16 Türk hakkında yapılan bir study hakkında

[Kqokanm]

Merhaba arkadaşlar büyük ihtimal haberdarsınız 2014'te 16 Türk hakkında genetik bir çalışma yapıldı. Çalışma daha çok bu Türklerin Irki (Negroid, Asian, Caucasian) componentlerine yönelik. Aşağıda atacağım study'i

Asıl sorum şu: Bu Türklerin dnasını studyden alıp gedmatche yükleyebilir miyiz? Daha önce lukas'tan rica etmiştim yapması için ama yapmadı malesef. Bu arada her sampleın nereli olduğunu biliyoruz plaka kodlarıyla kodlanmış memleketleri.

https://bmcgenomics.biomedcentral.co...71-2164-15-963

[Onur Dincer]

Genel itibariyle iyi bir çalışma. Ama referanslar arasında Anadolu Yunanları ve Ermeniler de olsa daha doğru köken hesapları yapılabilirdi. Sonuçta Türk göçü öncesi Anadolu genetiği Toskana ya da İberya gibi değildi.

[Kqokanm]

Genel itibariyle iyi bir çalışma. Ama referanslar arasında Anadolu Yunanları ve Ermeniler de olsa daha doğru köken hesapları yapılabilirdi. Sonuçta Türk göçü öncesi Anadolu genetiği Toskana ya da İberya gibi değildi.

Çalışmanın aslında etnisiteden çok ırki bir çalışma olduğunu düşünüyorum. Türkler Kuzey Avrupalılarla adeta kardeş halk gibiler çalışmaya göre ama etnik olarak arada dağlar kadar fark var. Bence Kuzey ve Güney Avrupa Caucasoidliği temsil ediyor (Bazı Kuzey Avrupalılar biraz güneye kayıyor onlar da Finler bu arada).

[Onur Dincer]

Çalışmanın aslında etnisiteden çok ırki bir çalışma olduğunu düşünüyorum. Türkler Kuzey Avrupalılarla adeta kardeş halk gibiler çalışmaya göre ama etnik olarak arada dağlar kadar fark var. Bence Kuzey ve Güney Avrupa Caucasoidliği temsil ediyor (Bazı Kuzey Avrupalılar biraz güneye kayıyor onlar da Finler bu arada).

Finlerde güneye kayma yok da doğuya kayma var her ne kadar düşük olsa da Doğu Avrasya miksinden dolayı. Benzer miktarda bir Doğu Avrasya miksi Anadolu Türklerinde de var, Anadolu Türklerinde de doğuya kayma var o yüzden. Dünya ölçeği yerine Batı Avrasya ölçeğinde bakıldığında Anadolu Türklerinin güney Avrupalılara kuzey Avrupalılara olduğundan çok daha yakın genetikte olduğu rahatça görülebiliyor.

[Kqokanm]

Finlerde güneye kayma yok da doğuya kayma var her ne kadar düşük olsa da Doğu Avrasya miksinden dolayı. Benzer miktarda bir Doğu Avrasya miksi Anadolu Türklerinde de var, Anadolu Türklerinde de doğuya kayma var o yüzden. Dünya ölçeği yerine Batı Avrasya ölçeğinde bakıldığında Anadolu Türklerinin güney Avrupalılara kuzey Avrupalılara olduğundan çok daha yakın genetikte olduğu rahatça görülebiliyor.

güneyden kastım çalışmadaki pca plottu. Asyalılar güneyde. Asyalı samplelar da Japonlar ve Çinliler. Üstelik çalışmadaki Türklerin çoğu Finlerden daha asyatik.

[Onur Dincer]

güneyden kastım çalışmadaki pca plottu. Asyalılar güneyde. Asyalı samplelar da Japonlar ve Çinliler. Üstelik çalışmadaki Türklerin çoğu Finlerden daha asyatik.

PCA plotlarında kuzey, güney, doğu, batı olmaz, ama her neyse, o önemli bir mevzu değil. PCA'deki Anadolu Türklerinin çoğu Doğu Avrasyalılara mesafe bakımından Finlerle aynı hizada, 5 Anadolu Türkü ise Finlerden daha çok Doğu Avrasya miksli.

[Sangarius]

Merhaba arkadaşlar büyük ihtimal haberdarsınız 2014'te 16 Türk hakkında genetik bir çalışma yapıldı. Çalışma daha çok bu Türklerin Irki (Negroid, Asian, Caucasian) componentlerine yönelik. Aşağıda atacağım study'i

Asıl sorum şu: Bu Türklerin dnasını studyden alıp gedmatche yükleyebilir miyiz? Daha önce lukas'tan rica etmiştim yapması için ama yapmadı malesef. Bu arada her sampleın nereli olduğunu biliyoruz plaka kodlarıyla kodlanmış memleketleri.

https://bmcgenomics.biomedcentral.co...71-2164-15-963

Those are whole genomes sequences, each one over 100 GB in size. It's no wonder people decline requests to process them.

Furthermore, those samples wouldn't be usefull for regional analysis anyway. To quote the paper on its sampling methodology:

We recruited 16 healthy volunteers from across Turkey (Figure 1A). The individuals were included in the study irrespective of their mother-tongue/ethnicity; we refer to them collectively as “Turkish”.

Why do these people make the extra effort to sample from different regions, if they don't really care WHO they sample? It's like they are trying to out-PC their Western colleagues.

[Kqokanm]

Those are whole genomes sequences, each one over 100 GB in size. It's no wonder people decline requests to process them.

The problem wasn't the size of genome sequences. Actually the person that i asked managed to extract a sample's dna and uploaded it to Gedmatch. But the problem is his components made no sense. He was your average Turk but he scored like 4-5% Negroid. Other samples were also like this. Sanırım dna'yı extract ederken bir hata yaptı ve böyle sonuç çıktı.

Why do these people make the extra effort to sample from different regions, if they don't really care WHO they sample? It's like they are trying to out-PC their Western colleagues

Uh, I think they used one Kurd and one Laz from Van/Artvin but the rest are Turkish imo.

[Sangarius]

The problem wasn't the size of genome sequences. Actually the person that i asked managed to extract a sample's dna and uploaded it to Gedmatch. But the problem is his components made no sense. He was your average Turk but he scored like 4-5% Negroid. Other samples were also like this. Sanırım dna'yı extract ederken bir hata yaptı ve böyle sonuç çıktı.

Uh, I think they used one Kurd and one Laz from Van/Artvin but the rest are Turkish imo.

I see, from your initial post it sounded like he refused to do it.

How do you know the ancestries of the samples? While from the PCA it looks like most have an East-Eurasian shift, that still doesn't mean that they are regional natives. That's one of the criteria of our project, otherwise we can't use them as representative samples. I still might try processing one if I knew which sample was from which region.

Additional file 1: Table S1: Geographic locations of the samples used in the project and their NCBI accession numbers.

Yet there is no geographic information about the samples in that table.

[mephisto]

23andme V5 format:
https://drive.google.com/open?id=14g...GUJt25QdRNJ1oD