Vahaduo: un outil de plus

[anglesqueville]

https://vahaduo.github.io/vahaduo/

J'imagine que cet outil va vous simplifier la vie, alors j'ouvre carrément un fil pour lui. Un commentateur sur Eurogenes vient de poster sur Github un outil dans le genre de nMonte. Utilisation simplissime, extrême rapidité, cela semble vraiment de la belle ouvrage. J'espère qu'il rendra le script public, parce que je suis vraiment curieux de la manière dont il a implémenté Monte-Carlo pour parvenir à un truc aussi rapide. Je ne l'ai essayé qu'une fois, sur un PCA maison que je venais de retrouver (sur la zone HLA complète à partir des données de Pagani, plus les données imputées de mon père). J'explique sur ce cas.

A l'ouverture vous voyez cinq onglets: SOURCE, TARGET, DISTANCE, SINGLE, MULTI.

Dans SOURCE vous copiez-collez la feuille de référence SANS L'EN-TÊTE:

Capture1.JPG

Dans TARGET, même chose avec la cible:

Capture2.JPG

Dans DISTANCE vous cliquez sur la cible, et le résultat s'affiche:

Capture3.JPG

Dans SINGLE, même chose. Vous avez le choix entre deux modes de calcul (scrollez et jouez avec ADD BAR CHART MODE 1/2), mais je ne sais pas encore ce qui les différencie:

Capture4.JPG

J'imagine que l'onglet MULTI trouve son utilisation quand la cible contient plusieurs individus. C'est ce que je vais vérifier maintenant.

[anglesqueville]

Je confirme que vous pouvez entrer plusieurs individus dans l'onglet TARGET. Je confirme aussi que vous pouvez, comme sur nMonte3, rassembler les individus par population (si la première colonne de la source est bien de la forme "individu:groupe". J'ignore ce qui se passe quand cette condition est mal vérifiée, ce qui arrive souvent dans les calcs publiés ces derniers temps).

Capture5.JPG

Cette fonctionnalité me semble vraiment intéressante. Seul point noir, mais qui tient peut-être à ma connexion, j'ai essayé de rentrer la feuille complète des moyennes de G25, et cela a bloqué. L'exemple choisi vient d'un calculateur Bronze-Baltique piqué au hasard dans mes archives, et dont j'ai tout oublié.

[fabrice E]

c'est excellent ! merci du partage

[JMcB]

Interesting tool!

Like you, I tried using the G25 population averages but it wouldn’t work. So I tried using the Ancient population averages and got the following:

Attachment 32438

Attachment 32439

Attachment 32440

Nice!

Edit: I must have made a mistake on the first go round because it’s now working with the combined population averages, too.

[fabrice E]

La fonction Multi, avec en plus un calcul de moyenne est un vrai plus !
(bon, il va falloir que je me décide à sponsoriser le forum si je veux pouvoir poster directement des images, ça serait quand même plus simple )

[Theconqueror]

Une belle apli, malgre le fait qu'avec R on a qu'a ecrire une ligne de code. Pour moi, c'est le copier-colelr qui devient un peu encombrant a la longue. Le multi, comme avec nmonte runner, est tres bien.

[anglesqueville]

Une belle apli, malgre le fait qu'avec R on a qu'a ecrire une ligne de code. Pour moi, c'est le copier-colelr qui devient un peu encombrant a la longue. Le multi, comme avec nmonte runner, est tres bien.

Honnêtement, moi je suis bluffé par la rapidité, et pour une raison très simple: j'ai, peu après la naissance de nMonte, écrit des scripts R autour de l'algo de Monte-Carlo. Ils tournaient, mais convergeaient tellement lentement que c'était insupportable. Celui-là semble vraiment rapide, j'espère que l'auteur publiera le code.

[anglesqueville]

Chez moi cela bloque toujours sur les très gros fichiers cibles (genre G25 complet).

[Theconqueror]

Oui effectivement c'est probablement 5 fois plus rapide que rouler sur R. J'aime bien mais il faudra que je refasse plusieurs csv en txt sans entete.

[anglesqueville]

Pourquoi t'embêter? Tu as vu que tu pouvais directement modifier tes entrées à la souris? Tu arrives, toi, à entrer de gros .csv? S'il faut attendre une heure que les données soient emmagazinées, cela limite diablement l'intérêt. Mais encore une fois le problème vient peut-être de ma connexion, qui est pourrie.