populações Germânicas e Atlânticas/Celtas e maior com as da península Ibérica.
Tenho ideia que tu mesmo tinhas uma boa percentagem de Levantino nos modelos, bem como a mesma fraca afinidade com o resto da Europa Atlântica/Germânica no G25.

[1] "distance%=1.4117"

Regina

Iberia_IA,74.8
Rome_Imperial,18.6
Guanche_EMA,6.6


[1] "distance%=1.328"

Regina

Iberia_IA,76.2
Levant_Roman,10.6
Rome_Imperial,7.6
Guanche_EMA,5.6


[1] "distance%=1.4144"

Regina

Iberia_IA,74.2
Rome_Imperial,17.8
Guanche_EMA,6.6
Hallstatt_Celt,1.4


[1] "distance%=1.3345"

Regina

Iberia_IA,76.2
Levant_Roman,9.8
Rome_Imperial,6.8
Guanche_EMA,5.8
Hallstatt_Celt,1.4


https://i.postimg.cc/1RZTJ7Qp/regina.png



Zoom out para enquadramento
https://i.postimg.cc/44QNQNyZ/g25maior-ortogonal.png


Edit: Actualizei uma referência que estava errada. Ups.

Andour
04-01-2020, 12:37 PM
@ Ruderico

Você poderia postar a lista de amostras de referência do G25 usadas nos seus modelos acima, por favor? Qual é a mistura do Levant-Roman? É mais romano, mais levante, ou totalmente um ou outro? Quem são os ibéricos, os alemães e os celtas no seu modelo ? Obrigado.

Ruderico
04-01-2020, 12:55 PM
@ Ruderico

Você poderia postar a lista de amostras de referência do G25 usadas nos seus modelos acima, por favor? Qual é a mistura do Levant-Roman? É mais romano, mais levante, ou totalmente um ou outro? Quem são os ibéricos, os alemães e os celtas no seu modelo ? Obrigado.

Levant_Roman é apenas a referência Levantina do período Romano. É muito próxima dos Samaritanos modernos.
Os Ibéricos são os diferentes grupos do estudo do Olalde, todos da Idade do Ferro, metidos numa só categoria. Uns são Celtiberos, outros Iberos, outros nativos de Empuries. Deixo o modelo escolher o melhor para cada um.
O Germânico é o possível proto-Germânico de Levanluhta (outlier) que o Anglesqueville gosta de usar - e eu também.
E finalmente o "Celta" é a amostra DA111 de Hallstatt, datado de ~800BC (Bronze Final/Ferro Inicial). Não uso o DA112 porque tem mistura.

Isto usa tudo coordenadas regulares, eu não faço scaling nenhum.



Guanche_EMA,-0.00346,0.01294,-0.00062,-0.02128,0.01096,-0.01304,-0.01276,0.00358,0.03466,0.01676,0.00466,-0.004,0.01228,-0.01286,0.0171,-0.00984,0.00244,-0.01516,-0.03526,0.00832,-0.0108,-0.0305,0.01888,-0.00098,0.00386
North_African,-0.005963158,0.013357895,-0.000984211,-0.024810526,0.009926316,-0.013673684,-0.014247368,0.004268421,0.039957895,0.018736842,0. 005947368,-0.005673684,0.015889474,-0.014847368,0.015852632,-0.012289474,0.000347368,-0.022842105,-0.045942105,0.010221053,-0.016910526,-0.043484211,0.026542105,-0.003405263,0.007215789
Iberia_IA:Celtiberian,0.011,0.0141,0.01725,0.00355 ,0.01885,0.0012,-0.00145,0.00195,0.01275,0.0192,-0.00135,0.0059,-0.0114,-0.0062,0.0079,5e-05,-0.00635,7e-04,-1e-04,-6e-04,0.0066,0.0019,-0.00575,-0.0098,-0.0051
Iberia_IA:Iberian,0.0109375,0.0146625,0.014975,0.0 00675,0.01945,-0.0011375,-0.00155,0.0019375,0.0146625,0.025725,-0.0029,0.0074125,-0.0157125,-0.01055,0.0057875,0.00425,0.0052,0.001275,0.003025 ,-0.000825,0.0044625,-7.5e-05,-0.005975,-0.0102875,-0.0009375
Iberia_IA:Iberia_Northeast_Empuries_Local,0.0113,0 .014,0.0145333333333333,0.00636666666666667,0.0137 333333333333,0.00153333333333333,-0.0002,0.000966666666666666,0.0110666666666667,0.0 165,-0.0025,0.00826666666666667,-0.0143666666666667,-0.0154333333333333,0.00756666666666667,0.0043,0.00 513333333333333,-0.000166666666666667,0.00286666666666667,-0.00113333333333333,0.00526666666666667,0.00336666 666666667,-0.0026,-0.00506666666666667,0.00256666666666667
Germanic_IA,0.0119,0.012,0.0221,0.0224,0.0154,0.00 7,-0.004,0.0022,0.0056,7e-04,7e-04,0.0017,-0.0074,-0.0099,0.0255,0.0089,-0.0035,0.0013,0.0096,0.0155,3e-04,-0.001,-0.0038,-0.0017,0.0045
Rome_Imperial,0.0090229,0.0146708,-0.0062979,-0.0178188,0.0014208,-0.0072875,-0.0005688,-0.0021438,0.0002062,0.0106104,0.0019917,0.0015396,-0.0026375,-0.0011021,-0.0059188,-0.0013562,0.0028938,0.0004229,0.0010604,-0.0024729,-0.0019583,0.0015146,-0.0007271,-0.0004042,0.0004729
Hallstatt_Celt:DA111,0.0109,0.0149,0.0168,0.0081,0 .0142,0.0021,0.0005,0.001,0.0102,0.0134,-0.0076,0.0001,-0.0112,-0.0023,0.0108,-0.0072,-0.014,0.003,0.0047,0.0013,0.0079,0.0049,-0.0036,-0.0049,-0.0044
Levant_Roman,0.007675,0.014375,-0.015275,-0.02705,-0.0036,-0.009975,-0.003325,-0.003225,0.0038,0.007275,0.001675,-0.006475,0.00865,-0.001925,-0.007075,0.007725,0.0013,-0.000925,0.002075,0.00265,-2e-04,0.003625,-0.0029,-7e-04,-0.004



Se calhar as referências podem ser recalculadas com base em triagem/filtragem a partir das originais em vez de utilizar as que estão na lista original do David no Eurogenes, mas nunca me dei a esse trabalho. Isto era capaz de ser útil para a Romana Imperial, que me parece muito a sul.


https://i.postimg.cc/d0fBthxY/empuries-em-g25.png
Edit: This image and the previous list have been updated because of a mistake on the Iberian reference from Empuries.


https://i.postimg.cc/P5Kp5cSj/refs2-em-g25.png

Andour
04-01-2020, 01:06 PM
Muito obrigado.

Eu tenho outra pergunta. Na França, os arquivos municipais foram colocados online alguns anos atrás (para facilitar a pesquisa genealógica). É este o caso em Portugal? Se sim, alguém tem um link?

Ruderico
04-01-2020, 01:12 PM
Muito obrigado.

Eu tenho outra pergunta. Na França, os arquivos municipais foram colocados online alguns anos atrás (para facilitar a pesquisa genealógica). É este o caso em Portugal? Se sim, alguém tem um link?
De nada Andour.

Sim, está tudo disponível em www.tombo.pt só tens de escolher o distrito, concelho e freguesia.
Algumas freguesias só têm registos até ~1850, mas outras vão até 1500. É uma questão de sorte

Andour
04-01-2020, 01:23 PM
Sim, está tudo disponível em www.tombo.pt só tens de escolher o distrito, concelho e freguesia.
Algumas freguesias só têm registos até ~1850, mas outras vão até 1500. É uma questão de sorte

Copiado et armazenado... Obrigado, uma vez mais. Vai ser muito útil para mim, e minha família (estendida).

Andour
04-01-2020, 01:31 PM
Edit: There may be an issue with the Empuries reference, maybe excel messed up the negative signs while copying because all the coordinates are positive and they shouldn't be. It's definitely plotting in the wrong place.

Thanks for the notification. The Empuries sample isn't a problem - I can deal with him/it on my own : it is one of those that are closest to me on PCAs (as is Hallstatt DA111, by the way) , so we are well acquainted with each other.

Ruderico
04-01-2020, 01:46 PM
Thanks for the notification. The Empuries sample isn't a problem - I can deal with him/it on my own : it is one of those that are closest to me on PCAs (as is Hallstatt DA111, by the way) , so we are well acquainted with each other.

Just to be on the safe side, because I don't want people to copy mistaken data, I'll edit the previous one and post the update here.

This error might actually increase the Iberia_IA portion of some of us in these simple models, since it'll be quite good for a few individuals. For me it's useless. The closest matches are still the Celtiberian and the Hallstatt references, both are virtually at the same distance, and with very similar correlation, for whatever reason.
I find it very interesting where the old cline seemed to have been, very "northern" compared to us modern individuals.


Guanche_EMA,-0.00346,0.01294,-0.00062,-0.02128,0.01096,-0.01304,-0.01276,0.00358,0.03466,0.01676,0.00466,-0.004,0.01228,-0.01286,0.0171,-0.00984,0.00244,-0.01516,-0.03526,0.00832,-0.0108,-0.0305,0.01888,-0.00098,0.00386
North_African,-0.005963158,0.013357895,-0.000984211,-0.024810526,0.009926316,-0.013673684,-0.014247368,0.004268421,0.039957895,0.018736842,0. 005947368,-0.005673684,0.015889474,-0.014847368,0.015852632,-0.012289474,0.000347368,-0.022842105,-0.045942105,0.010221053,-0.016910526,-0.043484211,0.026542105,-0.003405263,0.007215789
Iberia_IA:Celtiberian,0.011,0.0141,0.01725,0.00355 ,0.01885,0.0012,-0.00145,0.00195,0.01275,0.0192,-0.00135,0.0059,-0.0114,-0.0062,0.0079,5e-05,-0.00635,7e-04,-1e-04,-6e-04,0.0066,0.0019,-0.00575,-0.0098,-0.0051
Iberia_IA:Iberian,0.0109375,0.0146625,0.014975,0.0 00675,0.01945,-0.0011375,-0.00155,0.0019375,0.0146625,0.025725,-0.0029,0.0074125,-0.0157125,-0.01055,0.0057875,0.00425,0.0052,0.001275,0.003025 ,-0.000825,0.0044625,-7.5e-05,-0.005975,-0.0102875,-0.0009375
Iberia_IA:Iberia_Northeast_Empuries_Local,0.0113,0 .014,0.0145333333333333,0.00636666666666667,0.0137 333333333333,0.00153333333333333,-0.0002,0.000966666666666666,0.0110666666666667,0.0 165,-0.0025,0.00826666666666667,-0.0143666666666667,-0.0154333333333333,0.00756666666666667,0.0043,0.00 513333333333333,-0.000166666666666667,0.00286666666666667,-0.00113333333333333,0.00526666666666667,0.00336666 666666667,-0.0026,-0.00506666666666667,0.00256666666666667
Germanic_IA,0.0119,0.012,0.0221,0.0224,0.0154,0.00 7,-0.004,0.0022,0.0056,7e-04,7e-04,0.0017,-0.0074,-0.0099,0.0255,0.0089,-0.0035,0.0013,0.0096,0.0155,3e-04,-0.001,-0.0038,-0.0017,0.0045
Rome_Imperial,0.0090229,0.0146708,-0.0062979,-0.0178188,0.0014208,-0.0072875,-0.0005688,-0.0021438,0.0002062,0.0106104,0.0019917,0.0015396,-0.0026375,-0.0011021,-0.0059188,-0.0013562,0.0028938,0.0004229,0.0010604,-0.0024729,-0.0019583,0.0015146,-0.0007271,-0.0004042,0.0004729
Hallstatt_Celt:DA111,0.0109,0.0149,0.0168,0.0081,0 .0142,0.0021,0.0005,0.001,0.0102,0.0134,-0.0076,0.0001,-0.0112,-0.0023,0.0108,-0.0072,-0.014,0.003,0.0047,0.0013,0.0079,0.0049,-0.0036,-0.0049,-0.0044
Levant_Roman,0.007675,0.014375,-0.015275,-0.02705,-0.0036,-0.009975,-0.003325,-0.003225,0.0038,0.007275,0.001675,-0.006475,0.00865,-0.001925,-0.007075,0.007725,0.0013,-0.000925,0.002075,0.00265,-2e-04,0.003625,-0.0029,-7e-04,-0.004


This is where it should plot with my current list of modern references
https://i.postimg.cc/d0fBthxY/empuries-em-g25.png

Andour
04-01-2020, 02:50 PM
I find it very interesting where the old cline seemed to have been, very "northern" compared to us modern individuals.

As concerns the Bronze age, I used to think that the distance between ancient and modern samples could be due to the social structure of the time : if newcomers from the north arrive with different funerary traditions, and, besides, supersede the locals without at first blending much with them, then their remains will be better preserved, in "aristocratic" tombs - and easier for modern archaeologists / geneticists to spot and analyse. Maybe the samples we have are from a sort of social supertstrate... Iberian patricians and plebs, sort of.

Problem : I find it strange that this state of affairs should have endured until the late Iron Age. Maybe the Roman conquest, besides adding in some genes of its own, had a levelling effect on the previous social structure, and led to people mixing on more egalitarian bases afterwards, regardless of previous "castes". Hence a resurgence of "farmer" admixture. (?)

Just food for thought...

JJJ
04-01-2020, 07:21 PM
Just to be on the safe side, because I don't want people to copy mistaken data, I'll edit the previous one and post the update here.


Podrías hacer algo de tu magia con unas coordenadas que tengo? es de un compa de otro foro. Tiene el yamnaya más elevado que he visto en un ibérico hasta ahora, debe ser algo germánico.

Si me dices que sí te paso las coordenadas por privado.

Estos son sus resultados del Davidski:

Distance: 3.7151% / 0.03715138
51.6 Anatolia_Barcin_N
35.2 Yamnaya_RUS_Samara
9.8 WHG
3.4 MAR_Iberomaurusian

Ruderico
04-01-2020, 07:39 PM
Sim, claro, não custa nada

Andour
04-01-2020, 10:20 PM
It's me again. No, don't worry, I do not intend to permanently "invade and settle" your Portuguese thread!

I just wanted to share my people's results with your (ie, Ruderico's) model. My own results are some distance away from those of the Portuguese forumers here. But I'm surprised how Iberian my wife is, and, by way of consequence, to a lesser degree, my daughter as well. My wife usually scores 13.6 % WHG. Maybe it "basqu-ifies" her a little. The strange thing is that her genealogical paper trail keeps her extremely local - pure "home-made" product.

Well, anyway, in case it is of interest to someone, here we go :

Aggregate off :

Target: Andour -- Distance: 1.6962% / 0.01696234
45.6 Hallstatt_Celt: DA111
25.6 Rome_Imperial
17.6 Iberia_IA:Iberia_Northeast_Empuries_Local
11.2 Germanic_IA

Target: AndourDaughter -- Distance: 1.8900% / 0.01890014
58.4 Iberia_IA:Iberia_Northeast_Empuries_Local
16.4 Rome_Imperial
12.6 Hallstatt_Celt: DA111
9.6 Germanic_IA
3.0 Levant_Roman

Target: AndourWife -- Distance: 1.5515% / 0.01551494
54.6 Iberia_IA:Iberia_Northeast_Empuries_Local
19.2 Rome_Imperial
10.2 Iberia_IA:Celtiberian
10.2 Iberia_IA:Iberian
5.8 Germanic_IA

Aggregate on :

Target: AndourWife -- Distance: 1.5515% / 0.01551494
75.0 Iberia_IA
19.2 Rome_Imperial
5.8 Germanic_IA

Ruderico
04-01-2020, 10:27 PM
The model is probably not right for ethnic French, you probably needed some sort of different references than the Iberian ones from the Iron Age. We really need a study of ancient France, although I wouldn't be surprised if ancient Gauls and the Hallstatt reference end up being rather similar. There's also the "Celt" from Empuries, which I left out

Nino90
04-02-2020, 07:06 AM
The model is probably not right for ethnic French, you probably needed some sort of different references than the Iberian ones from the Iron Age. We really need a study of ancient France, although I wouldn't be surprised if ancient Gauls and the Hallstatt reference end up being rather similar. There's also the "Celt" from Empuries, which I left out

May I ask what reference you used for Germanic Iron age?

Defski
04-03-2020, 08:49 PM
Ruderico obrigado pela tua análise, sim acontece o mesmo com o meu lado Levantino, após mais umas centenas de horas a pesquisar a minha genealogia lá descobri mais uma linha, do lado do meu pai, a família D´Elvas que como o nome indica no Século XIII já andava ali pelo Alentejo (Elvas e Olivença), um elemento dessa família casa com uma D. Gomes (família de cristãos novos de Elvas), o filho comete um crime em Olivença e é degredado para Penamacor (Castelo Branco)...
Do lado da minha mãe tenho um ramo de Aragão (Pina da Guarda), tudo isso confirma alguns dados que aparecem no G25 não esquecendo o ramo Galego típico da reconquista os descendentes lusos e um/uma ou outro escravo mourisco, a minha investigação continua :)

Defski
04-03-2020, 09:01 PM
De que região é a tua mãe?

A minha avó materna era da zona de Belmonte (Castelo Branco), o meu avô materno era da Ramela (Guarda), família Tavares/Leitão (Valhelhas e Gonçalo) e Pina (com fortes probabilidades de descender do ramo Pina da Guarda, família que veio de Aragão).

Ruderico
04-04-2020, 10:30 AM
Ruderico obrigado pela tua análise, sim acontece o mesmo com o meu lado Levantino, após mais umas centenas de horas a pesquisar a minha genealogia lá descobri mais uma linha, do lado do meu pai, a família D´Elvas que como o nome indica no Século XIII já andava ali pelo Alentejo (Elvas e Olivença), um elemento dessa família casa com uma D. Gomes (família de cristãos novos de Elvas), o filho comete um crime em Olivença e é degredado para Penamacor (Castelo Branco)...
Do lado da minha mãe tenho um ramo de Aragão (Pina da Guarda), tudo isso confirma alguns dados que aparecem no G25 não esquecendo o ramo Galego típico da reconquista os descendentes lusos e um/uma ou outro escravo mourisco, a minha investigação continua :)

Porreiro, mas também há que por as coisas em prespectiva, se tens um ou dois antepassados Cristãos Novos há 6 ou 7 gerações acaba por não fazer muita diferença :)
Eu até agora só encontrei Portugueses 'normais' na minha genealogia, a única excepção é uma mulher (curiosamente de Penamacor, para onde o teu foi degredado) com mãe de apelido do norte de Aragão, Betes. Mas isto foi há 10 gerações ou algo do género. O que vi muito em Penamacor foram militares, isto no início de 1700, finais de 1600.

luasits
08-01-2020, 03:40 PM
Recebi as minhas coordenadas do G25, mas não sei bem como usar isto. Alguém me pode ajudar?

luasits_scaled,0.100164,0.152329,0.041106,-0.001292,0.045547,0.00251,-0.000705,0.007615,0.032519,0.024602,-0.006171,0.006145,-0.011447,-0.013487,0.016829,-0.015646,-0.017341,-0.000633,-0.008673,-0.000125,0.005241,-0.00507,0.006039,-0.009158,-0.005868

luasits,0.0088,0.015,0.0109,-0.0004,0.0148,0.0009,-0.0003,0.0033,0.0159,0.0135,-0.0038,0.0041,-0.0077,-0.0098,0.0124,-0.0118,-0.0133,-0.0005,-0.0069,-0.0001,0.0042,-0.0041,0.0049,-0.0076,-0.0049

Target: luasits_scaled
Distance: 4.9745% / 0.04974507
43.8 Anatolia_Barcin_N
27.6 Yamnaya_RUS_Samara
13.6 WHG
7.8 Anatolia_Tepecik_Ciftlik_N
7.2 MAR_Taforalt

Target: luasits_scaled
Distance: 1.9784% / 0.01978388
45.6 Spanish_Castilla_Y_Leon
37.2 Spanish_Canarias
14.2 Spanish_Asturias
3.0 Polish

Ruderico
08-02-2020, 01:08 PM
Recebi as minhas coordenadas do G25, mas não sei bem como usar isto. Alguém me pode ajudar?

luasits_scaled,0.100164,0.152329,0.041106,-0.001292,0.045547,0.00251,-0.000705,0.007615,0.032519,0.024602,-0.006171,0.006145,-0.011447,-0.013487,0.016829,-0.015646,-0.017341,-0.000633,-0.008673,-0.000125,0.005241,-0.00507,0.006039,-0.009158,-0.005868

luasits,0.0088,0.015,0.0109,-0.0004,0.0148,0.0009,-0.0003,0.0033,0.0159,0.0135,-0.0038,0.0041,-0.0077,-0.0098,0.0124,-0.0118,-0.0133,-0.0005,-0.0069,-0.0001,0.0042,-0.0041,0.0049,-0.0076,-0.0049

Olá luasits, obrigado por partilhares as tuas coordenadas connosco.

Essas coordenadas são o produto de um PCA (principal component analysis (https://en.wikipedia.org/wiki/Principal_component_analysis)) tenta estruturar e organizar dados, neste caso os teus dados brutos genéticos, num sistema de 25 coordenadas com base num painel de referências definido pelo autor, o David do Eurogenes. Não vais encontrar um único estudo de genética de populações que não inclua este tipo de informação, é a melhor ferramenta que se dispõe para tentar visualizar dados genéticos de várias referências. Este PCA usou exactamente a mesma metodologia que vês em qualquer estudo profissional (na prática é só usar programas disponíveis publicamente e escolher referências/dimensões), a consequência é que a projecção destes dados é virtualmente igual àquela que vês em estudos, assumindo que as populações presentes são idênticas.
No caso da península Ibérica podes de certa forma interpretar o nosso cluster num PCA com base em dois eixos, um que vai na direcção do Norte de Itália até ao País Basco, e outra que vai na direcção de França até à Sardenha (ou Canárias).

O que já não é tão consensual é a forma de modelar ancestralidade usando coordenadas de um PCA. Aqui usa-se o Método de Monte Carlo, mas ainda assim os resultados parecem ser muito decentes comparados com os métodos usados em estudos científicos que estão fora do alcance de amadores. Há uns meses saiu um estudo que fez algo muito semelhante, mas com resultados de ADMIXTURE, o que na prática é o mesmo que os resultados dos Oralces do K13/K15 do Eurogenes. O problema é que esses testes que fazes no GedMatch estão muito desactualizados, comparados com o G25 têm pouco interesse.

Algo que as pessoas tendem a desconhecer, ou ignorar, é que o Método de Monte Carlo tem muita tendência para sobreajustar resultados (overfitting) especialmente quando usadas muitas referências que são semelhantes, o que pode ser interpretado como partilhando origens próximas. É isso que está a acontecer nesse segundo modelo que te meteste aí, essas três referências Espanholas são muito semelhantes umas às outras e o modelo acaba por não ter muito interesse. O criador do nMonte (ele também está neste fórum) sugere sempre que se usem poucas referências, e de preferência o mais distinctas possível, para se evitar este efeito, mas infelizmente quando se tenta modelar Europeus existe sempre o risco de os resultados sofrerem disto.
Para teres uma ideia do que é o overfitting acho que estas imagens ajudam:
https://miro.medium.com/proxy/1*e4Kn-_M_KN2bw-e6kevywA.png
https://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/1/19/Overfitting.svg/1200px-Overfitting.svg.png - overfitting a verde


As ferramentas que usamos aqui são de 2 tipos:

Uma é a de projecção de dados de um PCA, o Past4 ( https://folk.uio.no/ohammer/past/ ). Neste programa tens de pôr uma lista de referências mundiais - aconselho essencialmente do Oeste Euroasiático - e fazes as projecções de dados. Esta ferramenta dá jeito porque dá-te uma ideia geral do perfil genético das amostras que estás a analisar, e ao mudares/encurtares a lista de referências podes tentar encontrar maior ou menor relação entre várias, que pode ser mais difícil de analisar quando tens algumas milhares de referências no painel. Também podes usar o Vahaduo, que eu nunca uso https://vahaduo.github.io/custompca/
Aqui tens uma projecção de populações do Oeste Asiático. Meti um círculo a preto com o Sudoeste Europeu, bem como dois eixos aproximados nos quais as populações de Península Ibérica variam https://i.postimg.cc/DZQBXQNs/pcaweurasia.png

Aqui uma aproximação na península Ibérica, contigo incluída
https://i.postimg.cc/fT70mzDG/luasits.png
Podes ver que, tal como eu, tendes muito na direcção do país Basco - isto sugere menor influência mediterrânica do que na maioria dos Portugueses - mas estás muito mais próxima de França do que eu (French_South são virtualmente Bascos). Geralmente isto é devido a maior percentagem de ancestralidade das Estepes, mas pode não ser esse o caso. Se tiveres mais drift Escandinavo (proxy para influência germânica/Sueva) acabas por também ver este efeito. Estimar a percentagem de Germânico em cada um de nós é muito difícil, o Davidski fez um PCA para este tipo de drift ( https://eurogenes.blogspot.com/2018/09/celtic-vs-germanic-europe.html ) mas não é 100% fiável para nós.


A outra ferramenta é para criar modelos, todas usam o Método de Monte Carlo e foram criadas ou baseadas no trabalho do Huijbregts. Tal como acima podes usar o vahaduo ( https://vahaduo.github.io/vahaduo/ ) mas eu uso directamente o nMonte3 no R. Podes ler sobre isso aqui https://anthrogenica.com/showthread.php?6452-How-to-Use-nMonte
Simplificando basta fazer o download do R, e na mesma pasta teres um ficheiro (até pode ser em .txt) com as tuas coordenadas, e outra com as coordenadas das referências que queres usar nos modelos. Em .txt o formato tem de ser igual a este

,PC1,PC2,PC3,PC4,PC5,PC6,PC7,PC8,PC9,PC10,PC11,PC1 2,PC13,PC14,PC15,PC16,PC17,PC18,PC19,PC20,PC21,PC2 2,PC23,PC24,PC25
luasits,0.0088,0.015,0.0109,-0.0004,0.0148,0.0009,-0.0003,0.0033,0.0159,0.0135,-0.0038,0.0041,-0.0077,-0.0098,0.0124,-0.0118,-0.0133,-0.0005,-0.0069,-0.0001,0.0042,-0.0041,0.0049,-0.0076,-0.0049

Tens aqui uns modelos simples baseados nas referências que eu usei uns posts acima, já há uns meses.

,PC1,PC2,PC3,PC4,PC5,PC6,PC7,PC8,PC9,PC10,PC11,PC1 2,PC13,PC14,PC15,PC16,PC17,PC18,PC19,PC20,PC21,PC2 2,PC23,PC24,PC25
North_African,-0.005963158,0.013357895,-0.000984211,-0.024810526,0.009926316,-0.013673684,-0.014247368,0.004268421,0.039957895,0.018736842,0. 005947368,-0.005673684,0.015889474,-0.014847368,0.015852632,-0.012289474,0.000347368,-0.022842105,-0.045942105,0.010221053,-0.016910526,-0.043484211,0.026542105,-0.003405263,0.007215789
Iberia_IA:Celtiberian,0.010633333,0.0141,0.0167333 33,0.0042,0.018566667,0.001266667,-0.0024,0.0033,0.0139,0.019,-0.0001,0.005266667,-0.013833333,-0.0088,0.005566667,-0.0035,-0.0057,0.0027,0.002166667,-0.000533333,0.005666667,0.005533333,-0.006533333,-0.003966667,-0.003866667
Iberia_IA:Iberian,0.0109375,0.0146625,0.014975,0.0 00675,0.01945,-0.0011375,-0.00155,0.0019375,0.0146625,0.025725,-0.0029,0.0074125,-0.0157125,-0.01055,0.0057875,0.00425,0.0052,0.001275,0.003025 ,-0.000825,0.0044625,-7.5e-05,-0.005975,-0.0102875,-0.0009375
Iberia_IA:Iberia_Northeast_Empuries_Local,0.0113,0 .014,0.0145333333333333,0.00636666666666667,0.0137 333333333333,0.00153333333333333,-0.0002,0.000966666666666666,0.0110666666666667,0.0 165,-0.0025,0.00826666666666667,-0.0143666666666667,-0.0154333333333333,0.00756666666666667,0.0043,0.00 513333333333333,-0.000166666666666667,0.00286666666666667,-0.00113333333333333,0.00526666666666667,0.00336666 666666667,-0.0026,-0.00506666666666667,0.00256666666666667
Germanic_IA,0.0119,0.012,0.0221,0.0224,0.0154,0.00 7,-0.004,0.0022,0.0056,7e-04,7e-04,0.0017,-0.0074,-0.0099,0.0255,0.0089,-0.0035,0.0013,0.0096,0.0155,3e-04,-0.001,-0.0038,-0.0017,0.0045
Rome_Imperial,0.0090229,0.0146708,-0.0062979,-0.0178188,0.0014208,-0.0072875,-0.0005688,-0.0021438,0.0002062,0.0106104,0.0019917,0.0015396,-0.0026375,-0.0011021,-0.0059188,-0.0013562,0.0028938,0.0004229,0.0010604,-0.0024729,-0.0019583,0.0015146,-0.0007271,-0.0004042,0.0004729


[1] "distance%=1.7775"

luasits

Iberia_IA,78.6
North_African,15
Germanic_IA,3.8
Rome_Imperial,2.6


[1] "distance%=1.7536"

Ruderico

Iberia_IA,77.6
Rome_Imperial,11
North_African,10
Germanic_IA,1.4


[1] "distance%=0.6941"

Portuguese

Iberia_IA,65.4
Rome_Imperial,15
North_African,11.8
Germanic_IA,7.8


Curiosamente se eu meter a referência Celta de Hallstatt o teu modelo melhora imenso. Isto também acontece com alguns de nós, eu inclusive. Isto não é necessariamente real, é apenas o efeito de overfitting outra vez. A amostra DA111 é muito boa para nós os dois.

,PC1,PC2,PC3,PC4,PC5,PC6,PC7,PC8,PC9,PC10,PC11,PC1 2,PC13,PC14,PC15,PC16,PC17,PC18,PC19,PC20,PC21,PC2 2,PC23,PC24,PC25
Rome_Imperial,0.0090229,0.0146708,-0.0062979,-0.0178188,0.0014208,-0.0072875,-0.0005688,-0.0021438,0.0002062,0.0106104,0.0019917,0.0015396,-0.0026375,-0.0011021,-0.0059188,-0.0013562,0.0028938,0.0004229,0.0010604,-0.0024729,-0.0019583,0.0015146,-0.0007271,-0.0004042,0.0004729
Iberia_IA:Iberia_North_IA,0.010633333,0.0141,0.016 733333,0.0042,0.018566667,0.001266667,-0.0024,0.0033,0.0139,0.019,-0.0001,0.005266667,-0.013833333,-0.0088,0.005566667,-0.0035,-0.0057,0.0027,0.002166667,-0.000533333,0.005666667,0.005533333,-0.006533333,-0.003966667,-0.003866667
Iberia_IA:Iberian,0.0109375,0.0146625,0.014975,0.0 00675,0.01945,-0.0011375,-0.00155,0.0019375,0.0146625,0.025725,-0.0029,0.0074125,-0.0157125,-0.01055,0.0057875,0.00425,0.0052,0.001275,0.003025 ,-0.000825,0.0044625,-7.5e-05,-0.005975,-0.0102875,-0.0009375
Iberia_IA:Iberia_Northeast_Empuries_Local,0.0113,0 .014,0.0145333333333333,0.00636666666666667,0.0137 333333333333,0.00153333333333333,-0.0002,0.000966666666666666,0.0110666666666667,0.0 165,-0.0025,0.00826666666666667,-0.0143666666666667,-0.0154333333333333,0.00756666666666667,0.0043,0.00 513333333333333,-0.000166666666666667,0.00286666666666667,-0.00113333333333333,0.00526666666666667,0.00336666 666666667,-0.0026,-0.00506666666666667,0.00256666666666667
Germanic_IA,0.0119,0.012,0.0221,0.0224,0.0154,0.00 7,-0.004,0.0022,0.0056,7e-04,7e-04,0.0017,-0.0074,-0.0099,0.0255,0.0089,-0.0035,0.0013,0.0096,0.0155,3e-04,-0.001,-0.0038,-0.0017,0.0045
North_African,-0.005963158,0.013357895,-0.000984211,-0.024810526,0.009926316,-0.013673684,-0.014247368,0.004268421,0.039957895,0.018736842,0. 005947368,-0.005673684,0.015889474,-0.014847368,0.015852632,-0.012289474,0.000347368,-0.022842105,-0.045942105,0.010221053,-0.016910526,-0.043484211,0.026542105,-0.003405263,0.007215789
Celtic:CZE_Hallstatt_Bylany:DA111,0.0109,0.0149,0. 0168,0.0081,0.0142,0.0021,0.0005,0.001,0.0102,0.01 34,-0.0076,0.0001,-0.0112,-0.0023,0.0108,-0.0072,-0.014,0.003,0.0047,0.0013,0.0079,0.0049,-0.0036,-0.0049,-0.0044

[1] "distance%=1.2744"

luasits

Celtic,69.4
Iberia_IA,15
North_African,14.2
Rome_Imperial,1.4


[1] "distance%=1.5176"

Ruderico

Celtic,46.8
Iberia_IA,35
North_African,10.4
Rome_Imperial,7.8


[1] "distance%=0.6905"

Portuguese

Iberia_IA,58.6
Rome_Imperial,15.2
North_African,11.8
Celtic,8
Germanic_IA,6.4
Se juntar a referência Celta e a Ibérica da Idade do Ferro numa só ficas com este resultado

[1] "distance%=1.2507"

luasits

Iberia_IA+Hallstatt,84
North_African,14.8
Rome_Imperial,1.2


[1] "distance%=1.5186"

Ruderico

Iberia_IA+Hallstatt,82
North_African,10.4
Rome_Imperial,7.6


[1] "distance%=0.6929"

Portuguese

Iberia_IA+Hallstatt,68
Rome_Imperial,14.2
North_African,11.8
Germanic_IA,6



Reparei que o modelo do Davidski te deu um pouco de Polaco. Se eu usar referências antigas Eslavas realmente ficas com um pouco, mas é difícil dizer se é real ou overfitting. Percentagens pequenas não são muito fiáveis, existe sempre alguma margem para erro que estas ferramentas não mostram

[1] "distance%=1.8403"

luasits

Iberia_IA,80
North_African,12
Rome_Imperial,3
HUN_Avar_Szolad,2
Germanic_IA,1.8
CZE_Early_Slav,1.2



Edit: Meti mais um modelo.
Também tens aqui as listas de amostras disponíveis https://bga101.blogspot.com/2019/07/getting-most-out-of-global25.html para criares os teus próprios, se quiseres.

JJJ
08-02-2020, 03:56 PM
Target: luasits_scaled
Distance: 4.9745% / 0.04974507
43.8 Anatolia_Barcin_N
27.6 Yamnaya_RUS_Samara
13.6 WHG
7.8 Anatolia_Tepecik_Ciftlik_N
7.2 MAR_Taforalt

Target: luasits_scaled
Distance: 1.9784% / 0.01978388
45.6 Spanish_Castilla_Y_Leon
37.2 Spanish_Canarias
14.2 Spanish_Asturias
3.0 Polish

https://3.bp.blogspot.com/-mKVhtvkfhfg/WzqX8vDYdrI/AAAAAAAAG9M/POT3ZFftk9Yv93-kexhnLFZd98tn6_qLwCK4BGAYYCw/s113/Yuezi_statue.jpg

:biggrin1:

Ruderico
08-02-2020, 06:31 PM
Tens de facto resultados interessantes.
O teu norte Africano é claramente superior à média (a minha namorada tem valores próximos aos teus, a família dela é de Idanha/Monsanto), mas por outro lado parece que herdaste muito pouco do centro/leste do Mediterrâneo como se pode ver pelas baixas percentagens que recebes das amostras Romanas. Não sei se isto será real ou apenas o modelo a ficar sobreajustado..se é a 2ª hipótese é a primeira vez que vejo isso acontecer com estas duas referências. Dizes que tens muitos matches Judeus, pode ser que tenha algo que ver com isto, mas nesse caso estaria à espera de ver essa parcela mediterrânica ser mais elevada, talvez a excepção seria se esse antepassado fosse parcialmente de outra parte da Europa. O Davidski meteu-te Polaco no modelo, a referência Eslava não parece ser má para ti, não me parece impossível teres um antepassado meio-Ashkenazi, meio-centro/leste Europeu mas isto é pura expeculação. Também tens uma grande afinidade com as referências pré-Romanas da península Ibérica, o que já era de esperar pelos teus resultados no K15 (Atlantic alto costuma dar nisto). De certeza que vais ver imensas vezes Bascos aparecerem-te nos modelos, a mim também acontece.

Tens muitos matches com pessoas não-judaicas que não sejam da península Ibérica?
No PCA estás tão próxima de França que nem ficaria espantado se tivesses um antepassado não muito distante estrangeiro. A minha namorada tem valores de norte Africano semelhantes aos teus, tem algum drift Escandinavo, mas ainda assim fica muito longe de ti e do cluster Francês.
Também pode ser apenas variação pessoal/local, nós Portugueses estamos longe de ser perfeitamente homogéneos - nenhum povo é

Luso
08-02-2020, 10:48 PM
os meus resultados

Luso_scaled,0.095611,0.144205,0.040352,-0.001292,0.037238,-0.006972,-0.003055,0.004615,0.030065,0.028793,0.000162,-0.000599,-0.015312,-0.00867,0.005836,-0.017369,-0.011604,-0.002534,-0.004022,-0.006503,0.007487,-0.004699,0,-0.002048,-0.003473

Luso,0.0084,0.0142,0.0107,-0.0004,0.0121,-0.0025,-0.0013,0.002,0.0147,0.0158,0.0001,-0.0004,-0.0103,-0.0063,0.0043,-0.0131,-0.0089,-0.002,-0.0032,-0.0052,0.006,-0.0038,0,-0.0017,-0.0029


Target: Luso_scaled
Distance: 4.2500% / 0.04249988
49.6 Anatolia_Barcin_N
28.4 Yamnaya_RUS_Samara
11.2 WHG
5.6 MAR_Taforalt
4.0 Anatolia_Tepecik_Ciftlik_N
1.2 Dinka

luasits
08-02-2020, 11:33 PM
Tens de facto resultados interessantes.
O teu norte Africano é claramente superior à média (a minha namorada tem valores próximos aos teus, a família dela é de Idanha/Monsanto), mas por outro lado parece que herdaste muito pouco do centro/leste do Mediterrâneo como se pode ver pelas baixas percentagens que recebes das amostras Romanas. Não sei se isto será real ou apenas o modelo a ficar sobreajustado..se é a 2ª hipótese é a primeira vez que vejo isso acontecer com estas duas referências. Dizes que tens muitos matches Judeus, pode ser que tenha algo que ver com isto, mas nesse caso estaria à espera de ver essa parcela mediterrânica ser mais elevada, talvez a excepção seria se esse antepassado fosse parcialmente de outra parte da Europa. O Davidski meteu-te Polaco no modelo, a referência Eslava não parece ser má para ti, não me parece impossível teres um antepassado meio-Ashkenazi, meio-centro/leste Europeu mas isto é pura expeculação. Também tens uma grande afinidade com as referências pré-Romanas da península Ibérica, o que já era de esperar pelos teus resultados no K15 (Atlantic alto costuma dar nisto). De certeza que vais ver imensas vezes Bascos aparecerem-te nos modelos, a mim também acontece.

Tens muitos matches com pessoas não-judaicas que não sejam da península Ibérica?
No PCA estás tão próxima de França que nem ficaria espantado se tivesses um antepassado não muito distante estrangeiro. A minha namorada tem valores de norte Africano semelhantes aos teus, tem algum drift Escandinavo, mas ainda assim fica muito longe de ti e do cluster Francês.
Também pode ser apenas variação pessoal/local, nós Portugueses estamos longe de ser perfeitamente homogéneos - nenhum povo é

Sim, vejo muitas vezes Basco nos meus resultados. Tenho matches de pessoas com sobrenomes que dizem ser origem Ashkenazi e alguns Sefarditas (ex: Solomon, Brahm e Levy), de resto são da Europa do Norte (principalmente suecos), alemães, polacos, ucranianos, russos e britânicos. Também tenho alguns holandeses e italianos. Encontrei alguns do Iraque, Israel e da Turquia mas provavelmente não temos nada relacionado. De resto, são uns poucos norte-africanos (Marrocos e Tunísia), latino-americanos e franceses como já era de esperar porque a minha família emigrou para o Brasil e para a França durante anos. O que mais me surpreende é a quantidade de matches da Europa do Norte e da Polónia.

O único teste de ADN que eu fiz foi do MyHeritage e tenho 5,2 de Finlandesa e 1,5 de Judia Ashkenazi mas sinceramente não confio muito nesse teste. Nas calculadoras realmente quase sempre tenho uma pequena percentagem de eslavo/báltico.

Ruderico
08-11-2020, 02:36 PM
os meus resultados

Luso_scaled,0.095611,0.144205,0.040352,-0.001292,0.037238,-0.006972,-0.003055,0.004615,0.030065,0.028793,0.000162,-0.000599,-0.015312,-0.00867,0.005836,-0.017369,-0.011604,-0.002534,-0.004022,-0.006503,0.007487,-0.004699,0,-0.002048,-0.003473

Luso,0.0084,0.0142,0.0107,-0.0004,0.0121,-0.0025,-0.0013,0.002,0.0147,0.0158,0.0001,-0.0004,-0.0103,-0.0063,0.0043,-0.0131,-0.0089,-0.002,-0.0032,-0.0052,0.006,-0.0038,0,-0.0017,-0.0029


Target: Luso_scaled
Distance: 4.2500% / 0.04249988
49.6 Anatolia_Barcin_N
28.4 Yamnaya_RUS_Samara
11.2 WHG
5.6 MAR_Taforalt
4.0 Anatolia_Tepecik_Ciftlik_N
1.2 Dinka

PCA plots outra vez

https://i.postimg.cc/y6RxzfyX/pca.png

38929

Ruderico
09-02-2020, 01:17 PM
O Capitalis tentou uma metodologia para tentar explorar diferentes tipos de ancestralidade nas ilhas Britânicas, e eu decidi aplicar a mesma à península Ibérica. A ideia inicial dele era usar plots de LDAs para visualizar clusters, mas aqui isso não funciona bem e acaba tudo junto sem dar para distinguir nada. Como não estou para traduzir tudo, vou meter aqui uma cópia do que postei nesse tópico.



I had free time so I decided to give this exercise a try, the goal was to try and split Portuguese, and/or Iberians, into different groups. Naturally Basques are one of then, but I wanted to try and split the core of continental Iberians into different groups.
As such I included all populations from Western Europe, both north and south, and excluded Scandinavians (which might have been a mistake, but hey-ho). Unfortunately I had this dataset a long time ago and it did not contain the different French regions, it's still the old G25 French samples. Sorry.

I grouped Iberian samples into three categories, Basque (green), Spanish (gold) and 'Portugalician' (blue) - Portuguese+Galicians on the account of them being very close, and relatively numerous within the dataset. I could have also included a Catalan one, but ultimately decided not to.
Since there was a larger pool of different populations to select from I increased the number of clusters from 10 to 15.

For the most part Iberia formed 4 clusters, with a few individuals being clustered into minor/mostly foreign clusters for whatever reason. Cluster 8 was overwhelmingly Basque, the others were clusters 6, 10, and 15. There's also a small cluster 7 that is Catalan.
6 was mostly Catalan-speaking Spanish, with a few Portugalicians (more Portuguese than Galicians), even fewer French and Bergamo individuals, one South French and one Basque.
10 also included a French, a South French, and a Basque.
15 included one Basque and a Tuscan.

The LDA plot was a bit disappointing, clusters basically overlap each other and the plot says almost nothing I wanted to explore. Cluster 8 ends up a bit further away since they are Basques anyway. Again rather underwhelming.
https://i.postimg.cc/yss23fYZ/lda.png
https://i.postimg.cc/ZYb0C17q/lda1.png


What's potentially more informative is the PCA plot. For the most part each cluster ends up plotting somewhat independently and doesn't overlap excessively so with each other
https://i.postimg.cc/LH0323Nw/pca.png
https://i.postimg.cc/9m6PqF3B/pca1.png

If I had to make a guess, what we're seeing here is basically a split of continental Iberians into different groups on account of their proportions of ancient ancestry, naturally forming a cline.
Cluster 15 seems the more typically southern group, closer to Italy.
Cluster 6 appears more intermediate, or central. Since it includes many Catalans, French and NW Italians it may include a bit more Germanic-related ancestry than other clusters.
Cluster 10 plots close (or with) Basques and I'd say is the more strongly non-Basque Iberian cluster.
7 would be the more typical Catalan, or French-related, cluster within Iberia.

Ruderico
09-27-2020, 07:46 AM
Foram publicadas uma série de amostras do período Viking no G25, e como seria de esperar são bastante heterogéneas devido ao fluxo de escravos e produtos de casamentos mistos que ocorreram nesta época, até porque muitas das amostras nem sequer são Escandinavas. Para aqui o que me chamou a atenção são amostras, anteriores a esta época, das ilhas Orkney na costa norte da Escócia. Sendo anteriores ao período Viking serão quase certamente Pictos. Ao olhar para as amostras reparei que eram bastante semelhantes a amostras Gaelicas da Islândia, já do período Viking da ilha, que também estão disponíveis no G25.

Decidi então fazer uma pequena experiência que publiquei na secção Francesa, e que vou postar aqui também, mas com umas ligeiras alterações nomeadamente que vou acrescentar uma referência Levantina que vai fazer overfitting com a Romana, mas paciência. Vou também usar a média dos Guanches em vez de uma referência construída com Berberes modernos com menor percentagem de influência não-local.

Vou postar um modelo-base e depois vou acrescentar referências: primeiro a média das amostras "Gaélicas", depois dos "Pictos" e finalmente os dois juntos.
O objectivo aqui é ver como todas as componentes variam à medida que são acrescentadas novas.


[1] "distance%=0.8372"

Portuguese

Iberia_IA,64.2
Berber_EMA,11.2
Germanic_IA,10.8
Rome_Imperial,8.8
Levant_Roman,5


[1] "distance%=0.7035"

Portuguese

Iberia_IA,60.4
Berber_EMA,11
Iceland_Gaelic,10.4
Rome_Imperial,8.4
Levant_Roman,5
Germanic_IA,4.8


[1] "distance%=0.7308"

Portuguese

Iberia_IA,60.8
Berber_EMA,11.4
Orkney_Pict,9
Rome_Imperial,7.2
Germanic_IA,6.2
Levant_Roman,5.4


[1] "distance%=0.6899"

Portuguese

Iberia_IA,59.8
Berber_EMA,11
Iceland_Gaelic,8.2
Rome_Imperial,7.4
Levant_Roman,5.4
Orkney_Pict,4.4
Germanic_IA,3.8


Há coisas que me parecem muito claras, nomeadamente que estas amostras ajudam imenso o modelo, basta ver como as distâncias caíram de ~0.84 para ~0.69 o que é uma melhoria relativa bastante significativa.

Já se sabia que as amostras de La Hoya (link (https://en.wikipedia.org/wiki/La_Hoya,_Alava)) eram um bocado vascóides, apesar de serem de um contexto e cultura Celta ou Celtibera, o que iria supor que o modelo fosse necessitar de algo mais para compensar essa tendência deles. As restantes Ibéricas poderiam ajudar, mas parecia sempre que faltava algo.
Normalmente este vazio era preenchido pela referência germânica, mas estas de tendência atlântica parece que fazem o trabalho muito melhor, dando ainda espaço para uma componente Germânica pequena mas clara. Estas amostras reduzem não só as percentagens da referência germânica como da nativa Ibérica. Para mim isto significa duas coisas:
1) Há algo em falta na variação genética das amostras Ibéricas da Idade do Ferro do estudo do Olalde, isso pode não ser problemático para a maior parte de Espanha, mas para Portugal e para o ocidente peninsular provavelmente é.
2) A influência germânica continua presente apesar destas amostras Gaélicas/Pictas plotarem muito a "norte", porque certamente é real. Valores desta ordem de grandeza fazem supor que haja pessoas que tenham herdado pouco, e que o modelo não capte também devido a overfitting. Este é provavelmente o meu caso.


Considerando que estas novas amostras estão apenas a captar variação pré-romana, e que a Levantina e Romana são complementares e chegaram na mesma altura, junto-as todas em componentes novas e deixo um modelo agregado simplificado.


[1] "distance%=0.6865"

Portuguese

NW_Iberia_IA,71.4
Roman_Colonial,13.2
Berber_EMA,11.2
Germanic,4.2


[1] "distance%=0.566"

Spanish_Galicia

NW_Iberia_IA,74.6
Roman_Colonial,11.8
Berber_EMA,10.8
Germanic,2.8


[1] "distance%=0.7804"

Spanish_Castilla_Y_Leon

NW_Iberia_IA,79.4
Roman_Colonial,10.8
Berber_EMA,9.8


[1] "distance%=1.5266"

Spanish_Asturias

NW_Iberia_IA,86.2
Berber_EMA,8.8
Roman_Colonial,5


Algumas runs de indivíduos, se tiverem interesse no vosso digam
[1] "distance%=1.4949"

MrsRuderico

NW_Iberia_IA,73.4
Berber_EMA,11.8
Roman_Colonial,10.4
Germanic,4.4


[1] "distance%=1.6254"

Ruderico

NW_Iberia_IA,81.4
Berber_EMA,10
Roman_Colonial,8.6


[1] "distance%=1.7325"

Lusitano

NW_Iberia_IA,72.8
Roman_Colonial,16
Berber_EMA,11.2


[1] "distance%=2.0372"

Trebaruna

NW_Iberia_IA,75
Roman_Colonial,9.6
Berber_EMA,8
Germanic,7.4


[1] "distance%=0.9764"

Endovelicus

NW_Iberia_IA,72.6
Roman_Colonial,17.8
Berber_EMA,7
Yoruba,2.6

JJJ
09-27-2020, 02:48 PM
Algumas runs de indivíduos, se tiverem interesse no vosso digam
[1] "distance%=1.4949"

MrsRuderico

NW_Iberia_IA,73.4
Berber_EMA,11.8
Roman_Colonial,10.4
Germanic,4.4


[1] "distance%=1.6254"

Ruderico

NW_Iberia_IA,81.4
Berber_EMA,10
Roman_Colonial,8.6


[1] "distance%=1.7325"

Lusitano

NW_Iberia_IA,72.8
Roman_Colonial,16
Berber_EMA,11.2


[1] "distance%=2.0372"

Trebaruna

NW_Iberia_IA,75
Roman_Colonial,9.6
Berber_EMA,8
Germanic,7.4


[1] "distance%=0.9764"

Endovelicus

NW_Iberia_IA,72.6
Roman_Colonial,17.8
Berber_EMA,7
Yoruba,2.6

... :)

Shadogowah
09-29-2020, 09:37 AM
Foram publicadas uma série de amostras do período Viking no G25, e como seria de esperar são bastante heterogéneas devido ao fluxo de escravos e produtos de casamentos mistos que ocorreram nesta época, até porque muitas das amostras nem sequer são Escandinavas. Para aqui o que me chamou a atenção são amostras, anteriores a esta época, das ilhas Orkney na costa norte da Escócia. Sendo anteriores ao período Viking serão quase certamente Pictos. Ao olhar para as amostras reparei que eram bastante semelhantes a amostras Gaelicas da Islândia, já do período Viking da ilha, que também estão disponíveis no G25.

Decidi então fazer uma pequena experiência que publiquei na secção Francesa, e que vou postar aqui também, mas com umas ligeiras alterações nomeadamente que vou acrescentar uma referência Levantina que vai fazer overfitting com a Romana, mas paciência. Vou também usar a média dos Guanches em vez de uma referência construída com Berberes modernos com menor percentagem de influência não-local.

Vou postar um modelo-base e depois vou acrescentar referências: primeiro a média das amostras "Gaélicas", depois dos "Pictos" e finalmente os dois juntos.
O objectivo aqui é ver como todas as componentes variam à medida que são acrescentadas novas.


[1] "distance%=0.8372"

Portuguese

Iberia_IA,64.2
Berber_EMA,11.2
Germanic_IA,10.8
Rome_Imperial,8.8
Levant_Roman,5


[1] "distance%=0.7035"

Portuguese

Iberia_IA,60.4
Berber_EMA,11
Iceland_Gaelic,10.4
Rome_Imperial,8.4
Levant_Roman,5
Germanic_IA,4.8


[1] "distance%=0.7308"

Portuguese

Iberia_IA,60.8
Berber_EMA,11.4
Orkney_Pict,9
Rome_Imperial,7.2
Germanic_IA,6.2
Levant_Roman,5.4


[1] "distance%=0.6899"

Portuguese

Iberia_IA,59.8
Berber_EMA,11
Iceland_Gaelic,8.2
Rome_Imperial,7.4
Levant_Roman,5.4
Orkney_Pict,4.4
Germanic_IA,3.8


Há coisas que me parecem muito claras, nomeadamente que estas amostras ajudam imenso o modelo, basta ver como as distâncias caíram de ~0.84 para ~0.69 o que é uma melhoria relativa bastante significativa.

Já se sabia que as amostras de La Hoya (link (https://en.wikipedia.org/wiki/La_Hoya,_Alava)) eram um bocado vascóides, apesar de serem de um contexto e cultura Celta ou Celtibera, o que iria supor que o modelo fosse necessitar de algo mais para compensar essa tendência deles. As restantes Ibéricas poderiam ajudar, mas parecia sempre que faltava algo.
Normalmente este vazio era preenchido pela referência germânica, mas estas de tendência atlântica parece que fazem o trabalho muito melhor, dando ainda espaço para uma componente Germânica pequena mas clara. Estas amostras reduzem não só as percentagens da referência germânica como da nativa Ibérica. Para mim isto significa duas coisas:
1) Há algo em falta na variação genética das amostras Ibéricas da Idade do Ferro do estudo do Olalde, isso pode não ser problemático para a maior parte de Espanha, mas para Portugal e para o ocidente peninsular provavelmente é.
2) A influência germânica continua presente apesar destas amostras Gaélicas/Pictas plotarem muito a "norte", porque certamente é real. Valores desta ordem de grandeza fazem supor que haja pessoas que tenham herdado pouco, e que o modelo não capte também devido a overfitting. Este é provavelmente o meu caso.


Considerando que estas novas amostras estão apenas a captar variação pré-romana, e que a Levantina e Romana são complementares e chegaram na mesma altura, junto-as todas em componentes novas e deixo um modelo agregado simplificado.


[1] "distance%=0.6865"

Portuguese

NW_Iberia_IA,71.4
Roman_Colonial,13.2
Berber_EMA,11.2
Germanic,4.2


[1] "distance%=0.566"

Spanish_Galicia

NW_Iberia_IA,74.6
Roman_Colonial,11.8
Berber_EMA,10.8
Germanic,2.8


[1] "distance%=0.7804"

Spanish_Castilla_Y_Leon

NW_Iberia_IA,79.4
Roman_Colonial,10.8
Berber_EMA,9.8


[1] "distance%=1.5266"

Spanish_Asturias

NW_Iberia_IA,86.2
Berber_EMA,8.8
Roman_Colonial,5


Algumas runs de indivíduos, se tiverem interesse no vosso digam
[1] "distance%=1.4949"

MrsRuderico

NW_Iberia_IA,73.4
Berber_EMA,11.8
Roman_Colonial,10.4
Germanic,4.4


[1] "distance%=1.6254"

Ruderico

NW_Iberia_IA,81.4
Berber_EMA,10
Roman_Colonial,8.6


[1] "distance%=1.7325"

Lusitano

NW_Iberia_IA,72.8
Roman_Colonial,16
Berber_EMA,11.2


[1] "distance%=2.0372"

Trebaruna

NW_Iberia_IA,75
Roman_Colonial,9.6
Berber_EMA,8
Germanic,7.4


[1] "distance%=0.9764"

Endovelicus

NW_Iberia_IA,72.6
Roman_Colonial,17.8
Berber_EMA,7
Yoruba,2.6






Considrando que meu perfil também se inclina para noroeste e se parece com o seu, estou curioso para ver onde ele me posiciona nesse modelo.

Andour
09-29-2020, 09:42 AM
Could you do mine as well please, if that's not too much trouble.

Ruderico
09-29-2020, 11:35 AM
Sorry for the delay, I'm not getting notifications from quotes

[1] "distance%=1.9217"

JJJ

Iberia_IA,73
Roman_Colonial,12.6
Berber_EMA,7.6
Orkney_Pict,4.8
Iceland_Gaelic,2


[1] "distance%=1.9178"

JJJ

NW_Iberia_IA,79.8
Roman_Colonial,12.4
Berber_EMA,7.8



[1] "distance%=1.1443"

Shadogowah

Iberia_IA,62.8
Roman_Colonial,13
Berber_EMA,10.4
Iceland_Gaelic,5.8
Orkney_Pict,5.2
Germanic,2.8


[1] "distance%=1.1549"

Shadogowah

NW_Iberia_IA,73.2
Roman_Colonial,13.4
Berber_EMA,10.2
Germanic,3.2


Andour it's no trouble whatsoever, of course, but as you can imagine this was built specifically for people of Iberian background, so the results shouldn't be very meaningful as its lacking the critical Gallic/French_IA references.

[1] "distance%=1.2069"

Andour

Iberia_IA,52.2
Orkney_Pict,24.4
Roman_Colonial,15.2
Iceland_Gaelic,8.2


[1] "distance%=1.212"

Andour

NW_Iberia_IA,85.4
Roman_Colonial,14.6



Suponho que isto seja em parte a razão do sinal pseudo-Britânico/ocidental que por vezes aparece em alguns Portugueses (e não só) desde há vários anos.
Um estudo recente publicou este K7 da península Ibérica onde se vê que as componentes laranja e azul claro são semelhantes, mas a laranja parece especificamente Espanhola/Basca, enquanto que a azul clara domina em Portugal/Galiza/etc e nas restantes amostras Europeias.
https://i.postimg.cc/446W4B58/k7admix.png



O facto de muitos Espanhois terem alguma herança genética Basca, que não existe aqui, também deve ajudar a este tipo de resultados
https://i.postimg.cc/QtNmQVDt/basque.png

Pedro Ruben
09-29-2020, 11:40 AM
Se puderes calcular o meu agradeço! :)

Ruderico
09-29-2020, 01:30 PM
Se puderes calcular o meu agradeço! :)

Claro. Tal como eu também beneficias também imenso com estas novas amostras, apesar de isso ser em parte overfitting


[1] "distance%=1.0728"

PR

Iberia_IA,47
Roman_Colonial,17.8
Iceland_Gaelic,16.4
Berber_EMA,10
Orkney_Pict,8.8


[1] "distance%=1.0781"

PR

NW_Iberia_IA,72.2
Roman_Colonial,18
Berber_EMA,9.8

Andour
09-29-2020, 02:02 PM
Andour it's no trouble whatsoever, of course, but as you can imagine this was built specifically for people of Iberian background, so the results shouldn't be very meaningful as its lacking the critical Gallic/French_IA references.

[1] "distance%=1.2069"

Andour

Iberia_IA,52.2
Orkney_Pict,24.4
Roman_Colonial,15.2
Iceland_Gaelic,8.2


[1] "distance%=1.212"

Andour

NW_Iberia_IA,85.4
Roman_Colonial,14.6



I was fully aware the model was designed for Iberians. But as I am surrounded by - mostly - Catalans on most PCAs, I was interested in giving it a try. And as you can see, at a distance of 1.20, I am not a remote outlier from you guys. Anyway, thanks for bothering.

Pedro Ruben
09-29-2020, 03:47 PM
Claro. Tal como eu também beneficias também imenso com estas novas amostras, apesar de isso ser em parte overfitting


[1] "distance%=1.0728"

PR

Iberia_IA,47
Roman_Colonial,17.8
Iceland_Gaelic,16.4
Berber_EMA,10
Orkney_Pict,8.8


[1] "distance%=1.0781"

PR

NW_Iberia_IA,72.2
Roman_Colonial,18
Berber_EMA,9.8

Interessante! O Roman_Colonial é um pouco alto. Estará relacionado com os norte Italianos atuais?

Ruderico
09-29-2020, 03:52 PM
Interessante! O Roman_Colonial é um pouco alto. Estará relacionado com os norte Italianos atuais?

É alto sim, mas tu plotas muito próximo da Itália, é natural que a referência Romana seja boa para ti, provavelmente herdaste mais ADN do centro/leste mediterrânico que a maioria dos Portugueses/Espanhóis. Ou então tens algo mais recente que te puxa nessa direcção. Eu sugiro sempre fazer a árvore genealógica, pode ser que descubras algo.

Shadogowah
09-29-2020, 04:19 PM
Você tem alguma forma de confirmar se aquele "germânico" sobrevivente só aparece no noroeste?

Ruderico
09-29-2020, 04:49 PM
Você tem alguma forma de confirmar se aquele "germânico" sobrevivente só aparece no noroeste?

Só correndo os modelos para todas as regiões, mas também deve aparecer em outras. Há também o problema de algumas regiões terem poucas amostras e isso pode enviesar o resultado.
Alguns exemplos


[1] "distance%=1.5213"

Spanish_Asturias

NW_Iberia_IA,87.6
Berber_EMA,9.4
Roman_Colonial,3


[1] "distance%=0.9454"

Spanish_Cantabria

NW_Iberia_IA,87.2
Roman_Colonial,8.4
Berber_EMA,4.4


[1] "distance%=0.569"

Spanish_Castilla_La_Mancha

NW_Iberia_IA,81.8
Roman_Colonial,12.6
Berber_EMA,5.6


[1] "distance%=0.6906"

Spanish_Andalucia

NW_Iberia_IA,78
Roman_Colonial,13.8
Berber_EMA,8.2


[1] "distance%=0.7482"

Spanish_Cataluna

NW_Iberia_IA,80.4
Roman_Colonial,11.4
Berber_EMA,4.6
Germanic,3.6


[1] "distance%=0.6694"

Spanish_Murcia

NW_Iberia_IA,73.8
Roman_Colonial,17.6
Berber_EMA,7.4
Germanic,1.2

Shadogowah
09-29-2020, 05:54 PM
Historicamente, uma relação entre a população da Catalunha e Murcia pode ser explicada devido ao repovoamento aragonês, mas eu não saberia como relacioná-la com o noroeste. E, por outro lado, se esse componente for gótico ou franco, também deve aparecer em Castela.

Ruderico
09-29-2020, 06:43 PM
Historicamente, uma relação entre a população da Catalunha e Murcia pode ser explicada devido ao repovoamento aragonês, mas eu não saberia como relacioná-la com o noroeste. E, por outro lado, se esse componente for gótico ou franco, também deve aparecer em Castela.

É um valor pequeno e sem grande importância, suponho que possa aparecer em qualquer parte por motivos meramente estatísticos (ruído). Por outro lado pode-se usar a referência dos Visigodos, mas como são heterogéneos não sei até que ponto será boa ideia usa-los

Shadogowah
09-30-2020, 06:54 AM
É um valor pequeno e sem grande importância, suponho que possa aparecer em qualquer parte por motivos meramente estatísticos (ruído). Por outro lado pode-se usar a referência dos Visigodos, mas como são heterogéneos não sei até que ponto será boa ideia usa-los

Suponho que uma distribuição heterogênea deva indicar que o sinal é relativamente moderno.

Defski
10-03-2020, 10:04 PM
Ruderico eu também estou interessado (a minha mãe e o meu sff) obrigado.

Ruderico
10-14-2020, 09:19 AM
Ruderico eu também estou interessado (a minha mãe e o meu sff) obrigado.

Desculpa a demora, esqueci-me completamente do modelo


[1] "distance%=1.6265"

Defski

NW_Iberia_IA,72
Roman_Colonial,16.6
Berber_EMA,9.8
Germanic,1.6


[1] "distance%=1.4773"

Regina

NW_Iberia_IA,74.6
Roman_Colonial,17.8
Berber_EMA,5.4
Germanic,2.2

O resultado da tua mãe acabou por ficar com muito pouco Berbere, se calhar a componente Levantina incluída no Romano está a interferir com isso

Ruderico
10-14-2020, 09:21 AM
Há uns dias postei este plot noutro tópico, achei que pode ter interesse aqui.
Fiz originalmente para ajudar outros Portugueses no FB a perceberem como o perfil genético aqui foi mudando com os milénios, no entanto não mostra nada sobre o norte de África.


https://i.postimg.cc/BZJJ9Qvs/pcasetas.png


E um semelhante, mas com amostras históricas relevantes para a península Ibérica
https://i.postimg.cc/69xBzLt3/baetica-visigodos-al-andalus-pca.png

mokordo
11-07-2020, 09:40 AM
Me with Ancestry Calculator (Adam medium)

Distance: 1.168160337703043%

Iberia_IA: 67.3%
Rome_Imperial: 12.7%
Germanic_IA: 12.3%
North_African: 7.7%
Other: 0.0%

Me with Vahaduo.


Target: gixajo
Distance: 1.1682% / 0.01168173
67.2 Iberia_IA
12.8 Rome_Imperial
12.4 Germanic_IA
7.6 North_African

alejandromb92
11-07-2020, 10:09 AM
Foram publicadas uma série de amostras do período Viking no G25, e como seria de esperar são bastante heterogéneas devido ao fluxo de escravos e produtos de casamentos mistos que ocorreram nesta época, até porque muitas das amostras nem sequer são Escandinavas. Para aqui o que me chamou a atenção são amostras, anteriores a esta época, das ilhas Orkney na costa norte da Escócia. Sendo anteriores ao período Viking serão quase certamente Pictos. Ao olhar para as amostras reparei que eram bastante semelhantes a amostras Gaelicas da Islândia, já do período Viking da ilha, que também estão disponíveis no G25.

Decidi então fazer uma pequena experiência que publiquei na secção Francesa, e que vou postar aqui também, mas com umas ligeiras alterações nomeadamente que vou acrescentar uma referência Levantina que vai fazer overfitting com a Romana, mas paciência. Vou também usar a média dos Guanches em vez de uma referência construída com Berberes modernos com menor percentagem de influência não-local.

Vou postar um modelo-base e depois vou acrescentar referências: primeiro a média das amostras "Gaélicas", depois dos "Pictos" e finalmente os dois juntos.
O objectivo aqui é ver como todas as componentes variam à medida que são acrescentadas novas.


[1] "distance%=0.8372"

Portuguese

Iberia_IA,64.2
Berber_EMA,11.2
Germanic_IA,10.8
Rome_Imperial,8.8
Levant_Roman,5


[1] "distance%=0.7035"

Portuguese

Iberia_IA,60.4
Berber_EMA,11
Iceland_Gaelic,10.4
Rome_Imperial,8.4
Levant_Roman,5
Germanic_IA,4.8


[1] "distance%=0.7308"

Portuguese

Iberia_IA,60.8
Berber_EMA,11.4
Orkney_Pict,9
Rome_Imperial,7.2
Germanic_IA,6.2
Levant_Roman,5.4


[1] "distance%=0.6899"

Portuguese

Iberia_IA,59.8
Berber_EMA,11
Iceland_Gaelic,8.2
Rome_Imperial,7.4
Levant_Roman,5.4
Orkney_Pict,4.4
Germanic_IA,3.8


Há coisas que me parecem muito claras, nomeadamente que estas amostras ajudam imenso o modelo, basta ver como as distâncias caíram de ~0.84 para ~0.69 o que é uma melhoria relativa bastante significativa.

Já se sabia que as amostras de La Hoya (link (https://en.wikipedia.org/wiki/La_Hoya,_Alava)) eram um bocado vascóides, apesar de serem de um contexto e cultura Celta ou Celtibera, o que iria supor que o modelo fosse necessitar de algo mais para compensar essa tendência deles. As restantes Ibéricas poderiam ajudar, mas parecia sempre que faltava algo.
Normalmente este vazio era preenchido pela referência germânica, mas estas de tendência atlântica parece que fazem o trabalho muito melhor, dando ainda espaço para uma componente Germânica pequena mas clara. Estas amostras reduzem não só as percentagens da referência germânica como da nativa Ibérica. Para mim isto significa duas coisas:
1) Há algo em falta na variação genética das amostras Ibéricas da Idade do Ferro do estudo do Olalde, isso pode não ser problemático para a maior parte de Espanha, mas para Portugal e para o ocidente peninsular provavelmente é.
2) A influência germânica continua presente apesar destas amostras Gaélicas/Pictas plotarem muito a "norte", porque certamente é real. Valores desta ordem de grandeza fazem supor que haja pessoas que tenham herdado pouco, e que o modelo não capte também devido a overfitting. Este é provavelmente o meu caso.


Considerando que estas novas amostras estão apenas a captar variação pré-romana, e que a Levantina e Romana são complementares e chegaram na mesma altura, junto-as todas em componentes novas e deixo um modelo agregado simplificado.


[1] "distance%=0.6865"

Portuguese

NW_Iberia_IA,71.4
Roman_Colonial,13.2
Berber_EMA,11.2
Germanic,4.2


[1] "distance%=0.566"

Spanish_Galicia

NW_Iberia_IA,74.6
Roman_Colonial,11.8
Berber_EMA,10.8
Germanic,2.8


[1] "distance%=0.7804"

Spanish_Castilla_Y_Leon

NW_Iberia_IA,79.4
Roman_Colonial,10.8
Berber_EMA,9.8


[1] "distance%=1.5266"

Spanish_Asturias

NW_Iberia_IA,86.2
Berber_EMA,8.8
Roman_Colonial,5


Algumas runs de indivíduos, se tiverem interesse no vosso digam
[1] "distance%=1.4949"

MrsRuderico

NW_Iberia_IA,73.4
Berber_EMA,11.8
Roman_Colonial,10.4
Germanic,4.4


[1] "distance%=1.6254"

Ruderico

NW_Iberia_IA,81.4
Berber_EMA,10
Roman_Colonial,8.6


[1] "distance%=1.7325"

Lusitano

NW_Iberia_IA,72.8
Roman_Colonial,16
Berber_EMA,11.2


[1] "distance%=2.0372"

Trebaruna

NW_Iberia_IA,75
Roman_Colonial,9.6
Berber_EMA,8
Germanic,7.4


[1] "distance%=0.9764"

Endovelicus

NW_Iberia_IA,72.6
Roman_Colonial,17.8
Berber_EMA,7
Yoruba,2.6

Estoy curioso a ver que me sale:

Alejandro_scaled,0.100164,0.144205,0.031301,-0.011951,0.03139,0.00251,0.000705,0.006231,0.02290 7,0.019135,-0.001624,0.003447,-0.009366,-0.012937,-0.0019,0.006629,0.014864,-0.001394,-0.009804,0.007504,-0.002246,-0.003957,0.00037,-0.003253,0.003473

Alejandro,0.0088,0.0142,0.0083,-0.0037,0.0102,0.0009,0.0003,0.0027,0.0112,0.0105,-0.001,0.0023,-0.0063,-0.0094,-0.0014,0.005,0.0114,-0.0011,-0.0078,0.006,-0.0018,-0.0032,0.0003,-0.0027,0.0029

Ruderico
11-12-2020, 10:13 AM
Estoy curioso a ver que me sale:

Alejandro,0.0088,0.0142,0.0083,-0.0037,0.0102,0.0009,0.0003,0.0027,0.0112,0.0105,-0.001,0.0023,-0.0063,-0.0094,-0.0014,0.005,0.0114,-0.0011,-0.0078,0.006,-0.0018,-0.0032,0.0003,-0.0027,0.0029

Yo nunca uso coordenadas scaled porque ellas no tienen ningún suporte científico



[1] "distance%=1.7479"

Alejandro

Iberia_IA,49.2
Rome_Imperial,25.6
Berber_EMA,9.4
Levant_Roman,7.6
Germanic,5.4
Atlantic,2.8


[1] "distance%=1.7512"

Alejandro

NW_Iberia_IA,51.8
Roman_Colonial,33.6
Berber_EMA,9
Germanic,5.6


Eres parte Italiano, no?

alejandromb92
11-12-2020, 03:56 PM
Yo nunca uso coordenadas scaled porque ellas no tienen ningún suporte científico



[1] "distance%=1.7479"

Alejandro

Iberia_IA,49.2
Rome_Imperial,25.6
Berber_EMA,9.4
Levant_Roman,7.6
Germanic,5.4
Atlantic,2.8


[1] "distance%=1.7512"

Alejandro

NW_Iberia_IA,51.8
Roman_Colonial,33.6
Berber_EMA,9
Germanic,5.6


Eres parte Italiano, no?

En efecto. Basicamente soy 3/4 iberico occidental y 1/4 italiano meridional. Gracias por los resultados, que ves como muy diferente en mis resultados comparandolos con un iberico occidental promedio?

Ruderico
11-12-2020, 04:03 PM
Sim, o valor da referência Romana é claramente muito elevado (mais ~20% que a referência nacional, compatível com um avô Italiano do sul), e põe-te virtualmente fora da variação normal no ocidente Ibérico.

Isso também pode ser visto num plot do PCA com as referências indicadas, ficas virtualmente fora do cluster Portugal+Galiza

https://i.postimg.cc/pRzhzxng/alejandro.png

alejandromb92
11-12-2020, 04:29 PM
Sim, o valor da referência Romana é claramente muito elevado (mais ~20% que a referência nacional, compatível com um avô Italiano do sul), e põe-te virtualmente fora da variação normal no ocidente Ibérico.

Isso também pode ser visto num plot do PCA com as referências indicadas, ficas virtualmente fora do cluster Portugal+Galiza

https://i.postimg.cc/pRzhzxng/alejandro.png

Interesante! Gracias Ruderico.

anglesqueville
11-15-2020, 02:50 PM
Here is an update of the map I'm working on (with G25 unscaled > sparsePCA >UMAP), with some of you Portuguese friends. It's a very large pdf. Search your name ( your G25-code). And don't expect anything miraculous, as the use of sparsePCA and UMAP is very experimental. Thanks to Ruderico who led me to this thread (and excuse me for not writing in your language, it would be a bit ridiculous to use a translator).
41190

Ruderico
11-15-2020, 08:51 PM
Thanks Angles!

There seems to be a cluster with many Portuguese samples on the edge of the larger Iberian one, but there are still Portuguese plotting just about anywhere within it. No idea if the Spanish ones in that area are Galician, or West Iberians, or not. Don't really know if this means anything either

anglesqueville
11-15-2020, 11:28 PM
Thanks Angles!

There seems to be a cluster with many Portuguese samples on the edge of the larger Iberian one, but there are still Portuguese plotting just about anywhere within it. No idea if the Spanish ones in that area are Galician, or West Iberians, or not. Don't really know if this means anything either

I restored the regional labels of the Spanish and increased the size of the map in order to keep it readable. Zoom in, it's a very large pdf.
41206

Ruderico
11-15-2020, 11:32 PM
Thanks, I see the Spanish are mostly Galicians, Leonese, the Asturian, and Andalucians. Most of them are indeed western

Empecinado
11-16-2020, 08:47 AM
Foram publicadas uma série de amostras do período Viking no G25, e como seria de esperar são bastante heterogéneas devido ao fluxo de escravos e produtos de casamentos mistos que ocorreram nesta época, até porque muitas das amostras nem sequer são Escandinavas. Para aqui o que me chamou a atenção são amostras, anteriores a esta época, das ilhas Orkney na costa norte da Escócia. Sendo anteriores ao período Viking serão quase certamente Pictos. Ao olhar para as amostras reparei que eram bastante semelhantes a amostras Gaelicas da Islândia, já do período Viking da ilha, que também estão disponíveis no G25.

Decidi então fazer uma pequena experiência que publiquei na secção Francesa, e que vou postar aqui também, mas com umas ligeiras alterações nomeadamente que vou acrescentar uma referência Levantina que vai fazer overfitting com a Romana, mas paciência. Vou também usar a média dos Guanches em vez de uma referência construída com Berberes modernos com menor percentagem de influência não-local.

Vou postar um modelo-base e depois vou acrescentar referências: primeiro a média das amostras "Gaélicas", depois dos "Pictos" e finalmente os dois juntos.
O objectivo aqui é ver como todas as componentes variam à medida que são acrescentadas novas.


[1] "distance%=0.8372"

Portuguese

Iberia_IA,64.2
Berber_EMA,11.2
Germanic_IA,10.8
Rome_Imperial,8.8
Levant_Roman,5


[1] "distance%=0.7035"

Portuguese

Iberia_IA,60.4
Berber_EMA,11
Iceland_Gaelic,10.4
Rome_Imperial,8.4
Levant_Roman,5
Germanic_IA,4.8


[1] "distance%=0.7308"

Portuguese

Iberia_IA,60.8
Berber_EMA,11.4
Orkney_Pict,9
Rome_Imperial,7.2
Germanic_IA,6.2
Levant_Roman,5.4


[1] "distance%=0.6899"

Portuguese

Iberia_IA,59.8
Berber_EMA,11
Iceland_Gaelic,8.2
Rome_Imperial,7.4
Levant_Roman,5.4
Orkney_Pict,4.4
Germanic_IA,3.8


Há coisas que me parecem muito claras, nomeadamente que estas amostras ajudam imenso o modelo, basta ver como as distâncias caíram de ~0.84 para ~0.69 o que é uma melhoria relativa bastante significativa.

Já se sabia que as amostras de La Hoya (link (https://en.wikipedia.org/wiki/La_Hoya,_Alava)) eram um bocado vascóides, apesar de serem de um contexto e cultura Celta ou Celtibera, o que iria supor que o modelo fosse necessitar de algo mais para compensar essa tendência deles. As restantes Ibéricas poderiam ajudar, mas parecia sempre que faltava algo.
Normalmente este vazio era preenchido pela referência germânica, mas estas de tendência atlântica parece que fazem o trabalho muito melhor, dando ainda espaço para uma componente Germânica pequena mas clara. Estas amostras reduzem não só as percentagens da referência germânica como da nativa Ibérica. Para mim isto significa duas coisas:
1) Há algo em falta na variação genética das amostras Ibéricas da Idade do Ferro do estudo do Olalde, isso pode não ser problemático para a maior parte de Espanha, mas para Portugal e para o ocidente peninsular provavelmente é.
2) A influência germânica continua presente apesar destas amostras Gaélicas/Pictas plotarem muito a "norte", porque certamente é real. Valores desta ordem de grandeza fazem supor que haja pessoas que tenham herdado pouco, e que o modelo não capte também devido a overfitting. Este é provavelmente o meu caso.


Considerando que estas novas amostras estão apenas a captar variação pré-romana, e que a Levantina e Romana são complementares e chegaram na mesma altura, junto-as todas em componentes novas e deixo um modelo agregado simplificado.


[1] "distance%=0.6865"

Portuguese

NW_Iberia_IA,71.4
Roman_Colonial,13.2
Berber_EMA,11.2
Germanic,4.2


[1] "distance%=0.566"

Spanish_Galicia

NW_Iberia_IA,74.6
Roman_Colonial,11.8
Berber_EMA,10.8
Germanic,2.8


[1] "distance%=0.7804"

Spanish_Castilla_Y_Leon

NW_Iberia_IA,79.4
Roman_Colonial,10.8
Berber_EMA,9.8


[1] "distance%=1.5266"

Spanish_Asturias

NW_Iberia_IA,86.2
Berber_EMA,8.8
Roman_Colonial,5


Algumas runs de indivíduos, se tiverem interesse no vosso digam
[1] "distance%=1.4949"

MrsRuderico

NW_Iberia_IA,73.4
Berber_EMA,11.8
Roman_Colonial,10.4
Germanic,4.4


[1] "distance%=1.6254"

Ruderico

NW_Iberia_IA,81.4
Berber_EMA,10
Roman_Colonial,8.6


[1] "distance%=1.7325"

Lusitano

NW_Iberia_IA,72.8
Roman_Colonial,16
Berber_EMA,11.2


[1] "distance%=2.0372"

Trebaruna

NW_Iberia_IA,75
Roman_Colonial,9.6
Berber_EMA,8
Germanic,7.4


[1] "distance%=0.9764"

Endovelicus

NW_Iberia_IA,72.6
Roman_Colonial,17.8
Berber_EMA,7
Yoruba,2.6

Eu tenho interes, moitas grazas!


Jordi,0.0101,0.0151,0.0108,-0.002,0.0147,-0.0024,-0.002,0.0035,0.0127,0.0193,0.001,0.0057,-0.0106,0.0007,0.0087,-0.0069,-0.0085,-0.0012,0.007,-0.0079,0.0002,0.001,0.0011,-0.0043,0.0027

Capitalis
12-30-2020, 07:46 PM
Foram publicadas uma série de amostras do período Viking no G25, e como seria de esperar são bastante heterogéneas devido ao fluxo de escravos e produtos de casamentos mistos que ocorreram nesta época, até porque muitas das amostras nem sequer são Escandinavas. Para aqui o que me chamou a atenção são amostras, anteriores a esta época, das ilhas Orkney na costa norte da Escócia. Sendo anteriores ao período Viking serão quase certamente Pictos. Ao olhar para as amostras reparei que eram bastante semelhantes a amostras Gaelicas da Islândia, já do período Viking da ilha, que também estão disponíveis no G25.

Decidi então fazer uma pequena experiência que publiquei na secção Francesa, e que vou postar aqui também, mas com umas ligeiras alterações nomeadamente que vou acrescentar uma referência Levantina que vai fazer overfitting com a Romana, mas paciência. Vou também usar a média dos Guanches em vez de uma referência construída com Berberes modernos com menor percentagem de influência não-local.

Vou postar um modelo-base e depois vou acrescentar referências: primeiro a média das amostras "Gaélicas", depois dos "Pictos" e finalmente os dois juntos.
O objectivo aqui é ver como todas as componentes variam à medida que são acrescentadas novas.


[1] "distance%=0.8372"

Portuguese

Iberia_IA,64.2
Berber_EMA,11.2
Germanic_IA,10.8
Rome_Imperial,8.8
Levant_Roman,5


[1] "distance%=0.7035"

Portuguese

Iberia_IA,60.4
Berber_EMA,11
Iceland_Gaelic,10.4
Rome_Imperial,8.4
Levant_Roman,5
Germanic_IA,4.8


[1] "distance%=0.7308"

Portuguese

Iberia_IA,60.8
Berber_EMA,11.4
Orkney_Pict,9
Rome_Imperial,7.2
Germanic_IA,6.2
Levant_Roman,5.4


[1] "distance%=0.6899"

Portuguese

Iberia_IA,59.8
Berber_EMA,11
Iceland_Gaelic,8.2
Rome_Imperial,7.4
Levant_Roman,5.4
Orkney_Pict,4.4
Germanic_IA,3.8


Há coisas que me parecem muito claras, nomeadamente que estas amostras ajudam imenso o modelo, basta ver como as distâncias caíram de ~0.84 para ~0.69 o que é uma melhoria relativa bastante significativa.

Já se sabia que as amostras de La Hoya (link (https://en.wikipedia.org/wiki/La_Hoya,_Alava)) eram um bocado vascóides, apesar de serem de um contexto e cultura Celta ou Celtibera, o que iria supor que o modelo fosse necessitar de algo mais para compensar essa tendência deles. As restantes Ibéricas poderiam ajudar, mas parecia sempre que faltava algo.
Normalmente este vazio era preenchido pela referência germânica, mas estas de tendência atlântica parece que fazem o trabalho muito melhor, dando ainda espaço para uma componente Germânica pequena mas clara. Estas amostras reduzem não só as percentagens da referência germânica como da nativa Ibérica. Para mim isto significa duas coisas:
1) Há algo em falta na variação genética das amostras Ibéricas da Idade do Ferro do estudo do Olalde, isso pode não ser problemático para a maior parte de Espanha, mas para Portugal e para o ocidente peninsular provavelmente é.
2) A influência germânica continua presente apesar destas amostras Gaélicas/Pictas plotarem muito a "norte", porque certamente é real. Valores desta ordem de grandeza fazem supor que haja pessoas que tenham herdado pouco, e que o modelo não capte também devido a overfitting. Este é provavelmente o meu caso.


Considerando que estas novas amostras estão apenas a captar variação pré-romana, e que a Levantina e Romana são complementares e chegaram na mesma altura, junto-as todas em componentes novas e deixo um modelo agregado simplificado.


[1] "distance%=0.6865"

Portuguese

NW_Iberia_IA,71.4
Roman_Colonial,13.2
Berber_EMA,11.2
Germanic,4.2


[1] "distance%=0.566"

Spanish_Galicia

NW_Iberia_IA,74.6
Roman_Colonial,11.8
Berber_EMA,10.8
Germanic,2.8


[1] "distance%=0.7804"

Spanish_Castilla_Y_Leon

NW_Iberia_IA,79.4
Roman_Colonial,10.8
Berber_EMA,9.8


[1] "distance%=1.5266"

Spanish_Asturias

NW_Iberia_IA,86.2
Berber_EMA,8.8
Roman_Colonial,5


Algumas runs de indivíduos, se tiverem interesse no vosso digam
[1] "distance%=1.4949"

MrsRuderico

NW_Iberia_IA,73.4
Berber_EMA,11.8
Roman_Colonial,10.4
Germanic,4.4


[1] "distance%=1.6254"

Ruderico

NW_Iberia_IA,81.4
Berber_EMA,10
Roman_Colonial,8.6


[1] "distance%=1.7325"

Lusitano

NW_Iberia_IA,72.8
Roman_Colonial,16
Berber_EMA,11.2


[1] "distance%=2.0372"

Trebaruna

NW_Iberia_IA,75
Roman_Colonial,9.6
Berber_EMA,8
Germanic,7.4


[1] "distance%=0.9764"

Endovelicus

NW_Iberia_IA,72.6
Roman_Colonial,17.8
Berber_EMA,7
Yoruba,2.6

I'm replying to a Google translate of this quote of yours:


There are things that seem very clear to me, namely that these samples help the model immensely, just see how the distances have dropped from ~0.84 to ~0.69 which is a very significant relative improvement. It was already known that the samples of La Hoya ( link ) were a bit vasgoid, despite being of a context and Culture Celta or Celtibera, which would suppose that the model would need something more to compensate for this tendency of them.

The rest of the Iberians could help, but it always seemed like something was missing.
Normally this void was filled by the Germanic reference, but these of Atlantic tendency seem to do the job much better, still giving room for a small but clear Germanic component. These samples reduce not only the percentages of the Germanic reference but also the native Iberian. For me this means two things:
1) There is something missing in the genetic variation of the Iberian samples of the Iron Age of the Olalde
study, this may not be problematic for most of Spain, but for Portugal and the peninsular west probably is. 2) The Germanic influence is still present despite these Gaelic/Pictas samples plot tinga much to "north", because it is certainly real. Values of this order of magnitude make it supendous that there are people who have inherited little, and that the model does not capture also due to overfitting.

I kept a note (in the far right hand columns) of which cluster 15+19 countries were preferred by the Basque samples in my G25 West Eurasia K20 clustered run (from the thread linked in my signature below).

Irish samples are more often preferred over other NW Europeans, but there is some "Germanic" there too, as you have observed.

42174

So, in conclusion, you are definitely on to something, IMO.

EDIT: In the key, C should obviously be B.

Gil Vicente
01-04-2021, 12:27 AM
Algumas runs de indivíduos, se tiverem interesse no vosso digam
[1] "distance%=1.4949"

MrsRuderico

NW_Iberia_IA,73.4
Berber_EMA,11.8
Roman_Colonial,10.4
Germanic,4.4


[1] "distance%=1.6254"

Ruderico

NW_Iberia_IA,81.4
Berber_EMA,10
Roman_Colonial,8.6


[1] "distance%=1.7325"

Lusitano

NW_Iberia_IA,72.8
Roman_Colonial,16
Berber_EMA,11.2


[1] "distance%=2.0372"

Trebaruna

NW_Iberia_IA,75
Roman_Colonial,9.6
Berber_EMA,8
Germanic,7.4


[1] "distance%=0.9764"

Endovelicus

NW_Iberia_IA,72.6
Roman_Colonial,17.8
Berber_EMA,7
Yoruba,2.6

Eu tb sff. Muito agradecido!

Ruderico
01-05-2021, 03:21 PM
Eu tenho interes, moitas grazas!

Desculpa demorar tanto tempo, não vi que tinhas pedido porque não recebi notificação. Bom ano Jordi!
Penso que a única coisa fora do esperado é que, apesar de seres meio Galego, a parcela 'Atlantica' quase não contribui para o teu modelo, suspeito que parte da razão seja overfitting do nMonte.


[1] "distance%=1.7679"

Jordi

Iberia_IA,79.8
Rome_Imperial,10.6
Berber_EMA,4.2
Atlantic,3
Levant_Roman,2.4


[1] "distance%=1.7528"

Jordi

NW_Iberia_IA,81.8
Roman_Colonial,14.2
Berber_EMA,4

[1] "distance%=0.5786"

Spanish_Galicia

Iberia_IA,59.6
Atlantic,13.2
Berber_EMA,10
Rome_Imperial,10
Levant_Roman,3.8
Germanic,3.4




Eu tb sff. Muito agradecido!
Bom ano, já há muito tempo que não te via por aqui.

Tu apareces sempre tendencialmente com uma componente norte Africana anormalmente baixa, apesar de já sabermos de vários estudos que na realidade esta parcela é homogénea qb no país inteiro (e na maior parte da Galiza).
https://i.postimg.cc/hGD78LNB/2.png
https://i.postimg.cc/XNmdMyBf/1.png
https://i.postimg.cc/nh8mpBkM/k7.png


Acrescentando uma referência SSA parece que o modelo fica mais equilibrado, mas ainda assim o 'Berbere' continua bem abaixo do que deve realmente ser. Até acredito que, apesar da fit piorar, parte deste SSA possa ser real (se bem me lembro o 23andme deu-te uns trocos disso) mas o resto cheira-me apenas a interferência de um no outro, ou do outro no um. Fora isso prece tudo típico.


[1] "distance%=1.3193"

Gil_Vicente

Iberia_IA,52.8
Atlantic,24
Rome_Imperial,11.6
Berber_EMA,5.8
Levant_Roman,3.2
SSA,2.6


[1] "distance%=1.3093"

Gil_Vicente

NW_Iberia_IA,75.6
Roman_Colonial,15.6
Berber_EMA,6.4
SSA,2.4



Edit:
Noutro tópico, reparei há pouco que a amostra I15940 da idade do cobre da Sardenha apresenta um perfil muito fortemente norte Africano, e algo distincto dos Guanches. Pergunto-me se, durante a período orientalizante do início da Idade do Ferro no sul de Portugal, povos/tribos/individuos com um perfil semelhante não se poderão ter assentado nas nossas costas por questões comerciais, tendo posteriormente sido "absorvidos" pelo grosso da população indígena.
Relembro que os modelos foram feitos usando as amostras Guanches.

https://i.postimg.cc/8P8WVxNL/sard-outlier.png

Parece que se integra bem nos modelos, substituindo em parte o Guanche, mas isso por si só não quer dizer nada. Fica melhor a umas referências do que outras, e apesar de tudo as fits melhoram um pouco, pelo menos a minha. Gostaria de poder dizer que isto é por motivos históricos, mas estaria a mentir, não há nada aqui que possa suportar essa conclusão.

[1] "distance%=1.5012"

Ruderico

NW_Iberia_IA,80.8
Roman_Colonial,7.8
ITA_Sardinia_C_o,7
Berber_EMA,4.4


[1] "distance%=0.5894"

Portuguese

NW_Iberia_IA,72.4
Roman_Colonial,12.6
Berber_EMA,7.4
ITA_Sardinia_C_o,4.6
Germanic,3


[1] "distance%=0.5406"

Spanish_Galicia

NW_Iberia_IA,72.2
Roman_Colonial,13
Berber_EMA,6
ITA_Sardinia_C_o,4.8
Germanic,4


[1] "distance%=0.6739"

Spanish_Castilla_Y_Leon

NW_Iberia_IA,79
Roman_Colonial,9.4
Berber_EMA,6
ITA_Sardinia_C_o,5.6


[1] "distance%=0.6291"

Spanish_Andalucia

NW_Iberia_IA,77.8
Roman_Colonial,13
Berber_EMA,5
ITA_Sardinia_C_o,4.2


[1] "distance%=1.398"

Spanish_Asturias

NW_Iberia_IA,85.2
ITA_Sardinia_C_o,6.6
Roman_Colonial,4.2
Berber_EMA,4


[1] "distance%=0.9201"

Spanish_Cantabria

NW_Iberia_IA,87.2
Roman_Colonial,7.6
Berber_EMA,3
ITA_Sardinia_C_o,2.2

Gil Vicente
01-05-2021, 08:55 PM
Bom ano, já há muito tempo que não te via por aqui.

Tu apareces sempre tendencialmente com uma componente norte Africana anormalmente baixa, apesar de já sabermos de vários estudos que na realidade esta parcela é homogénea qb no país inteiro (e na maior parte da Galiza).
https://i.postimg.cc/hGD78LNB/2.png
https://i.postimg.cc/XNmdMyBf/1.png
https://i.postimg.cc/nh8mpBkM/k7.png


Acrescentando uma referência SSA parece que o modelo fica mais equilibrado, mas ainda assim o 'Berbere' continua bem abaixo do que deve realmente ser. Até acredito que, apesar da fit piorar, parte deste SSA possa ser real (se bem me lembro o 23andme deu-te uns trocos disso) mas o resto cheira-me apenas a interferência de um no outro, ou do outro no um. Fora isso prece tudo típico.


[1] "distance%=1.3193"

Gil_Vicente

Iberia_IA,52.8
Atlantic,24
Rome_Imperial,11.6
Berber_EMA,5.8
Levant_Roman,3.2
SSA,2.6


[1] "distance%=1.3093"

Gil_Vicente

NW_Iberia_IA,75.6
Roman_Colonial,15.6
Berber_EMA,6.4
SSA,2.4



Edit:
Noutro tópico, reparei há pouco que a amostra I15940 da idade do cobre da Sardenha apresenta um perfil muito fortemente norte Africano, e algo distincto dos Guanches. Pergunto-me se, durante a período orientalizante do início da Idade do Ferro no sul de Portugal, povos/tribos/individuos com um perfil semelhante não se poderão ter assentado nas nossas costas por questões comerciais, tendo posteriormente sido "absorvidos" pelo grosso da população indígena.
Relembro que os modelos foram feitos usando as amostras Guanches.

[IMG]h

Parece que se integra bem nos modelos, substituindo em parte o Guanche, mas isso por si só não quer dizer nada. Fica melhor a umas referências do que outras, e apesar de tudo as fits melhoram um pouco, pelo menos a minha. Gostaria de poder dizer que isto é por motivos históricos, mas estaria a mentir, não há nada aqui que possa suportar essa conclusão.

[1] "distance%=1.5012"

Ruderico

NW_Iberia_IA,80.8
Roman_Colonial,7.8
ITA_Sardinia_C_o,7
Berber_EMA,4.4


[1] "distance%=0.5894"

Portuguese

NW_Iberia_IA,72.4
Roman_Colonial,12.6
Berber_EMA,7.4
ITA_Sardinia_C_o,4.6
Germanic,3


[1] "distance%=0.5406"

Spanish_Galicia

NW_Iberia_IA,72.2
Roman_Colonial,13
Berber_EMA,6
ITA_Sardinia_C_o,4.8
Germanic,4


[1] "distance%=0.6739"

Spanish_Castilla_Y_Leon

NW_Iberia_IA,79
Roman_Colonial,9.4
Berber_EMA,6
ITA_Sardinia_C_o,5.6


[1] "distance%=0.6291"

Spanish_Andalucia

NW_Iberia_IA,77.8
Roman_Colonial,13
Berber_EMA,5
ITA_Sardinia_C_o,4.2


[1] "distance%=1.398"

Spanish_Asturias

NW_Iberia_IA,85.2
ITA_Sardinia_C_o,6.6
Roman_Colonial,4.2
Berber_EMA,4


[1] "distance%=0.9201"

Spanish_Cantabria

NW_Iberia_IA,87.2
Roman_Colonial,7.6
Berber_EMA,3
ITA_Sardinia_C_o,2.2


Obrigado, para ti tb! Sim, não tenho vindo mais por esquecimento que outra coisa.

Sim o SSA é constante nas várias runs e talvez seja isso que causa o NA mais baixo, no 23andme tenho 0.8%.

Quanto a referências da Idade do Ferro que possam ajudar a melhor o "fit", sabes se as amostras Tartessas do Olalde estão no G25? Essas sim talvez fossem interessantes. Nunca as vi em lado nenhum.

Ruderico
01-06-2021, 06:40 AM
Obrigado, para ti tb! Sim, não tenho vindo mais por esquecimento que outra coisa.

Sim o SSA é constante nas várias runs e talvez seja isso que causa o NA mais baixo, no 23andme tenho 0.8%.

Quanto a referências da Idade do Ferro que possam ajudar a melhor o "fit", sabes se as amostras Tartessas do Olalde estão no G25? Essas sim talvez fossem interessantes. Nunca as vi em lado nenhum.

Duvido que haja amostras que sejam realmente benéficas e que façam sentido, até porque a parte ocidental da península continua muito fraca em termos de amostras, e 'agora' que o estudo do Olalde foi publicado sabe-se lá quando sairá o próximo com amostras arqueológicas. Aqui no ocidente, em especial na metade Norte, os solos são graníticos e muito ácidos então os ossos desaparecem mais rapidamente do que em outras zonas.

Aquelas amostras 'Tartessicas' não estão no G25, mas podes ver no próprio plot de PCA do estudo que são amostras locais como outras quaisquer - estão sobrepostas com as não-Indo-Europeias da Idade do Ferro e com as da Idade do Bronze. Deverão ser indígenas, fortemente autóctones, apesar da tumba ter características Púnicas. Provavelmente não falariam uma língua IE nem Semita, e não deverão ter grande interesse para nós

Gil Vicente
01-06-2021, 07:38 PM
Duvido que haja amostras que sejam realmente benéficas e que façam sentido, até porque a parte ocidental da península continua muito fraca em termos de amostras, e 'agora' que o estudo do Olalde foi publicado sabe-se lá quando sairá o próximo com amostras arqueológicas. Aqui no ocidente, em especial na metade Norte, os solos são graníticos e muito ácidos então os ossos desaparecem mais rapidamente do que em outras zonas.

Aquelas amostras 'Tartessicas' não estão no G25, mas podes ver no próprio plot de PCA do estudo que são amostras locais como outras quaisquer - estão sobrepostas com as não-Indo-Europeias da Idade do Ferro e com as da Idade do Bronze. Deverão ser indígenas, fortemente autóctones, apesar da tumba ter características Púnicas. Provavelmente não falariam uma língua IE nem Semita, e não deverão ter grande interesse para nós

Na minha opinião seriam mais uma parte do puzzle:

https://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/c/c8/Ethnographic_Iberia_200_BCE.PNG

Seria interessante tê-las no modelo, assim como as que faltam.

Ruderico
01-06-2021, 10:56 PM
Não iam acrescentar nada, são apenas mais um grupo como outro qualquer com WHG alto e steppe baixo. O que nós precisávamos eram referências nativas com mais steppe, daí que o modelo esteja a captar aquele "Atlantic". Mas se calhar nem vão existir, também não me espantava que os Galaico-Lusitanos fossem muito semelhantes a estes Celtiberos. Se for esse o caso, então o mais provavel é que o valor de steppe que precisamos e estas amostras não têm seja consequência de migrações durante o periodo Romano, e aí a continuidade local desde a época pré-Romana cai ainda mais..mas até termos mais amostras não se pode dizer grande coisa com muita segurança.

Gil Vicente
01-07-2021, 12:06 AM
Não iam acrescentar nada, são apenas mais um grupo como outro qualquer com WHG alto e steppe baixo. O que nós precisávamos eram referências nativas com mais steppe, daí que o modelo esteja a captar aquele "Atlantic". Mas se calhar nem vão existir, também não me espantava que os Galaico-Lusitanos fossem muito semelhantes a estes Celtiberos. Se for esse o caso, então o mais provavel é que o valor de steppe que precisamos e estas amostras não têm seja consequência de migrações durante o periodo Romano, e aí a continuidade local desde a época pré-Romana cai ainda mais..mas até termos mais amostras não se pode dizer grande coisa com muita segurança.

Havia mais gente do que galaico-lusitanos como podes ver no mapa. Além disso uma amostra sueva também poderia fazer a diferença. Estarmos a usar modelos com visigodos e bascos do nordeste parece-me curto. Vamos ver se vem aí qualquer coisa em termos de samples...

Luso
01-07-2021, 02:24 AM
Foram publicadas uma série de amostras do período Viking no G25, e como seria de esperar são bastante heterogéneas devido ao fluxo de escravos e produtos de casamentos mistos que ocorreram nesta época, até porque muitas das amostras nem sequer são Escandinavas. Para aqui o que me chamou a atenção são amostras, anteriores a esta época, das ilhas Orkney na costa norte da Escócia. Sendo anteriores ao período Viking serão quase certamente Pictos. Ao olhar para as amostras reparei que eram bastante semelhantes a amostras Gaelicas da Islândia, já do período Viking da ilha, que também estão disponíveis no G25.

Decidi então fazer uma pequena experiência que publiquei na secção Francesa, e que vou postar aqui também, mas com umas ligeiras alterações nomeadamente que vou acrescentar uma referência Levantina que vai fazer overfitting com a Romana, mas paciência. Vou também usar a média dos Guanches em vez de uma referência construída com Berberes modernos com menor percentagem de influência não-local.

Vou postar um modelo-base e depois vou acrescentar referências: primeiro a média das amostras "Gaélicas", depois dos "Pictos" e finalmente os dois juntos.
O objectivo aqui é ver como todas as componentes variam à medida que são acrescentadas novas.


[1] "distance%=0.8372"

Portuguese

Iberia_IA,64.2
Berber_EMA,11.2
Germanic_IA,10.8
Rome_Imperial,8.8
Levant_Roman,5


[1] "distance%=0.7035"

Portuguese

Iberia_IA,60.4
Berber_EMA,11
Iceland_Gaelic,10.4
Rome_Imperial,8.4
Levant_Roman,5
Germanic_IA,4.8


[1] "distance%=0.7308"

Portuguese

Iberia_IA,60.8
Berber_EMA,11.4
Orkney_Pict,9
Rome_Imperial,7.2
Germanic_IA,6.2
Levant_Roman,5.4


[1] "distance%=0.6899"

Portuguese

Iberia_IA,59.8
Berber_EMA,11
Iceland_Gaelic,8.2
Rome_Imperial,7.4
Levant_Roman,5.4
Orkney_Pict,4.4
Germanic_IA,3.8


Há coisas que me parecem muito claras, nomeadamente que estas amostras ajudam imenso o modelo, basta ver como as distâncias caíram de ~0.84 para ~0.69 o que é uma melhoria relativa bastante significativa.

Já se sabia que as amostras de La Hoya (link (https://en.wikipedia.org/wiki/La_Hoya,_Alava)) eram um bocado vascóides, apesar de serem de um contexto e cultura Celta ou Celtibera, o que iria supor que o modelo fosse necessitar de algo mais para compensar essa tendência deles. As restantes Ibéricas poderiam ajudar, mas parecia sempre que faltava algo.
Normalmente este vazio era preenchido pela referência germânica, mas estas de tendência atlântica parece que fazem o trabalho muito melhor, dando ainda espaço para uma componente Germânica pequena mas clara. Estas amostras reduzem não só as percentagens da referência germânica como da nativa Ibérica. Para mim isto significa duas coisas:
1) Há algo em falta na variação genética das amostras Ibéricas da Idade do Ferro do estudo do Olalde, isso pode não ser problemático para a maior parte de Espanha, mas para Portugal e para o ocidente peninsular provavelmente é.
2) A influência germânica continua presente apesar destas amostras Gaélicas/Pictas plotarem muito a "norte", porque certamente é real. Valores desta ordem de grandeza fazem supor que haja pessoas que tenham herdado pouco, e que o modelo não capte também devido a overfitting. Este é provavelmente o meu caso.


Considerando que estas novas amostras estão apenas a captar variação pré-romana, e que a Levantina e Romana são complementares e chegaram na mesma altura, junto-as todas em componentes novas e deixo um modelo agregado simplificado.


[1] "distance%=0.6865"

Portuguese

NW_Iberia_IA,71.4
Roman_Colonial,13.2
Berber_EMA,11.2
Germanic,4.2


[1] "distance%=0.566"

Spanish_Galicia

NW_Iberia_IA,74.6
Roman_Colonial,11.8
Berber_EMA,10.8
Germanic,2.8


[1] "distance%=0.7804"

Spanish_Castilla_Y_Leon

NW_Iberia_IA,79.4
Roman_Colonial,10.8
Berber_EMA,9.8


[1] "distance%=1.5266"

Spanish_Asturias

NW_Iberia_IA,86.2
Berber_EMA,8.8
Roman_Colonial,5


Algumas runs de indivíduos, se tiverem interesse no vosso digam
[1] "distance%=1.4949"

MrsRuderico

NW_Iberia_IA,73.4
Berber_EMA,11.8
Roman_Colonial,10.4
Germanic,4.4


[1] "distance%=1.6254"

Ruderico

NW_Iberia_IA,81.4
Berber_EMA,10
Roman_Colonial,8.6


[1] "distance%=1.7325"

Lusitano

NW_Iberia_IA,72.8
Roman_Colonial,16
Berber_EMA,11.2


[1] "distance%=2.0372"

Trebaruna

NW_Iberia_IA,75
Roman_Colonial,9.6
Berber_EMA,8
Germanic,7.4


[1] "distance%=0.9764"

Endovelicus

NW_Iberia_IA,72.6
Roman_Colonial,17.8
Berber_EMA,7
Yoruba,2.6

I'd appreciate if you can do mine too :)

Luso_scaled,0.095611,0.144205,0.040352,-0.001292,0.037238,-0.006972,-0.003055,0.004615,0.030065,0.028793,0.000162,-0.000599,-0.015312,-0.00867,0.005836,-0.017369,-0.011604,-0.002534,-0.004022,-0.006503,0.007487,-0.004699,0,-0.002048,-0.003473

Luso,0.0084,0.0142,0.0107,-0.0004,0.0121,-0.0025,-0.0013,0.002,0.0147,0.0158,0.0001,-0.0004,-0.0103,-0.0063,0.0043,-0.0131,-0.0089,-0.002,-0.0032,-0.0052,0.006,-0.0038,0,-0.0017,-0.0029

Ruderico
01-07-2021, 02:19 PM
I'd appreciate if you can do mine too :)

Luso_scaled,0.095611,0.144205,0.040352,-0.001292,0.037238,-0.006972,-0.003055,0.004615,0.030065,0.028793,0.000162,-0.000599,-0.015312,-0.00867,0.005836,-0.017369,-0.011604,-0.002534,-0.004022,-0.006503,0.007487,-0.004699,0,-0.002048,-0.003473

Luso,0.0084,0.0142,0.0107,-0.0004,0.0121,-0.0025,-0.0013,0.002,0.0147,0.0158,0.0001,-0.0004,-0.0103,-0.0063,0.0043,-0.0131,-0.0089,-0.002,-0.0032,-0.0052,0.006,-0.0038,0,-0.0017,-0.0029

Também tudo típico, apesar da referência "atlantica" estar um pouquito baixa. Deixei o Norte Africano da Sardenha só por mera curiosidade já que ela não parece alterar os resultados, mas melhora as fits.


[1] "distance%=1.5439"

Luso

Iberia_IA,70.2
Berber_EMA,10.2
Rome_Imperial,10
Atlantic,7.2
Levant_Roman,2.4


[1] "distance%=1.4173"

Luso

NW_Iberia_IA,77
Roman_Colonial,12
ITA_Sardinia_C_o,7.6
Berber_EMA,3.4




Havia mais gente do que galaico-lusitanos como podes ver no mapa. Além disso uma amostra sueva também poderia fazer a diferença. Estarmos a usar modelos com visigodos e bascos do nordeste parece-me curto. Vamos ver se vem aí qualquer coisa em termos de samples...

Havia, mas as amostras Celtiberas (Berones) são bastante próximos dos Iberos que temos, pelo menos de alguns deles. Tenho dúvidas que os Galaico-Lusitanos fossem muito diferentes dos Astures, dos Vettones ou de Vaccaei. A minha hipótese é que haja a possibilidade de todos estes grupos ocidentais terem recebido influência pelas redes marítimas do Atlântico, durante e após a época Campaniforme (Bell Beaker).

Uma coisa interessante, e que não costuma ser falada, é que a grande maioria das amostras arqueológicas da península Ibérica eram intolerantes à lactose. Ou houve forte selecção positiva nos últimos 2000 anos, ou então está a faltar alguma coisa. Cá em casa é tudo tolerante.

https://anthrogenica.com/attachment.php?attachmentid=33881&stc=1

Gil Vicente
01-07-2021, 08:34 PM
Havia, mas as amostras Celtiberas (Berones) são bastante próximos dos Iberos que temos, pelo menos de alguns deles. Tenho dúvidas que os Galaico-Lusitanos fossem muito diferentes dos Astures, dos Vettones ou de Vaccaei. A minha hipótese é que haja a possibilidade de todos estes grupos ocidentais terem recebido influência pelas redes marítimas do Atlântico, durante e após a época Campaniforme (Bell Beaker).

Uma coisa interessante, e que não costuma ser falada, é que a grande maioria das amostras arqueológicas da península Ibérica eram intolerantes à lactose. Ou houve forte selecção positiva nos últimos 2000 anos, ou então está a faltar alguma coisa. Cá em casa é tudo tolerante.

https://anthrogenica.com/attachment.php?attachmentid=33881&stc=1

O ideal seria uma sample por cada grupo linguistico ali apresentado. Galaicos e lusitanos parecem aparentados como o mapa sugere.
A isso juntava-se médias visigodas, suevas, mouras e romanas todos da península e não era preciso mais :)

Ruderico
01-07-2021, 09:34 PM
Sim, mas infelizmente temos um grande total de 0 :lol:

rober_tce
01-07-2021, 10:29 PM
Questão interessante intolerância à lactose em antigos ibéricos. Sou intolerante à lactose, e muito provavelmente devido à minha genética; é possível que seja um arcaísmo genético herdado daquela época.

Luso
01-07-2021, 10:56 PM
Também tudo típico, apesar da referência "atlantica" estar um pouquito baixa. Deixei o Norte Africano da Sardenha só por mera curiosidade já que ela não parece alterar os resultados, mas melhora as fits.


[1] "distance%=1.5439"

Luso

Iberia_IA,70.2
Berber_EMA,10.2
Rome_Imperial,10
Atlantic,7.2
Levant_Roman,2.4


[1] "distance%=1.4173"

Luso

NW_Iberia_IA,77
Roman_Colonial,12
ITA_Sardinia_C_o,7.6
Berber_EMA,3.4
[/IMG]

Em comparação com outros portugueses, falta me a mistura celta / germânica. Signifiqa isto que estou mais ao sul e tenho menos impacto pelos grupos?

Ruderico
01-08-2021, 12:40 AM
Tens que te lembrar que existe overfitting nestes modelos devido ao método de Monte Carlo, componentes semelhantes interferem umas nas outras e por vezes dão resultados exagerados por défice ou excesso. Se uma destas parcelas de ancestralidade for baixa então o método pode fazê-la desaparecer. Não estás mais a norte nem a sul, dentro de Portugal existe pouca variação de ancestralidade, somos todos semelhantes e partilhamos bastantes antepassados uns com os outros.

Se existe herança genética germânica em Portugal (e acho que toda a gente concorda que sim) então todos a temos, mas numas pessoas isto é mais fácil captar do que em outras. Neste caso o Celtic VS Germanic PCA do Davidski é provavelmente uma melhor ferramenta para visualizar esse drift, mas não te vai quantificar nada. Eu nunca tenho nada nos modelos seja ele qual for, mas mesmo sendo meu caso incomum (link (https://i.postimg.cc/Pqbv3nQ6/Ruderico-celt-germ.png)) não tenho dúvidas que haverão uns antepassados Suevos algures no passado, até porque a minha família é do norte. Devo é ter herdado menos que a maioria.


Questão interessante intolerância à lactose em antigos ibéricos. Sou intolerante à lactose, e muito provavelmente devido à minha genética; é possível que seja um arcaísmo genético herdado daquela época.

Se calhar 1/3 ou 1/4 de Espanha deve ser, estás longe de ser o único :)

rober_tce
01-08-2021, 05:46 PM
Se calhar 1/3 ou 1/4 de Espanha deve ser, estás longe de ser o único :)

Na verdade, existem muitos intolerantes à lactose na Península Ibérica, e mais do que são diagnosticados. Mesmo assim, os dados anteriores que você deixou sobre a intolerância à lactose nos tempos antigos são curiosos.

Shadogowah
01-09-2021, 03:24 PM
Na verdade, existem muitos intolerantes à lactose na Península Ibérica, e mais do que são diagnosticados. Mesmo assim, os dados anteriores que você deixou sobre a intolerância à lactose nos tempos antigos são curiosos.



Aproveitar um recurso como leite e queijo para obter vitamina D é um fator evolutivo fundamental para sobreviver nas brumas do norte. Portanto, deduzo que essa mutação é altamente favorecida no norte (na ausência de outras fontes, como o salmão) e consideravelmente menos no sul. A intolerância à lactose deve, portanto, ser mais comum em um perfil mediterrâneo do que em um nórdico.

mokordo
01-09-2021, 06:46 PM
About lactase:


Low Prevalence of Lactase Persistence in Bronze Age Europe Indicates Ongoing Strong Selection over the Last 3,000 Years


Lactase persistence (LP), the continued expression of lactase into adulthood, is the most strongly selected single gene trait over the last 10,000 years in multiple human populations. It has been posited that the primary allele causing LP among Eurasians, rs4988235-A [1], only rose to appreciable frequencies during the Bronze and Iron Ages [2, 3], long after humans started consuming milk from domesticated animals. This rapid rise has been attributed to an influx of people from the Pontic-Caspian steppe that began around 5,000 years ago [4, 5]. We investigate the spatiotemporal spread of LP through an analysis of 14 warriors from the Tollense Bronze Age battlefield in northern Germany (∼3,200 before present, BP), the oldest large-scale conflict site north of the Alps. Genetic data indicate that these individuals represent a single unstructured Central/Northern European population. We complemented these data with genotypes of 18 individuals from the Bronze Age site Mokrin in Serbia (∼4,100 to ∼3,700 BP) and 37 individuals from Eastern Europe and the Pontic-Caspian Steppe region, predating both Bronze Age sites (∼5,980 to ∼3,980 BP). We infer low LP in all three regions, i.e., in northern Germany and South-eastern and Eastern Europe, suggesting that the surge of rs4988235 in Central and Northern Europe was unlikely caused by Steppe expansions. We estimate a selection coefficient of 0.06 and conclude that the selection was ongoing in various parts of Europe over the last 3,000 years.

https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S0960982220311878

JJJ
01-09-2021, 07:01 PM
Aproveitar um recurso como leite e queijo para obter vitamina D é um fator evolutivo fundamental para sobreviver nas brumas do norte. Portanto, deduzo que essa mutação é altamente favorecida no norte (na ausência de outras fontes, como o salmão) e consideravelmente menos no sul. A intolerância à lactose deve, portanto, ser mais comum em um perfil mediterrâneo do que em um nórdico.

Isso não explica que os espanhóis de hoje sejam mais tolerantes à lactose do que há 3.000 anos. Da mesma forma, os europeus do norte, que estavam cercados por mares ou próximos a rios, podiam se alimentar de peixes e obter vitamina D.

Shadogowah
01-10-2021, 12:43 PM
Isso não explica que os espanhóis de hoje sejam mais tolerantes à lactose do que há 3.000 anos. Da mesma forma, os europeus do norte, que estavam cercados por mares ou próximos a rios, podiam se alimentar de peixes e obter vitamina D.

Eu diria que isso explica muito bem. Existe uma forte pressão evolutiva que favorece a mutação e que obviamente deve surgir depois do Neolítico e da domesticação de cabras, ovelhas e vacas. Só estou dizendo que a pressão deve ser amenizada onde os laticínios não são parte fundamental da dieta, existem outras fontes de vitamina D. Seja em comunidades que vivem da pesca de peixes gordurosos ou em climas que permitem sua síntese apenas no banho de sol.

Caius Agrippa
01-18-2021, 02:12 PM
Sei que alguns membros se opõem ao uso de coordenadas escaladas por as considerarem não-científicas, mas por que diabos as distâncias e mesmo alguns resultados são muito mais fiáveis com coordenadas escaladas? Um bom exemplo é a calculadora dita ''oficial'' do Global 25, na versão não escalada vários portugueses têm quantidades elevadas de várias misturas exóticas que são francamente impossíveis (Han, ETH_4500BP, Dinka etc), além das distâncias serem absurdas (Gambian, Han, Jarawa, Levante e Yoruba antes de WHG ou Yamnaya).


TUR_Barcin_N,0.1175998,0.180118,0.0035312,-0.101158,0.0510443,-0.0483875,-0.0043582,-0.0069334,0.0362287,0.0807473,0.0079718,0.0118803,-0.0234545,0.0004691,-0.0419807,-0.0101913,0.0233091,0.0019866,0.0136954,-0.0097489,-0.0142249,0.0057723,-0.0041232,-0.0031658,-0.0043437
TUR_Tepecik_Ciftlik_N,0.108701,0.1731478,-0.0143308,-0.100534,0.0270818,-0.0402298,-0.0045828,-0.005019,0.02623,0.05745,0.008444,0.0080555,-0.0101832,0.0052298,-0.0352192,-0.0104748,0.0088662,0.0004432,0.005342,-0.0032828,0.0026827,0.0044515,-0.0071795,-0.0038258,-0.0045805
BRA_LapaDoSanto_9600BP,0.050765,-0.3095332,0.1206032,0.098515,-0.1156522,-0.017626,-0.284645,-0.3400012,-0.0136212,-0.0184422,0.002241,-0.003267,0.0004162,0.017478,-0.0065688,0.0064438,0.006493,-0.001267,0.0026898,0.003727,-0.0010482,0.007963,-0.002662,-0.0043378,0.001413
Dinka,-0.577083,0.0507765,-0.0003773,-0.0075098,-0.0053855,-0.0016735,-0.0176848,0.0204222,0.081145,-0.0969495,-0.02107,0.022742,-0.0383172,-0.0011698,0.0101452,-0.021347,0.0186125,-0.0094382,0.0241968,-0.0241678,0.002402,0.003308,0.001479,0.0009038,0.0 096995
ETH_4500BP,-0.511066,0.043668,0.000754,0.000969,-0.00277,-0.011435,0.050997,-0.045229,0.089172,-0.087838,-0.012991,-0.002997,-0.031219,0.000688,0.02158,-0.029965,0.027772,0.039273,0.00176,-0.009004,0.000374,0.006183,-0.003451,-0.00241,-0.000838
Gambian,-0.6064875,0.0671942,0.0197362,0.0114665,0.0021028, 0.0055777,-0.0358392,0.0387677,-0.0317353,0.0241463,0.0054132,-0.0036467,0.0162287,-0.0009865,0.011016,-0.0153362,0.009692,-0.0011823,-0.002116,-0.0032307,-0.001643,-0.0018137,0.0043958,-0.0001005,0.001377
Han,0.0206952,-0.4507105,-0.0082967,-0.0651579,0.0780846,0.0374475,0.0029055,-0.004804,-0.0150232,-0.0031146,-0.0495875,-0.0070573,0.0072707,-0.0081072,-0.0043305,0.0012535,0.0017542,-0.0008638,-0.0020455,-0.0102206,0.0122397,0.0069582,0.0141063,-0.0012925,-0.0022315
IRN_Ganj_Dareh_N,0.0430252,0.0664158,-0.1550722,0.0047158,-0.122669,0.0235384,0.017109,-0.0011998,-0.082546,-0.0544158,-0.0028258,-0.0016186,0.0044896,-0.0062756,0.0316498,0.0561384,-0.0054242,0.0068664,0.0136508,-0.0334162,0.00856,-0.028836,-0.0110678,-0.039331,0.0222254
IRN_Shahr_I_Sokhta_BA2_I8728,0.033009,-0.081242,-0.184789,0.125325,-0.09848,0.06777,0.002585,0.007615,0.03661,0.02606,-0.002273,0.010041,-0.005798,0.006744,0.004479,0.001326,0.008605,0.001 267,0.00352,0.001376,0.003743,-0.004946,-0.00037,-0.00253,-0.007305
Jarawa,-0.0219821,-0.2430289,-0.1324164,0.0986968,0.0323713,-0.0045841,-0.01012,0.0065044,0.0546974,0.0238044,0.0228054,0. 0027349,-0.0041532,0.0103562,-0.0108067,-0.0114441,0.0094529,-0.0019082,-0.0062221,0.0286778,-0.0046401,0.0111366,-0.0123402,0.0022668,0.0049844
Kura-Araxes_ARM_Kaps,0.1013025,0.133034,-0.07071,-0.043605,-0.0498555,-0.0092035,0.008108,-0.011653,-0.066368,-0.01631,0.0030855,0.011015,-0.019846,0.005849,0.0042075,-0.0102095,-0.0001305,-0.003927,-0.001697,0.0032515,0.003494,-0.000247,-0.0036975,-0.0090975,-0.0030535
Levant_PPNB,0.072847,0.1639064,-0.0316026,-0.1361132,0.0332986,-0.0645352,-0.0134426,-0.0147684,0.0741604,0.03601,0.0188046,-0.0150764,0.035738,0.0025596,-0.0217696,0.006099,0.0098048,-0.0013176,-0.0047264,0.0188088,-0.001797,0.0071472,0.0008872,-0.0056874,-0.0037602
MAR_Taforalt,-0.189857,0.0814452,-0.0242866,-0.085595,0.027636,-0.0552202,-0.0705968,0.0184146,0.155397,0.003499,0.0209156,-0.0318316,0.0747168,-0.0513334,0.0711988,-0.0363032,0.0052676,-0.066106,-0.1424162,0.0389938,-0.0376836,-0.1255322,0.0730118,-0.0137606,0.0164534
Nganassan,0.0476917,-0.4066181,0.1557885,0.0023902,-0.1594452,-0.0882129,0.0285066,0.0433367,0.0310876,0.0128477, 0.1028569,0.0094115,-0.0040734,-0.0261619,-0.0219731,-0.0123307,-0.0010952,0.0134165,0.0268365,-0.0008505,0.0431363,-0.0118954,0.0336096,0.0003977,0.0135556
WHG,0.1246365,0.116278,0.184789,0.189279,0.1546445 ,0.0464355,0.0131605,0.0372675,0.0890705,0.017768,-0.0153455,-0.015811,0.0159065,-0.0030275,0.053338,0.0582065,0.00502,0.016343,-0.0093015,0.055589,0.0944585,0.0111905,-0.049607,-0.160866,0.0170045
Yamnaya_RUS_Samara,0.1255849,0.089028,0.0426986,0. 1153479,-0.0287232,0.0450564,0.0036033,-0.0025642,-0.0559032,-0.0728943,0.0018222,3.32e-05,-0.0026924,-0.0233041,0.0366141,0.0157633,-0.0012316,-0.0017879,-0.0038408,0.0137704,-0.0031749,0.0007557,0.0110649,0.0186102,-0.004537
Yoruba,-0.6300625,0.0625011,0.022113,0.0167079,0.0005035,0 .0124741,-0.044417,0.0477673,-0.0488813,0.0327694,0.0046205,0.0007904,0.0230561, 0.0009509,0.0125232,-0.0096067,0.0070763,0.0004491,0.006022,-0.00299,0.0015542,0.0023156,-0.0017592,-0.0004711,-0.0004246

Unscaled

https://i.postimg.cc/ZYxjFQY7/Unscaled.png

Scaled

https://i.postimg.cc/G3ftNLpH/Scaled.png

Os resultados escalados fazem muito mais sentido nesse caso. Na versão unscaled tem até uma amostra com 10% Taforalt, deveria ser impossível (isso o faria mais de 30% norte-africano).

Ruderico
01-18-2021, 02:52 PM
Sei que alguns membros se opõem ao uso de coordenadas escaladas por as considerarem não-científicas, mas por que diabos as distâncias e mesmo alguns resultados são muito mais fiáveis com coordenadas escaladas? Um bom exemplo é a calculadora dita ''oficial'' do Global 25, na versão não escalada vários portugueses têm quantidades elevadas de várias misturas exóticas que são francamente impossíveis (Han, ETH_4500BP, Dinka etc), além das distâncias serem absurdas (Gambian, Han, Jarawa, Levante e Yoruba antes de WHG ou Yamnaya).

Simples, porque usam essencialmente as primeiras dimensões, onde está alocada a maior parte da informação, as dimensões superiores são menos informativas e portanto o ruído interfere mais. Isto é ainda mais crítico em amostras antigas, como taforalt. O problema é que continuam a ter 25 dimensões, e não resolvem o problema para as quais foram criadas, eliminar o ruído dos modelos, e fazem isto com distorção de dados e perda de informação. A permissa tem até um erro, é que ninguém usa distâncias euclideanas num PCA para medir distâncias genéticas. Como o Anglesqueville até mostrou, se esse fosse o objectivo, até seria melhor totalmente eliminar as dimensões superiores a 8, e manter o resto. Mais grave é que a metodologia nunca passaria numa revisão de pares. Se não nos balizamos por métodos cientificamente acreditados, então estamos aqui a fazer o quê?

Quanto aos resultados serem mais fiáveis estou totalmente em desacordo, basta veres os resultados do pai do Pedro Ruben para veres que as coordenadas escaladas lhe dão entre 20% a 25% norte Africano, quando na realidade o valor médio em Portugal anda pelos 10/11% e a variação nacional é pequena. Se isso é mais fiável então não sei o que será menos.

PS: Nunca vi um único PCA em estudos genéticos a aplicar algo minimamente semelhante, o que todos fazem é mostrar PC1-PC2 e ocasionalmente mais uma ou duas dimensões e pronto.

Caius Agrippa
01-18-2021, 03:19 PM
Quanto aos resultados serem mais fiáveis estou totalmente em desacordo, basta veres os resultados do pai do Pedro Ruben para veres que as coordenadas escaladas lhe dão entre 20% a 25% norte Africano, quando na realidade o valor médio em Portugal anda pelos 10/11% e a variação nacional é pequena. Se isso é mais fiável então não sei o que será menos.


Eu entendo o raciocínio por trás da crítica ao escalamento de dados, mas como explicar portugueses com 6% de Han e/ou 5% de Mota (e isso sem descontar o Taforalt, então não dá nem para dizer que um ''comeu'' o outro, o que ainda seria uma péssima explicação já que são populações marcadamente distintas) no modelo básico do Global25? Pode ser que a calculadora usada pelo Davidski seja ruim e/ou pensada apenas para coordenadas escaladas, mas ainda assim a questão das distâncias permanece. É geneticamente impossível que um português seja mais próximo de um chinês do que das amostras Yamnaya. Talvez o problema esteja em usar amostras antigas e modernas ao mesmo tempo, não sei ao certo. Sem contar que as coordenadas não-escaladas sempre injetam quantidades não irrelevantes de ruído asiático oriental (Han, Mongol, Jomon) em praticamente todos os europeus, entendo considerar 1% ou 2% de ruído como normal, mas 4-5% já é demais, pelo menos na minha opinião, existe algum problema maior aí.

Tenho certeza que usando métodos formais (qpAdm) dificilmente um português terá Han, Jomon ou ETH_4500BP.

Ruderico
01-18-2021, 03:46 PM
Eu entendo o raciocínio por trás da crítica ao escalamento de dados, mas como explicar portugueses com 6% de Han e/ou 5% de Mota (e isso sem descontar o Taforalt, então não dá nem para dizer que um ''comeu'' o outro, o que ainda seria uma péssima explicação já que são populações marcadamente distintas) no modelo básico do Global25? Pode ser que a calculadora usada pelo Davidski seja ruim e/ou pensada apenas para coordenadas escaladas, mas ainda assim a questão das distâncias permanece. É geneticamente impossível que um português seja mais próximo de um chinês do que das amostras Yamnaya. Talvez o problema esteja em usar amostras antigas e modernas ao mesmo tempo, não sei ao certo. Sem contar que as coordenadas não-escaladas sempre injetam quantidades não irrelevantes de ruído asiático oriental (Han, Mongol, Jomon) em praticamente todos os europeus, entendo considerar 1% ou 2% de ruído como normal, mas 4-5% já é demais, pelo menos na minha opinião, existe algum problema maior aí.

Tenho certeza que usando métodos formais (qpAdm) dificilmente um português terá Han, Jomon ou ETH_4500BP.

Sim, não há Han nem Jomon em Portugal (na maioria dos casos, claro) mas a minha namorada também fica sempre com 2% disso em dados escalados. Como disse o scaling não resolve o problema do ruído, continuam a haver 25 dimensões. Se ela fica ou não com dados regulares não sei porque nunca ponho essas referências, acho uma perda de tempo meter componentes sem valor histórico ou indícios genéticos como fonte nos modelos, só vão atrapalhar e causar overfitting - que é um dos outros problemas que os modelos têm e que quase ninguém liga - e estragar o modelo. Eu faço sempre modelos personalizados para a história da amostra em questão, não meto tudo ao barulho para ver o que sai.

Eu também não ligo nada aos "modelos básicos" do G25 e nunca os faço. Acho que as amostras são demasiado antigas para isto, a grande maioria das dimensões mais altas não estão lá a fazer nada. Se já podem causar ruído em amostras modernas - que foram usadas para construir as 25 dimensões do G25 - em amostras com 7000 anos que tinham variação diferente isso é ainda pior. Os escalados poderão talvez funcionar melhor aqui por causa disso, mas o problema metodológico continua presente.

É verdade que algumas distâncias euclidianas do PCA ficam estranhas e são difíceis/impossíves de explicar, mas ninguém as usa para medir nada, nem o nMonte as usa na construção de modelos - este limita-se a fazer cálculos entre as coordenadas dos diferentes pontos e a chegar a um valor próximo às coordenadas do ponto que está a ser testado. Verdade seja dita, um PCA é uma ferramenta de visualização de dados, já isto de aplicar um método de Monte Carlo é de fazer torcer o nariz um pouco. Com dados alterados posteriormente ao cálculo de dados de PCA mais dúbio fica.
Eu continuo na minha: só faço modelos com populações sub-modernas em contexto histórico, usando dados de PCA que foram obtidos directamente através dos dados brutos. Quem quiser usar outros está à vontade e não vou criticar (até porque ocasionalmente também corro esses modelos que aí aparecem só por curiosidade), mas ninguém têm moral para criticar a honestidade científica por de trás dos dados regulares, porque se eles têm problemas então os escalados também irão ter, e tratar-se-ia de um problema do G25 em si. E esse até existe, mas não me parece crítico, o G25 serve para ter uma ideia boa do que se passa.


Edit: Só por curiosidade, aqui está o Portugal4 num modelo básico.


[1] "distance%=2.083"

Portuguese:Portugal4

NW_Iberia_IA,64.8
Roman_Colonial,19.2
Berber_EMA,16

Sim, o Berbere está sobrevalorizado, mas longe do ridículo do que o pai do Pedro Ruben tem em vários modelos com dados escalados:


Target: Dad_scaled
Distance: 2.1850% / 0.02184989
63.0 Iberian
22.2 NorthAfrica
14.8 Germanic

Distance: 1.6972% / 0.01697165
Target: Dad_scaled
47.7 Gallic
22.1 Berberic
19.4 Latin
6.9 Thracian
2.6 Hyperborean
1.3 Baltic


meu, unscaled:

[1] "distance%=1.407"

Pai_PR

NW_Iberia_IA,72.4
Roman_Colonial,13.8
Berber_EMA,11.2
SSA,2.6

Caius Agrippa
01-18-2021, 04:22 PM
Sim, não creio que o Global 25 seja descartável e não foi isso que tentei insinuar. É uma ferramenta interessante, mas assim como as calculadoras do GEDmatch, tem que ser compreendida no âmbito das suas limitações. O que mais vejo por aqui nas discussões de DNA antigo é gente usando os modelos do Vahaduo/nMonte como verdade absoluta e diminuindo o trabalho de acadêmicos que levaram anos pesquisando um tema e ainda por cima usaram métodos formais mais confiáveis nas suas análises. Via de regra, todo teste que usualmente atribui resultados muito diferentes para grupos relativamente homogêneos acaba sofrendo um pouco na questão da confiabilidade.

Ruderico
01-18-2021, 04:28 PM
Sim, não creio que o Global 25 seja descartável e não foi isso que tentei insinuar. É uma ferramenta interessante, mas assim como as calculadoras do GEDmatch, tem que ser compreendida no âmbito das suas limitações. O que mais vejo por aqui nas discussões de DNA antigo é gente usando os modelos do Vahaduo/nMonte como verdade absoluta e diminuindo o trabalho de acadêmicos que levaram anos pesquisando um tema e ainda por cima usaram métodos formais mais confiáveis nas suas análises. Via de regra, todo teste que usualmente atribui resultados muito diferentes para grupos relativamente homogêneos acaba sofrendo um pouco na questão da confiabilidade.

Concordo em absoluto contigo, só acrescento que também temos ser críticos com os resultados dos estudos (em particular, devido ao seu peso e responsabilidade) e não aceitar tudo literalmente sem uma análise ou crítica ter sido feita, até porque por vezes o que tem ser questionado não são os resultados, mas sim a sua interpretação. Nada na ciência é absoluto, é assim que evoluímos, não é verdade? :)

JJJ
01-18-2021, 06:42 PM
Edit: Só por curiosidade, aqui está o Portugal4 num modelo básico.


[1] "distance%=2.083"

Portuguese:Portugal4

NW_Iberia_IA,64.8
Roman_Colonial,19.2
Berber_EMA,16

Sim, o Berbere está sobrevalorizado, mas longe do ridículo do que o pai do Pedro Ruben tem em vários modelos com dados escalados:
]

Você pode postar a planilha se não for um incômodo?

Gil Vicente
01-18-2021, 08:39 PM
Target: Gil_Vicente
Distance: 4.0115% / 0.04011473
52.0 UR_Barcin_N
32.6 Yamnaya_RUS_Samara
10.4 WHG
3.4 MAR_Taforalt
1.6 Yoruba

Esse modelo parece ter sido feito com samples scaled.

PS - As imagens são minusculas, não dá para criar uma versão maior?

Luso
01-20-2021, 05:30 PM
Target: Luso_scaled
Distance: 4.2352% / 0.04235246
50.6 TUR_Barcin_N
28.6 Yamnaya_RUS_Samara
11.2 WHG
6.0 MAR_Taforalt
2.6 TUR_Tepecik_Ciftlik_N
1.0 Dinka

Ruderico
01-26-2021, 07:20 PM
Você pode postar a planilha se não for um incômodo?


Roman_Colonial:Imperial,0.0090229,0.0146708,-0.0062979,-0.0178188,0.0014208,-0.0072875,-0.0005688,-0.0021438,0.0002062,0.0106104,0.0019917,0.0015396,-0.0026375,-0.0011021,-0.0059188,-0.0013562,0.0028938,0.0004229,0.0010604,-0.0024729,-0.0019583,0.0015146,-0.0007271,-0.0004042,0.0004729
Roman_Colonial:Levant,0.007675,0.014375,-0.015275,-0.02705,-0.0036,-0.009975,-0.003325,-0.003225,0.0038,0.007275,0.001675,-0.006475,0.00865,-0.001925,-0.007075,0.007725,0.0013,-0.000925,0.002075,0.00265,-2e-04,0.003625,-0.0029,-7e-04,-0.004
Berber_EMA,-0.00346,0.01294,-0.00062,-0.02128,0.01096,-0.01304,-0.01276,0.00358,0.03466,0.01676,0.00466,-0.004,0.01228,-0.01286,0.0171,-0.00984,0.00244,-0.01516,-0.03526,0.00832,-0.0108,-0.0305,0.01888,-0.00098,0.00386
Germanic,0.0119,0.012,0.0221,0.0224,0.0154,0.007,-0.004,0.0022,0.0056,7e-04,7e-04,0.0017,-0.0074,-0.0099,0.0255,0.0089,-0.0035,0.0013,0.0096,0.0155,3e-04,-0.001,-0.0038,-0.0017,0.0045
NW_Iberia_IA:Celtiberian,0.010633333,0.0141,0.0167 33333,0.0042,0.018566667,0.001266667,-0.0024,0.0033,0.0139,0.019,-0.0001,0.005266667,-0.013833333,-0.0088,0.005566667,-0.0035,-0.0057,0.0027,0.002166667,-0.000533333,0.005666667,0.005533333,-0.006533333,-0.003966667,-0.003866667
NW_Iberia_IA:Iberian,0.0109375,0.0146625,0.014975, 0.000675,0.01945,-0.0011375,-0.00155,0.0019375,0.0146625,0.025725,-0.0029,0.0074125,-0.0157125,-0.01055,0.0057875,0.00425,0.0052,0.001275,0.003025 ,-0.000825,0.0044625,-7.5e-05,-0.005975,-0.0102875,-0.0009375
NW_Iberia_IA:Orkney_Pict,0.01135,0.0138,0.01615,0. 01555,0.0127,0.0063,0.001,0.003,0.0013,0.00085,-0.0066,0.0041,-0.0113,-0.01035,0.01985,-0.004,-0.02015,0.0019,0.0021,0.00505,0.00065,0.00295,-0.00605,0.01365,0.001
NW_Iberia_IA:Iceland_Gaelic,0.0112,0.0134,0.01685, 0.01475,0.0112,0.00825,0.0012,0.0044,0.0038,0.0038 ,-0.00395,0.0021,-0.0122,-0.018,0.0221,-0.0026,-0.015,0.00045,0.0063,0.00425,0.00085,0.0026,0.0031 ,0.0109,0.0056



Podes acrescentar a referência indígena de Empuries, se quiseres, mas para o ocidente é capaz de ser melhor não usar porque poderá ter influência da Gália/França que não deve ter chegado cá.

NW_Iberia_IA:Iberia_Northeast_Empuries_Local,0.011 3,0.014,0.014533333,0.006366667,0.013733333,0.0028 ,0.000466667,0.002166667,0.011066667,0.0165,0.0025 ,0.008266667,0.014366667,0.015433333,0.007566667,0 .0043,0.005133333,0.0017,0.002866667,0.0038,0.0052 66667,0.003366667,0.0038,0.007533333,0.005166667


Outra referência Germânica, talvez seja melhor até

Germanic_Migration,0.011382353,0.013023529,0.01775 2941,0.017347059,0.013017647,0.007088235,0.0039058 82,0.003135294,0.000782353,-0.001647059,-0.003970588,0.001864706,-0.007170588,-0.003411765,0.017705882,0.0007,-0.009952941,0.002394118,0.003082353,0.002788235,0. 006729412,0.005070588,0.000141176,0.010464706,0.00 0441176

JJJ
01-26-2021, 07:55 PM
Roman_Colonial:Imperial,0.0090229,0.0146708,-0.0062979,-0.0178188,0.0014208,-0.0072875,-0.0005688,-0.0021438,0.0002062,0.0106104,0.0019917,0.0015396,-0.0026375,-0.0011021,-0.0059188,-0.0013562,0.0028938,0.0004229,0.0010604,-0.0024729,-0.0019583,0.0015146,-0.0007271,-0.0004042,0.0004729
Roman_Colonial:Levant,0.007675,0.014375,-0.015275,-0.02705,-0.0036,-0.009975,-0.003325,-0.003225,0.0038,0.007275,0.001675,-0.006475,0.00865,-0.001925,-0.007075,0.007725,0.0013,-0.000925,0.002075,0.00265,-2e-04,0.003625,-0.0029,-7e-04,-0.004
Berber_EMA,-0.00346,0.01294,-0.00062,-0.02128,0.01096,-0.01304,-0.01276,0.00358,0.03466,0.01676,0.00466,-0.004,0.01228,-0.01286,0.0171,-0.00984,0.00244,-0.01516,-0.03526,0.00832,-0.0108,-0.0305,0.01888,-0.00098,0.00386
Germanic,0.0119,0.012,0.0221,0.0224,0.0154,0.007,-0.004,0.0022,0.0056,7e-04,7e-04,0.0017,-0.0074,-0.0099,0.0255,0.0089,-0.0035,0.0013,0.0096,0.0155,3e-04,-0.001,-0.0038,-0.0017,0.0045
NW_Iberia_IA:Celtiberian,0.010633333,0.0141,0.0167 33333,0.0042,0.018566667,0.001266667,-0.0024,0.0033,0.0139,0.019,-0.0001,0.005266667,-0.013833333,-0.0088,0.005566667,-0.0035,-0.0057,0.0027,0.002166667,-0.000533333,0.005666667,0.005533333,-0.006533333,-0.003966667,-0.003866667
NW_Iberia_IA:Iberian,0.0109375,0.0146625,0.014975, 0.000675,0.01945,-0.0011375,-0.00155,0.0019375,0.0146625,0.025725,-0.0029,0.0074125,-0.0157125,-0.01055,0.0057875,0.00425,0.0052,0.001275,0.003025 ,-0.000825,0.0044625,-7.5e-05,-0.005975,-0.0102875,-0.0009375
NW_Iberia_IA:Orkney_Pict,0.01135,0.0138,0.01615,0. 01555,0.0127,0.0063,0.001,0.003,0.0013,0.00085,-0.0066,0.0041,-0.0113,-0.01035,0.01985,-0.004,-0.02015,0.0019,0.0021,0.00505,0.00065,0.00295,-0.00605,0.01365,0.001
NW_Iberia_IA:Iceland_Gaelic,0.0112,0.0134,0.01685, 0.01475,0.0112,0.00825,0.0012,0.0044,0.0038,0.0038 ,-0.00395,0.0021,-0.0122,-0.018,0.0221,-0.0026,-0.015,0.00045,0.0063,0.00425,0.00085,0.0026,0.0031 ,0.0109,0.0056



Podes acrescentar a referência indígena de Empuries, se quiseres, mas para o ocidente é capaz de ser melhor não usar porque poderá ter influência da Gália/França que não deve ter chegado cá.

NW_Iberia_IA:Iberia_Northeast_Empuries_Local,0.011 3,0.014,0.014533333,0.006366667,0.013733333,0.0028 ,0.000466667,0.002166667,0.011066667,0.0165,0.0025 ,0.008266667,0.014366667,0.015433333,0.007566667,0 .0043,0.005133333,0.0017,0.002866667,0.0038,0.0052 66667,0.003366667,0.0038,0.007533333,0.005166667


Empuries1 parece muito ao norte para ser completamente local, 10% mais estepe, 5% menos Neolítico e 4% menos caçador-coletor com escalada em comparação com North_Iberia_IA.

Ruderico
01-26-2021, 08:15 PM
Empuries1 parece muito ao norte para ser completamente local, 10% mais estepe, 5% menos Neolítico e 4% menos caçador-coletor com escalada em comparação com North_Iberia_IA.

Sim, eles devem ter antepassados do norte dos Pirineus, nem é preciso fazer modelos porque se vê no PCA. Podem funcionar bem em modelos exactamente porque têm mais Steppe, mas acaba por ser irrealista. Os Celtiberos geralmente não têm Steppe suficiente para servir de referência nativa única porque têm mais ou menos o mesmo que nós...mas nós temos uma parte Romana, e uma parte norte Africana. Fica a faltar algo (daí o Germanic e as amostras Gaelicas).

https://i.postimg.cc/0Nkdxmxz/IA.png




Edit: Influência La Tène na península Ibérica limita-se à Catalunha (de onde estas amostras são). Poderá ter havido algum movimento populacional sem ter causado alteração linguística. Em Portugal/Galiza certamente não existiu essa influência, seja cultural ou genética.
https://i.postimg.cc/vB3bx7Fp/la-tene.png

Ruderico
01-27-2021, 03:09 PM
Empuries1 parece muito ao norte para ser completamente local, 10% mais estepe, 5% menos Neolítico e 4% menos caçador-coletor com escalada em comparação com North_Iberia_IA.

Desculpa estar a fazer double post e a fazer quote, mas alterei o post que citaste. Acrescentei uma nova referência Germânica para se usar em vez da anterior

Germanic_Migration,0.011382353,0.013023529,0.01775 2941,0.017347059,0.013017647,0.007088235,0.0039058 82,0.003135294,0.000782353,-0.001647059,-0.003970588,0.001864706,-0.007170588,-0.003411765,0.017705882,0.0007,-0.009952941,0.002394118,0.003082353,0.002788235,0. 006729412,0.005070588,0.000141176,0.010464706,0.00 0441176

TheEmperorPalpatine
02-02-2021, 08:51 PM
Recebi hoje as minhas coordenadas do Global 25. Alguém me pode esclarecer a diferença entre o scaled e o outro? Já agora deu-me estes resultados, usando as referências deixadas pelo Ruderico na última página. Não entendo muito disto por isso não sei bem o que estou a fazer.

Target: TEP
Distance: 1.8427% / 0.01842653

70.2 NW_Iberia_IA
17.2 Roman_Colonial
12.6 Berber_EMA

Ruderico
02-02-2021, 11:39 PM
Recebi hoje as minhas coordenadas do Global 25. Alguém me pode esclarecer a diferença entre o scaled e o outro? Já agora deu-me estes resultados, usando as referências deixadas pelo Ruderico na última página. Não entendo muito disto por isso não sei bem o que estou a fazer.

Target: TEP
Distance: 1.8427% / 0.01842653

70.2 NW_Iberia_IA
17.2 Roman_Colonial
12.6 Berber_EMA

Se partilhares as coordenadas eu posso dar uma vista de olhos. Isso é com penalidade do nMonte? Tenta usar a referência germânica que eu dei ao JJJ para ver se te aparece algum germânico ou se sofres do mesmo 'problema' que eu.

Germanic_Migration,0.011382353,0.013023529,0.01775 2941,0.017347059,0.013017647,0.007088235,0.0039058 82,0.003135294,0.000782353,-0.001647059,-0.003970588,0.001864706,-0.007170588,-0.003411765,0.017705882,0.0007,-0.009952941,0.002394118,0.003082353,0.002788235,0. 006729412,0.005070588,0.000141176,0.010464706,0.00 0441176

Tens a explicação uns posts acima. Basicamente o 'unscaled' são os teus dados brutos directamente convertidos para formato deste PCA (G25), o 'scaled' são dados do mesmo PCA posteriormente transformados que alguns aqui gostam de usar, mas se fores ver estudos académicos nunca ninguém os transforma, muito menos desta maneira.

mokordo
02-02-2021, 11:51 PM
Roman_Colonial:Imperial,0.0090229,0.0146708,-0.0062979,-0.0178188,0.0014208,-0.0072875,-0.0005688,-0.0021438,0.0002062,0.0106104,0.0019917,0.0015396,-0.0026375,-0.0011021,-0.0059188,-0.0013562,0.0028938,0.0004229,0.0010604,-0.0024729,-0.0019583,0.0015146,-0.0007271,-0.0004042,0.0004729
Roman_Colonial:Levant,0.007675,0.014375,-0.015275,-0.02705,-0.0036,-0.009975,-0.003325,-0.003225,0.0038,0.007275,0.001675,-0.006475,0.00865,-0.001925,-0.007075,0.007725,0.0013,-0.000925,0.002075,0.00265,-2e-04,0.003625,-0.0029,-7e-04,-0.004
Berber_EMA,-0.00346,0.01294,-0.00062,-0.02128,0.01096,-0.01304,-0.01276,0.00358,0.03466,0.01676,0.00466,-0.004,0.01228,-0.01286,0.0171,-0.00984,0.00244,-0.01516,-0.03526,0.00832,-0.0108,-0.0305,0.01888,-0.00098,0.00386
Germanic,0.0119,0.012,0.0221,0.0224,0.0154,0.007,-0.004,0.0022,0.0056,7e-04,7e-04,0.0017,-0.0074,-0.0099,0.0255,0.0089,-0.0035,0.0013,0.0096,0.0155,3e-04,-0.001,-0.0038,-0.0017,0.0045
NW_Iberia_IA:Celtiberian,0.010633333,0.0141,0.0167 33333,0.0042,0.018566667,0.001266667,-0.0024,0.0033,0.0139,0.019,-0.0001,0.005266667,-0.013833333,-0.0088,0.005566667,-0.0035,-0.0057,0.0027,0.002166667,-0.000533333,0.005666667,0.005533333,-0.006533333,-0.003966667,-0.003866667
NW_Iberia_IA:Iberian,0.0109375,0.0146625,0.014975, 0.000675,0.01945,-0.0011375,-0.00155,0.0019375,0.0146625,0.025725,-0.0029,0.0074125,-0.0157125,-0.01055,0.0057875,0.00425,0.0052,0.001275,0.003025 ,-0.000825,0.0044625,-7.5e-05,-0.005975,-0.0102875,-0.0009375
NW_Iberia_IA:Orkney_Pict,0.01135,0.0138,0.01615,0. 01555,0.0127,0.0063,0.001,0.003,0.0013,0.00085,-0.0066,0.0041,-0.0113,-0.01035,0.01985,-0.004,-0.02015,0.0019,0.0021,0.00505,0.00065,0.00295,-0.00605,0.01365,0.001
NW_Iberia_IA:Iceland_Gaelic,0.0112,0.0134,0.01685, 0.01475,0.0112,0.00825,0.0012,0.0044,0.0038,0.0038 ,-0.00395,0.0021,-0.0122,-0.018,0.0221,-0.0026,-0.015,0.00045,0.0063,0.00425,0.00085,0.0026,0.0031 ,0.0109,0.0056



Podes acrescentar a referência indígena de Empuries, se quiseres, mas para o ocidente é capaz de ser melhor não usar porque poderá ter influência da Gália/França que não deve ter chegado cá.

NW_Iberia_IA:Iberia_Northeast_Empuries_Local,0.011 3,0.014,0.014533333,0.006366667,0.013733333,0.0028 ,0.000466667,0.002166667,0.011066667,0.0165,0.0025 ,0.008266667,0.014366667,0.015433333,0.007566667,0 .0043,0.005133333,0.0017,0.002866667,0.0038,0.0052 66667,0.003366667,0.0038,0.007533333,0.005166667


Outra referência Germânica, talvez seja melhor até

Germanic_Migration,0.011382353,0.013023529,0.01775 2941,0.017347059,0.013017647,0.007088235,0.0039058 82,0.003135294,0.000782353,-0.001647059,-0.003970588,0.001864706,-0.007170588,-0.003411765,0.017705882,0.0007,-0.009952941,0.002394118,0.003082353,0.002788235,0. 006729412,0.005070588,0.000141176,0.010464706,0.00 0441176


Using all the suggested sources:

Target: gixajo
Distance: 1.0511% / 0.01051113
84.6 NW_Iberia_IA
9.4 Berber_EMA
6.0 Roman_Colonial

Target: gixajo_dad
Distance: 1.3144% / 0.01314450
70.0 NW_Iberia_IA
20.4 Roman_Colonial
9.6 Berber_EMA

Target: gixajo_mom
Distance: 1.2213% / 0.01221294
87.4 NW_Iberia_IA
10.6 Berber_EMA
2.0 Roman_Colonial

*****************************************

Target: gixajo
Distance: 1.0832% / 0.01083238
42.2 NW_Iberia_IA:Iberian
19.6 NW_Iberia_IA:Celtiberian
15.4 NW_Iberia_IA:Orkney_Pict
10.2 Berber_EMA
5.2 Roman_Colonial:Imperial
5.0 Germanic_Migration
2.4 Roman_Colonial:Levant

Target: gixajo_dad
Distance: 1.3144% / 0.01314438
31.4 NW_Iberia_IA:Iberian
28.4 NW_Iberia_IA:Celtiberian
20.4 Roman_Colonial:Imperial
10.2 NW_Iberia_IA:Orkney_Pict
9.6 Berber_EMA

Target: gixajo_mom
Distance: 1.2258% / 0.01225829
65.4 NW_Iberia_IA:Celtiberian
21.0 NW_Iberia_IA:Orkney_Pict
10.8 Berber_EMA
2.8 Roman_Colonial:Imperial


Well, it´s strange that my mother scores more Berber than me or my father, but...who knows.

Edit:I see distances and results changed slightly when I run again the model.

mokordo
02-03-2021, 12:03 AM
Ah, ok, Guanches...

Target: Berber_EMA
Distance: 0.6184% / 0.00618419
41.4 Saharawi
28.4 Berber_MAR_TIZ
15.0 Berber_Tunisia_Chen
8.6 Spanish_Soria
3.6 Basque_Spanish
0.8 Ethiopian_Afar
0.8 Ethiopian_Agaw
0.6 Ju_hoan_North
0.6 Koinanbe
0.2 Spanish_La_Rioja

That´s why she scores more I supose.

mokordo
02-03-2021, 01:09 AM
I´ve always thought that Portugueses and Galicians (Western Iberians) and Cantabrian regions also but in less quantity, use to have more North Western European input. Is it true?

All the Iberian modern references, all the Berber references and a representative collection of main European ethnicities/nationalities.

UNSCALED




Spanish&Portuguese:_Alacant,0.0099667,0.0144333,0.0098667, 8.33e-05,0.0134333,-0.001,-0.0021833,0.0007667,0.0114833,0.0171833,-0.0031333,0.0056833,-0.0104167,-0.0085833,0.0077,0.0024667,-0.0011833,8.33e-05,-0.0032167,-0.00445,0.0032333,-0.0003333,-0.0034,-0.0014167,0.0026167
Spanish&Portuguese:_Andalucia,0.0095,0.0143842,0.0094684,-0.0010632,0.0147053,-0.0021,-0.0008211,0.0011526,0.0120842,0.0171,-0.0013263,0.0048526,-0.0088842,-0.0082895,0.0075474,-0.0018842,-0.0047368,-0.0008684,-0.0033895,-0.0017053,0.0023474,-0.0010526,-0.0016,-0.0044263,0.0015737
Spanish&Portuguese:_Aragon,0.0105,0.014425,0.010975,-1e-04,0.015225,-5e-05,-0.000225,0.001275,0.012175,0.02025,-0.001325,0.006875,-0.011875,-0.009325,0.0094,-0.0021,-0.00365,-0.000625,-0.001775,8e-04,0.002775,7.5e-05,-0.00095,-0.000875,-2e-04
Spanish&Portuguese:_Asturias,0.0097,0.0142,0.0121,2e-04,0.0168,-0.0026,-0.0031,0.003,0.0127,0.0172,-0.002,0.0054,-0.0128,-0.0066,0.0106,-0.0101,-0.0122,0.001,-0.0043,-7e-04,0.0055,-0.0049,-0.0013,0.0011,0.0054
Spanish&Portuguese:_Baleares,0.0102,0.0144667,0.0107667,-0.0008667,0.0132333,-8e-04,-0.0002333,0.0010667,0.0094,0.0160667,-0.0028,0.0053,-0.0101,-0.0091667,0.0029,0.0017,0.0015333,0.0008333,9e-04,-0.0035,0.0004333,5e-04,0.001,0.0002667,-0.0034333
Spanish&Portuguese:_Barcelones,0.01048,0.01468,0.01212,0.0 0144,0.01492,0.0012,0.00138,0.00158,0.0102,0.01626 ,-0.00256,0.0047,-0.00964,-0.0067,0.00572,-0.00032,-0.00468,-8e-05,0.00188,-0.00282,0.00286,-4e-05,-0.00324,-0.00302,0.00128
Spanish&Portuguese:_Camp_de_Tarragona,0.0104625,0.014225,0 .0111875,0.00065,0.0143625,-0.0002375,-0.0009375,0.000625,0.0099125,0.0152875,0.001,0.004 ,-0.0087625,-0.0096,0.0056125,0.001875,-0.0013375,0.0008625,-0.0006375,0.0002625,0.00125,0.0021125,-0.0007625,-0.004075,-0.0006125
Spanish&Portuguese:_Canarias,0.0071421,0.0143474,0.0080263 ,-0.0039947,0.0122947,-0.0022316,-0.0027632,0.0003526,0.0154526,0.0159421,-0.0003053,0.0035105,-0.0048263,-0.0098947,0.0081211,-0.0016579,-0.0021,-0.0027526,-0.0086263,0.0007895,0.0004842,-0.0052,0.0013316,-0.0028368,0.0014211
Spanish&Portuguese:_Cantabria,0.0105,0.0145333,0.0117667,0 .0018333,0.0152,-0.0021333,-0.0002333,0.0008333,0.0115333,0.0190667,-0.0034667,0.0057667,-0.0125333,-0.0122667,0.0067,0.0012333,-0.0027,0.001,-0.0043,-0.0038333,0.0022333,6e-04,-0.0048333,-0.0014667,0.0005667
Spanish&Portuguese:_Castello,0.0105714,0.0144,0.0115286,0. 0003571,0.0147143,-0.0005571,-5e-04,0.0005143,0.0117429,0.0191143,-0.0034571,0.0045714,-0.0107429,-0.0109857,0.0058,0.0035429,0.0021143,0.0011,-7e-04,-0.0002143,0.0046286,0.0003286,-0.0052,-0.0018,0.0004714
Spanish&Portuguese:_Castilla_La_Mancha,0.01015,0.014575,0. 0107,-0.001,0.013675,-0.001725,-0.000725,0.00075,0.01205,0.018625,-0.0013,0.0058,-0.010275,-0.009,0.007575,-8e-04,-0.004625,-0.00015,-1e-04,-0.00055,0.004375,0.0012,-0.00085,-0.003225,-9e-04
Spanish&Portuguese:_Castilla_Y_Leon,0.0094667,0.0141667,0. 0107333,-0.0006667,0.0142333,0.0006667,-0.0007333,0.002,0.0139,0.0160333,-0.0014333,0.0052333,-0.0081333,-0.0087333,0.0090333,-0.0049333,-0.0052,-0.0013667,-0.0036,-0.0018333,0.0002333,-0.0007333,0.0010667,-0.0021333,-0.0023
Spanish&Portuguese:_Cataluna,0.0100667,0.0144,0.0121667,0. 0007333,0.0153333,0,-0.0008667,0.0010333,0.0109333,0.0167333,-0.0011667,0.0057333,-0.0107667,-0.0077333,0.0065333,0.0012,-5e-04,-0.0013,-9e-04,-0.0007667,0.0049667,-0.0046333,-0.0031667,-0.0016,8e-04
Spanish&Portuguese:_Catalunya_Central,0.0109222,0.0147,0.0 117,0.0006556,0.0151667,0.0005889,-7.78e-05,0.0004222,0.0103222,0.0159,-0.0017778,0.0042889,-0.0100667,-0.0090111,0.0055778,0.0037556,0.0002444,0.0010444,-0.0006444,-0.0011222,0.0023556,0.0013444,-0.0005444,-0.0021778,-6e-04
Spanish&Portuguese:_Eivissa,0.0102077,0.0144462,0.0099846,-0.0012462,0.0129077,-0.0012231,0.0001154,0.0013615,0.0101,0.0164154,-0.0015538,0.0049538,-0.0082231,-0.0062154,0.0065,0.0007308,-0.0028231,-0.0023077,-0.0018923,-0.0031846,0.0026077,0.0014692,-0.0014154,-0.0001538,-0.0012308
Spanish&Portuguese:_Extremadura,0.0092333,0.0147667,0.0087 667,-0.0003667,0.0133,-0.001,-0.0017,-0.0004333,0.0120667,0.0171333,-8e-04,0.0033667,-0.0071333,-0.0089,0.0055667,0.0019667,-0.0018,-0.0026,-0.0051,0.0003333,0.0017,-0.0038333,-0.0012,-0.0023,0.0012
Spanish&Portuguese:_Galicia,0.0095556,0.0144222,0.0108889,-0.0005111,0.0133889,-3.33e-05,-0.0023222,0.00105,0.0120833,0.0164778,-0.0013111,0.0038278,-0.0084833,-0.0088333,0.0082111,0.0004444,-0.00325,-0.0017056,-0.0040111,-0.0008056,7e-04,-0.0023444,-0.0006556,-0.0030556,0.0010889
Spanish&Portuguese:_Girona,0.01066,0.01437,0.01111,0.00102 ,0.01338,0.00058,-0.00019,0.00146,0.00977,0.01695,-0.00127,0.00592,-0.00905,-0.0098,0.00558,0.0023,0.00157,-0.00049,0.00133,-0.00218,0.00227,-0.00081,-0.00028,0.00011,-0.00138
Spanish&Portuguese:_La_Rioja,0.0107,0.015,0.0124,-0.0026,0.0175,-0.0038,-8e-04,0.001,0.0135,0.0213,-0.0033,0.0038,-0.0114,-0.0108,0.0049,0.0103,0.0081,-0.0019,-5e-04,4e-04,0.0104,0.0019,-0.0018,-0.0078,7e-04
Spanish&Portuguese:_Lleida,0.0107333,0.0144556,0.0114,0.00 06333,0.0143778,-0.0005444,0.0002778,0.0009111,0.0110444,0.0163556,-0.0005667,0.0059667,-0.0110333,-0.0099222,0.0061889,0.0001778,-0.0010889,0.0005111,0.001,-0.0007222,0.0059222,0.0002667,-0.0013778,-0.0006556,-0.0005333
Spanish&Portuguese:_Mallorca,0.0103333,0.0145667,0.0103222 ,0.0003333,0.0128,-0.0004889,0.0001667,0.0013333,0.0085111,0.0153333,-0.0018667,0.0041889,-0.0104667,-0.0061111,0.0047444,0.0019,0.0010444,0.0011556,-7e-04,-0.0010778,0.0007778,0.0006111,-0.0014222,0.0001667,-2e-04
Spanish&Portuguese:_Menorca,0.0101667,0.0145333,0.0097667,-0.0018667,0.0139,-6e-04,6e-04,6.67e-05,0.0106,0.0161,-0.0013667,0.0062,-0.0097,-0.0052667,0.0023667,-0.0021667,-0.0021667,0.0011,-7e-04,-0.0014333,0.0026333,0.0015667,0.0008667,-0.0055,-0.0049
Spanish&Portuguese:_Murcia,0.0096,0.014075,0.01005,-0.0018,0.014775,-0.00075,-0.002125,-0.00145,0.01235,0.017675,-0.0021,0.002275,-0.008325,-0.00785,0.003475,-0.001075,0.000775,0.000675,-5e-05,8e-04,0.004025,-0.002375,-0.00055,-0.0025,0.00165
Spanish&Portuguese:_Navarra,0.0105,0.0144,0.0117333,-0.0002333,0.0158333,-0.0004333,-0.0013667,-0.0006333,0.0122,0.0212333,-0.0030667,0.0076667,-0.0102667,-0.0123667,0.0115333,0.0021333,-0.0067,0.0008667,-0.0019667,-0.0020333,0.0037333,0.0020667,-0.0056333,3.33e-05,0.0039667
Spanish&Portuguese:_Pais_Vasco,0.0112667,0.0149333,0.01493 33,0.0025,0.0169333,0.0008667,1e-04,0.0012667,0.0135667,0.0218667,-0.0036333,0.0062333,-0.0141667,-0.0087667,0.0135667,-0.0018667,-0.0094667,0.0022667,0.0017667,-0.0052667,0.0062,-0.0019667,-0.0053,-0.0056,0.0030667
Spanish&Portuguese:Basque_Spanish,0.0115889,0.0148111,0.01 54556,0.0027889,0.0187111,4.44e-05,-0.0014111,0.0001778,0.0153333,0.0250222,-0.0027889,0.0077444,-0.0153222,-0.0136333,0.0132222,0.0028111,-0.0044556,0.0021889,-0.0014444,-5.56e-05,0.0070444,0.0020111,-0.0055889,-0.0075,0.0018889
Spanish&Portuguese:_Penedes,0.0107,0.0143636,0.0108364,0.0 014636,0.0136636,0.0006636,-0.0010273,0.0003455,0.0090091,0.0154909,-0.0008364,0.0036,-0.0108545,-0.0100636,0.0074182,0.0010727,0.0014727,0.0015182, 8.18e-05,-9e-04,0.0013818,-0.0005182,-0.0022455,-0.0013909,0.0003545
Spanish&Portuguese:_Peri-Barcelona,0.01065,0.01474,0.01096,0.00047,0.01449, 9e-05,0.00023,0.00058,0.01049,0.01648,-0.00107,0.00467,-0.00923,-0.00898,0.0054,0.00095,6e-05,-2e-04,-0.00059,-0.00109,0.00217,0.00067,-0.00119,-0.00035,0.00191
Spanish&Portuguese:_Pirineu,0.0107167,0.0144333,0.0113167, 8e-04,0.0146167,-3e-04,-0.0003667,0.0019,0.0124167,0.0188333,-0.0014167,0.0064167,-0.00995,-0.00905,0.0051833,0.0003333,-0.0011,3e-04,-0.0035333,-0.0012833,0.0029667,-5e-04,-0.0023,-0.00535,0.0015167
Spanish&Portuguese:_Soria,0.0107,0.014,0.01325,0.00235,0.0 1545,0.00045,-0.00125,-0.00055,0.0101,0.02055,-0.00645,0.0076,-0.0117,-0.0166,0.0084,0.01095,0.0104,-0.0023,-0.00325,-0.00055,-0.00025,-0.00115,-0.00305,-0.0049,-0.00175
Spanish&Portuguese:_Terres_de_l'Ebre,0.01072,0.01446,0.010 98,-0.00054,0.01392,-0.00158,-6e-05,0.00196,0.00918,0.01808,-0.00202,0.00522,-0.01118,-0.00808,0.0071,-0.00256,-0.00406,-0.00054,0.00032,0.00026,0.00232,6e-04,-0.0029,-0.00448,-0.00108
Spanish&Portuguese:_Valencia,0.0103667,0.0142417,0.0108333 ,-0.000275,0.0151,-0.0005167,-0.00085,0.0007083,0.011325,0.01825,-0.00185,0.0055583,-0.00865,-0.0089667,0.007075,-0.0006417,-0.0036,-0.0013583,-0.0009833,-0.0007333,0.0044667,-0.0011083,-0.0016583,-0.0042667,0.0017167
Spanish&Portuguese:Portuguese,0.009328,0.01424,0.009548,-0.001372,0.013692,-0.001452,-0.001592,0.001196,0.012516,0.01632,-0.000452,0.004952,-0.008568,-0.008184,0.009252,-3e-04,-0.000868,-7e-04,-0.004584,-0.000196,0.000912,-0.00208,0.001056,-0.00094,-8.8e-05
British_Isles:Irish,0.0117165,0.0132047,0.01622,0. 0151282,0.0122788,0.0069388,0.0014012,0.0020424,0. 0017447,0.0016059,-0.0042929,0.0038965,-0.0095447,-0.0102282,0.0191094,0.0039329,-0.0085482,0.0014953,0.0004753,0.00142,0.0040988,0. 0010341,0.0002376,0.0119565,0.0005518
British_Isles:English,0.0115842,0.0134947,0.016384 2,0.0136263,0.0127474,0.0060053,0.0021211,0.002489 5,0.0025737,0.0031158,-0.0029368,0.0037474,-0.0084684,-0.0075211,0.0151895,0.0026789,-0.0079526,0.0032316,0.0029316,0.0023684,0.0047579, 0.0027526,-0.0026526,0.0114474,2.63e-05
British_Isles:Scottish,0.01155,0.0132179,0.0165107 ,0.0145643,0.0127071,0.0061964,0.0015107,0.0022429 ,0.0017464,0.00155,-0.0034571,0.0033679,-0.0078571,-0.0087,0.0169643,0.0023571,-0.0086321,0.0021893,0.0020286,0.0011607,0.0033857, 0.002675,-0.0005321,0.01125,-0.0006429
British_Isles:English_Cornwall,0.0114385,0.0137615 ,0.0162692,0.0133692,0.0136154,0.0058846,0.0014615 ,0.0027692,0.0031692,0.0038231,-0.0028538,0.0043231,-0.0092462,-0.0074462,0.0152923,0.0023923,-0.0096077,0.0016692,0.0029923,0.0025923,0.0038538, 0.0031308,-0.0006154,0.0119231,0.0005769
Berber:Berber_Algeria,-0.0258,0.010355,0.00053,-0.012405,0.004695,-0.004425,-0.015605,0.009125,0.01317,0.011815,0.003545,-0.00302,0.01434,-0.0054,0.00842,-0.00666,0.002395,-0.008745,-0.01834,0.00399,-0.0059,-0.01588,0.00988,-3e-04,0.002215
Berber:Berber_MAR_ERR,-0.0081143,0.0128929,-0.0008714,-0.0220429,0.0083357,-0.01165,-0.0132857,0.0043786,0.0329286,0.0164214,0.0060643,-0.0039857,0.0145714,-0.0117286,0.0148786,-0.0106643,-0.0045857,-0.0168643,-0.0367,0.0075786,-0.0131857,-0.0336643,0.0201286,-0.0017143,0.0044857
Berber:Berber_MAR_TIZ,-0.0090071,0.0129643,-0.0006143,-0.0235143,0.0100929,-0.0127857,-0.0142571,0.0052071,0.0374786,0.0173214,0.0054286,-0.0061786,0.0166357,-0.0148357,0.0149929,-0.0118571,8.57e-05,-0.0227571,-0.0425,0.0095286,-0.0166857,-0.0413357,0.0249429,-0.0043071,0.0062357
Berber:Berber_Tunisia_Chen,-0.0024556,0.0136944,-0.0021444,-0.0236778,0.0090111,-0.0126222,-0.0133556,0.0022889,0.0334556,0.01635,0.0024667,-0.0029278,0.0132056,-0.0117167,0.0103833,-0.01275,0.0001167,-0.0183833,-0.0371722,0.0062833,-0.0134889,-0.0326944,0.0228278,-0.0036944,0.0053167
Berber:Berber_Tunisia_Sen,-0.0034353,0.0132706,-0.0050294,-0.0241176,0.0061118,-0.0127529,-0.0092176,0.0025412,0.0282059,0.0112824,0.0034765,-0.0081647,0.0177059,-0.0068353,0.0091941,-0.0037765,-0.0043647,-0.0103941,-0.0241353,0.0092118,-0.0068235,-0.0195588,0.0121706,-4.12e-05,0.0004588
Berber:Tunisian_Berber_Matmata,-0.0045571,0.0130714,-0.0027286,-0.0229214,0.0073929,-0.0119214,-0.0106071,0.0021571,0.0282786,0.0153786,0.0033,-0.0038071,0.0143,-0.0105071,0.0095286,-0.0077643,0.00015,-0.0126357,-0.0285357,0.0059714,-0.00915,-0.0244929,0.0166143,-0.0016214,0.003
Berber:Tunisian_Berber_Tamezret,-0.00303,0.01328,-0.00248,-0.02414,0.00868,-0.01264,-0.01096,0.00331,0.02962,0.01652,0.00343,-0.0051,0.0135,-0.01236,0.01022,-0.00812,0.00143,-0.01669,-0.03181,0.00791,-0.00868,-0.02783,0.0194,-0.00239,0.00567
Berber:Tunisian_Berber_Zraoua,-0.0025267,0.0135267,-0.0034733,-0.0242267,0.0075533,-0.01174,-0.01242,0.00192,0.0306933,0.0158067,0.0038467,-0.00538,0.0150867,-0.0090667,0.01086,-0.0097133,-0.00514,-0.0139333,-0.03062,0.0067133,-0.0099733,-0.0242333,0.0180067,-0.00202,0.00254
Slav:Belarusian,0.01162,0.0121733,0.0198933,0.0215 467,0.0130733,0.0095267,0.0045667,0.0057733,-0.0001333,-0.0135,-0.00166,-0.0061467,0.013,0.0197867,-0.0083,-0.0028667,-0.00074,0.0002933,0.0032933,-0.00084,-0.0033933,-0.0037267,0.0062667,-0.0056933,0.00058
Slav:Ukrainian,0.0115027,0.0122189,0.0181243,0.017 8189,0.0122459,0.0076351,0.0037297,0.0049,-0.0014135,-0.0115784,-0.0010054,-0.0051108,0.0103297,0.0157189,-0.0082784,-0.000827,0.0035973,-0.0005514,0.0020676,0.0013595,-0.0036054,-0.0028135,0.0054676,-0.0033676,0.0006027
German:German,0.0114443,0.0135278,0.0153747,0.0119 835,0.0129987,0.0056101,0.0017304,0.0025076,0.0017 241,0.0010316,-0.0027177,0.0015835,-0.0036127,-0.0018468,0.0062722,0.0024823,-0.0025101,0.0013127,0.0026785,0.0013747,0.0025165, 0.0016215,5.82e-05,0.0068924,0.0002316
German:Dutch,0.0111359,0.0129297,0.0162,0.0142875, 0.01315,0.0059609,0.0027844,0.0035016,0.0017484,0. 0001797,-0.0039688,0.0030609,-0.0058578,-0.006425,0.0128531,0.0040312,-0.0063,0.001,0.0033969,0.00225,0.0037594,0.0023188 ,0.0002172,0.0127422,-0.0004109
Balkan:Albanian,0.0103833,0.0139583,0.004125,-0.0049167,0.008175,-0.0026583,0.0014333,0.0007833,0.000325,0.00885,0.0 006833,0.0010333,-0.004775,0.0048,-0.0142167,-0.0031333,0.0062333,0.0011833,0.0066,-0.00475,-0.0044583,0.0005833,0.0019667,0.001825,-0.0021083
Balkan:Macedonian:Central,0.0107,0.0148,0.0045,-0.0011,0.0065,-0.0018,0.0031,0.0015,0.0009,0.005,-0.0054,-0.0011,-0.0031,0.0001,-0.0098,-0.0006,0.0073,-0.0025,0.0018,-0.0069,-0.0082,0.0003,0.0089,0.0022,-0.006
Scandinavian:Swedish,0.0117667,0.0126333,0.0191095 ,0.0174333,0.0132905,0.0076857,0.0030048,0.0040286 ,0.0024,-0.003619,-0.0029571,0.0010095,-0.0031286,-0.0027857,0.0110524,0.0030286,-0.0055476,0.001581,0.0027714,0.0039,0.0056714,0.00 18429,0.0009143,0.0088476,-0.0008143
Scandinavian:Norwegian,0.0117571,0.0126,0.0180143, 0.0165429,0.0125571,0.0075429,0.0017857,0.0027286, 0.0028,0.0002143,-0.0023,0.0024571,-0.0050571,-0.0085,0.0155286,0.0070857,-0.0041571,0.0020571,0.0005429,6e-04,0.0045143,0.0045,0.0034714,0.0147143,0.0009143
Italian:_Tuscany,0.01042,0.0146467,0.0036067,-0.0063467,0.0085,-0.0032467,-2e-04,-6e-04,0.0036667,0.0131133,-0.00014,0.00364,-0.00798,-0.00334,-0.0017533,-0.00022,0.0030933,0.00038,0.00306,-0.0019133,-0.0009667,0.0019933,-0.0008467,0.00322,-0.0013267
Italian:_Lazio,0.010075,0.015025,0.001775,-0.01085,0.006925,-0.00415,0.00105,0.000225,0.00335,0.012875,8e-04,0.0019,-0.00515,-0.00515,-0.00505,0.003125,-0.000175,-4e-04,0.00145,-0.00405,-0.0022,0.002725,-3e-04,-3e-04,-4e-04
Italian:_Liguria,0.01,0.0144,0.0072,-0.0037,0.0095,-8e-04,0.001,5e-04,0.0047,0.0139,-0.006,0.0019,-0.0088,8e-04,-8e-04,-0.0094,-0.0051,-3e-04,0.003,6e-04,-2e-04,8e-04,0.0032,6e-04,5e-04
Levant:Palestinian_Beit_Sahour,0.0077,0.01445,-0.01435,-0.0263,-0.0051,-0.0083,-0.0023,-0.0022,0.00575,0.00565,0.0021,-0.00385,0.00735,-0.0038,-0.0036,0.0109,0.00755,0.00155,-1e-04,-9e-04,-0.00135,0.00315,0.00285,0.00445,0.0028

mokordo
02-03-2021, 01:19 AM
ADD DIST COL :NO

https://i.imgur.com/IyR9EAY.png

ADD DIST COL :0.25X

https://i.imgur.com/h4Vj5zL.png

Luso
02-03-2021, 06:22 AM
I´ve always thought that Portugueses and Galicians (Western Iberians) and Cantabrian regions also but in less quantity, use to have more North Western European input. Is it true?







Oh, yes I've said this.. but do not take my word for it! I'm certain Ruderico would know better than me on all of these subjects.

And I do not personally score a northern component, but I guess it depends on the calculator. I do know some members like Pedro Ruben (northern PT), and Gil Vicente (southern PT) get pretty high Isles DNA for Portuguese on certain calculators. I'm not sure if this is some sort of overlapping issue, or they really do have a northern shift.

My results:

Target: Luso
Distance: 1.1890% / 0.01189035
81.4 Spanish&Portuguese
7.4 Italian
5.6 Balkan
4.6 Berber
1.0 Slav

Distances:

Distance to: Luso
0.01485046 Spanish&Portuguese:_Castilla_Y_Leon
0.01583098 Spanish&Portuguese:_Asturias
0.01653217 Spanish&Portuguese:_Andalucia
0.01791274 Spanish&Portuguese:_Castilla_La_Mancha
0.01805493 Spanish&Portuguese:_Terres_de_l'Ebre
0.01848684 Spanish&Portuguese:_Valencia
0.01850617 Spanish&Portuguese:_Menorca
0.01863140 Spanish&Portuguese:_Galicia
0.01875864 Spanish&Portuguese:_Eivissa
0.01906894 Spanish&Portuguese:_Aragon
0.01910819 Spanish&Portuguese:_Barcelones
0.01918344 Spanish&Portuguese:Portuguese
0.01932660 Spanish&Portuguese:_Murcia
0.01993326 Spanish&Portuguese:_Canarias
0.01995186 Spanish&Portuguese:_Lleida
0.02014278 Spanish&Portuguese:_Extremadura
0.02027782 Spanish&Portuguese:_Pirineu
0.02028780 Spanish&Portuguese:_Cataluna
0.02105722 Spanish&Portuguese:_Peri-Barcelona
0.02132590 Spanish&Portuguese:_Alacant
0.02138925 Italian:_Liguria
0.02157848 Spanish&Portuguese:_Cantabria
0.02170714 Spanish&Portuguese:_Camp_de_Tarragona
0.02218125 Spanish&Portuguese:_Mallorca
0.02226098 Spanish&Portuguese:_Penedes