jeanL
08-31-2019, 04:04 AM
Have you tried https://ytree.morleydna.com/ yet?
Here are the results:
A100-,A150-,A210-,A260-,A286-,A3-,A421-,A9-,BY126-,BY151-,BY159-,BY184-,BY352+,BY451-,CLFY12861-,CLFY2971-,CLFY3449+,CLFY7251-,CLFY7476-,CTS1019-,CTS10349+,CTS10349-,CTS10729-,CTS1078-,CTS10814-,CTS11342-,CTS11468+,CTS11468-,CTS11577-,CTS11962-,CTS12-,CTS1230-,CTS1243-,CTS1257-,CTS1264-,CTS1382-,CTS155-,CTS16-,CTS1858-,CTS1966-,CTS2022-,CTS2100-,CTS2335-,CTS241-,CTS2457-,CTS2457.1-,CTS2457.2-,CTS2514-,CTS2734-,CTS2873-,CTS300-,CTS3226-,CTS3529+,CTS3745-,CTS3818-,CTS4075+,CTS4075+,CTS4075-,CTS4231-,CTS4415-,CTS4437+,CTS4922+,CTS5488-,CTS5551-,CTS5854-,CTS5914-,CTS5981-,CTS6048+,CTS623+,CTS623-,CTS6280-,CTS6554-,CTS7556-,CTS7734-,CTS7976-,CTS8627-,CTS8995-,CTS9018+,CTS9018-,DF13-,DF17-,DF63-,F100-,F1100-,F1120-,F1150-,F1193-,F1204-,F1265-,F1295-,F1319-,F1329-,F134-,F1365+,F3393-,F36-,F4320-,F446-,F450-,F632-,F719-,F879-,F91-,F996-,FA1341-,FB1464+,FB941+,FE2801-,FGC1109-,FGC11144-,FGC11203-,FGC11555-,FGC1160-,FGC11660-,FGC12405-,FGC12993-,FGC13494-,FGC1566-,FGC1698-,FGC17449-,FGC1774-,FGC18564-,FGC188+,FGC1897+,FGC19462+,FGC20064-,FGC20560-,FGC22501-,FGC22538-,FGC22963-,FGC31715-,FGC3213-,FGC37+,FGC3754-,FGC3763-,FGC3872-,FGC4077-,FGC42+,FGC4620-,FGC4888-,FGC49+,FGC5496-,FGC5628-,FGC63-,FGC69-,FGC7535-,FGC7892-,FGC8512-,FGC8628-,FGC9807-,FL299-,H:14313115(C|T)-,IMS-JST003305-,K193-,K:14004634(A|G)-,K:14251166(G|A)-,K:14363549(G|T)-,K:15591446(C|T)-,K:15591446(C|T)-,K:15591446(C|T)-,K:17444848(G|A)-,K:21473656(G|A)-,K:2745262(C|A)-,K:6621096(T|C)-,K:7046288(A|G)-,K:7192612(T|A)-,K:8311520(A|T)-,K:8418520(T|C)-,L1029-,L1085-,L1096-,L1101+,L1248-,L1263-,L1308-,L1388-,L1392-,L14-,L1425+,L162-,L199-,L208-,L21-,L212-,L254-,L258-,L281-,L295+,L320-,L321-,L35-,L443-,L455-,L484-,L517-,L527-,L529-,L529.1-,L529.2-,L56-,L573-,L644-,L645-,L655-,L675-,L699-,L720-,L744-,L784-,L80-,L816-,L857-,L93-,M1109-,M12-,M1203-,M12111-,M12132-,M124-,M124-,M124-,M124-,M1264-,M1313-,M1470-,M1522-,M1546-,M16-,M16-,M1667-,M181-,M200-,M200-,M227-,M227-,M227-,M2308-,M240-,M267-,M2718-,M2745-,M2783-,M2834-,M2856-,M3372-,M3636-,M3658-,M3690-,M387-,M387-,M4266-,M428-,M428-,M428-,M428-,M461-,M4747-,M4793-,M4827-,M4859-,M51-,M529-,M533-,M5420+,M5475+,M5524-,M5549-,M5571+,M64-,M64.1-,M64.2-,M68-,M68-,M682-,M6886-,MEH2-,MEH2-,P102+,P102+,P102+,P102+,P116-,P116-,P126-,P127-,P173+,P196-,P221-,P229-,P257-,P260-,P260-,P280-,P292-,P298-,P304-,P321-,P324-,P324-,P34_3-,P58-,P6-,P6-,P72-,P72-,P72-,P72-,PAGES00002-,PAGES00008-,PAGES00021-,PAGES00032-,PAGES00042-,PAGES00044-,PAGES00053-,PAGES00071-,PF1395-,PF1558+,PF1697+,PF1792-,PF1837-,PF2017-,PF2137-,PF2284-,PF2622-,PF2668-,PF27-,PF2950-,PF3149-,PF3233-,PF3237-,PF3362-,PF3526-,PF3558+,PF3664-,PF3706-,PF3720+,PF3858-,PF3862-,PF3892-,PF4646-,PF4698-,PF4782-,PF4811-,PF4832-,PF4845-,PF4888-,PF4988-,PF5087-,PF5116-,PF5118-,PF5371-,PF5670-,PF5862-,PF5893-,PF6019-,PF6068-,PF6093+,PF6093-,PF6127+,PF6127-,PF6234-,PF6249-,PF6271-,PF6419-,PF6452-,PF6466-,PF6478-,PF6484-,PF6492-,PF6520-,PF6543-,PF6584-,PF7258-,PF7406-,PF7589-,PF:13963821(T|C)+,PF:14136291(A|G)+,PF:14432928(A |G)+,PF:16751825(A|G)+,PF:17013730(A|G)+,PF:181171 93(T|C)+,PF:21843090(G|C)+,Page65.1-,S1157-,S1159-,S120-,S130-,S145-,S15526-,S16196-,S1743-,S18765-,S1938-,S206-,S22865-,S23612-,S244+,S246-,S257-,S263-,S265-,S271-,S27175-,S27194+,S27216-,S27370+,S274-,S27445+,S27447-,S27531+,S27568+,S27598-,S27631-,S27643+,S27683-,S27696+,S27699-,S27769+,S280-,S299-,S324-,S335-,S380-,S384-,S388-,S439-,S4554-,S47+,S483-,S497-,S521-,S522-,S5488-,S5520-,S5556-,S6365-,S7402-,S7474+,S7655-,S8235+,S9403-,SK1106-,SK1151-,SK1254-,SK1662-,SRY10831+,SRY10831.1+,SRY10831.2-,U181-,U6-,V100-,V169-,V23-,V231-,V28-,V42-,V57-,V68+,V82-,Y11277-,Y1150-,Y2016-,Y2225+,Y2250-,Y2905-,Y2990-,Y3302-,Y3455-,Y3517-,Y4010-,Y4272-,Y4332-,Y4752-,Y4925-,Y5568-,Y5585-,Y57-,Y6885-,Y6996-,Y7060-,Y7152-,Y7214-,Y8394-,Y8712-,Y8945-,YFS026499-,YP414-,YSC0000047-,YSC0000054-,YSC0000131-,YSC0000167-,YSC0000191-,YSC0000194-,YSC0000227+,YSC0000234-,YSC0001299-,Z11-,Z1147-,Z12222-,Z12480+,Z12485-,Z12522-,Z12530-,Z12535-,Z12640-,Z1296-,Z1298-,Z13450-,Z13911-,Z13966-,Z141-,Z1426-,Z14266-,Z14405-,Z146-,Z14686-,Z147-,Z14979-,Z150-,Z16329-,Z16403-,Z16521-,Z16684-,Z167-,Z16713-,Z16775-,Z17028-,Z17627-,Z17685-,Z17699-,Z17815-,Z17819-,Z18081-,Z1846-,Z1853-,Z1865-,Z18886-,Z19-,Z1919-,Z1936-,Z19639-,Z2058-,Z2103-,Z2106-,Z2115-,Z2118-,Z2124-,Z23193-,Z23269-,Z2329-,Z23769-,Z2381-,Z23858-,Z24048-,Z246-,Z2541-,Z25907-,Z2638-,Z2649+,Z272-,Z2845-,Z2953-,Z30-,Z304-,Z30583-,Z306-,Z329-,Z331-,Z36-,Z381-,Z382-,Z4367-,Z4842-,Z49-,Z5-,Z55-,Z58+,Z5860-,Z5863-,Z5870-,Z5873-,Z5887-,Z59-,Z5985-,Z5986-,Z5993-,Z6000-,Z6013-,Z6014-,Z6017-,Z61-,Z639-,Z6552-,Z6642-,Z739-,Z741-,Z7941-,Z7944-,Z808-,Z810-,Z8127-,Z8143+,Z827-,Z843-,Z8440-,Z859-,Z971-,ZP23-,ZS20-,ZS2025+
It says most likely: E1b1b1a-E-PF2182 (E-L539, E-CTS10323).
It also says:
This suggested classification does not account for the following positive SNPs:
BY352
CLFY3449
CTS3529T
CTS4075
CTS4437
CTS4922
CTS6048
FB1464
FB941
FGC188
FGC1897
FGC19462
FGC37
FGC42
FGC49
L1425
L295
M5420
M5475
M5571
P102
PF1558
PF1697
PF3558
PF3720
PF:13963821(T|C)
PF:14136291(A|G)
PF:14432928(A|G)
PF:16751825(A|G)
PF:17013730(A|G)
PF:18117193(T|C)
PF:21843090(G|C)
S244
S27194
S27370
S27445
S27531
S27568
S27643
S27696
S27769
S47
S7474
S8235
Y2225
YSC0000227
Z12480
Z2649
Z58
Z8143
ZS2025
Powered by vBulletin® Version 4.2.5 Copyright © 2021 vBulletin Solutions Inc. All rights reserved.