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Thread: Global 25 avec Past3

  1. #21
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    Quote Originally Posted by Camulogène Rix View Post
    Dés que j'ai remis la main dessus je t'envoie mes coordonnées scaled par PM.

    David m'a dit de quel individu ancien j'étais le plus proche sur son PCA, cela m'intrigue de savoir si cela sera le même sur ton graphique.
    "Mon" graphique est "le sien". Il n'y a rien de personnel là-dedans: mêmes données, même programme --> mêmes résultats. J'imagine que tu parles du PCA, car j'ai mis les histoires de Diffusion Map en standby.
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  2. #22
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    Oui, le PCA. Personnellement j'ai du mal à lire les Diffusion maps.

  3. #23
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    Quote Originally Posted by Camulogène Rix View Post
    Oui, le PCA. Personnellement j'ai du mal à lire les Diffusion maps.
    Oublie les diffusion maps pour l'instant.
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  5. #24
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    As-tu reçu mon PM hier soir ? j'ai l'impression que ma boite AG fonctionne mal.

  6. #25
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    Quote Originally Posted by Camulogène Rix View Post
    As-tu reçu mon PM hier soir ? j'ai l'impression que ma boite AG fonctionne mal.
    Non, je n'ai rien.
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  7. #26
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    Je t'ai écrit sur ton Gmail, ta boite AG est saturée.

  8. #27
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    OK, je l'ai vidée.

    Bon, ne pas oublier: ces représentations sont pour les 2 premières composantes du PCA des 8 premières composantes d'un PCA . Ouf... Si vous avez suivi mon court échange avec David, vous avez vu que j'ai décidé d'être cool. Cool, mais pas con, quand même. Plus on filtre, plus on perd. En l'occurence, si l'on peut accepter ce double filtrage pour les besoins de la représentation, il ne faut pas se leurrer sur la fidélité du résultat obtenu. Donc, pour toutes les questions de modèles (nMonte par exemple) ou de listes de coefficients de corrélation, il faut revenir au G25 lui-même, et ressortir les résultats obtenus lors du travail original.

    forum_globe.jpg

    Si vous avez du courage, voici un pdf zoomé:

    forum_zoom.pdf

    (j'ai repris les noms, en supprimant "scaled", sauf pour Camu, qui est "camu". Moi et mes parents sont angle_dad, angle_mom, et angle)
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  10. #28
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    mes données sont en cours de traitement et devrait être là d'ici une journée dit-il.....tu pourras me rajouter ?

  11. #29
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    Quote Originally Posted by fabrice E View Post

    mes données sont en cours de traitement et devrait être là d'ici une journée dit-il.....tu pourras me rajouter ?
    Bien sûr. J'espère que tout le monde a compris que je fais cela à contrecoeur. Je ne vois vraiment pas l'intérêt de ce double filtrage, si ce n'est qu'il offre des représentations globales plus clean. Si en particulier vous souhaitez vous situer par rapport à des "anciens" (bof... pour ce que ça vaut, avec un graphique euclidien de 2 PCs), il faut revenir au G25.

    edit: J'espère que chacun d'entre vous a téléchargé Past3 et est capable de se débrouiller tout seul pour son propre cas. Si ce n'est pas le cas, je vous décerne un bonnet d'âne. Past3 se manipule comme un vulgaire tableur windows. Je veux bien accepter qu'on ait des difficultés avec R, et comprends évidemment que tout le monde ne puisse pas entrer dans l'univers de Plink, admixtools et autres. Mais chacun devrait pouvoir se débrouiller avec Past3, et ce serait dommage de s'en priver.
    Last edited by anglesqueville; 05-24-2018 at 07:46 AM.
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  13. #30
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    Paresse complète de ma part, mais je remercie mon genocousin TheConqueror de l’avoir fait. Nous sommes suffisamment proche génétiquement pour que je l’utilise comme substitut...
    K13 : 55.7% North_Dutch + 44.3% Spanish_Andalucia @ 1,7
    K15 : 79.6% Orcadian + 20.4% Sardinian @ 3,27
    Of course one population is French... @ 4,09 and 5,38 for K13 and K15.
    Y-DNA of ancestors include R-M269, J-M67 (from 23andMe genocousins -12 lines to this ancestor),
    J-CTS1192 and E-L117 (from French Heritage DNA Project at FT-DNA)

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