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Thread: données G25,my heritage et recherche ethnique paternelle

  1. #21
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    Quote Originally Posted by leila geschwind View Post
    coucou fabrice as tu fait d'autres modélisations ?
    Hello Leila,

    If you would like to try another visualization, you can ask ph2ter to give you one of his basic G25 modern maps. All he’ll need is your G25 coordinates.

    See:

    https://anthrogenica.com/showthread....l=1#post700266
    Last edited by JMcB; 09-16-2020 at 02:36 PM.
    Paper Trail: 42.25% English, 31.25% Scottish, 12.5% Irish, 6.25% German, 6.25% Italian & 1.5% French. Or: 86% British Isles, 6.25% German, 6.25% Italian & 1.5% French.
    LDNA(c): 86.3% British Isles (48.6% English, 37.7% Scottish & Irish), 7.8% NW Germanic, 5.9% Europe South (Aegean 3.4%, Tuscany 1.3%, Sardinia 1.1%)
    BigY 700: I1-Z140 >I-F2642 >Y1966 >Y3649 >A13241 >Y3647 >A13248 (circa 620 AD) >A13242/YSEQ (circa 765 AD) >FT80854 (circa 1650 AD).

  2. The Following 4 Users Say Thank You to JMcB For This Useful Post:

     Dalluin (09-16-2020),  fabrice E (09-16-2020),  jstephan (09-16-2020),  leila geschwind (09-18-2020)

  3. #22
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    France Bretagne France France Bretagne Kroaz Du
    petits essais du soir....
    https://drive.google.com/file/d/1oJM...ew?usp=sharing
    Quand on voit le PCA des moyennes (mon PCA eu de base enrichi des moyennes NA), il n'y a aucun doute sur ta mixité maison se dit que ça va être sport
    Avec une tel position, les algo vont être vite parasités et donner des résultats artificiel, assez peu représentatif. il faudra donc faire du ménage et surtout faire des choix (c'est donc un biais majeur)

    un simple résultats nmonte, sans retouche, du PCA en graphique donne le ton :
    [1] "distance%=1.0014"
    Leila
    Italie_nord,39.2
    Algerian,17.8
    Dutch,14.6
    Espagne_Basque,8.4
    Moroccan_South,8.2
    Berber_Algeria,4.2
    Egyptian,4
    English,2.2
    English_Cornwall,0.8
    Italie_centre,0.6
    Les distances sont aussi parlantes, inhabituellement très élevées :

    Spanish_Extremadura 7.334013
    Sicilian_West 7.362713
    Portuguese 7.511956
    Spanish_Galicia 7.533910
    Spanish_Castilla_Y_Leon 7.653797
    Ashkenazi_Ukraine 7.750008


    C'est un résultat qui correspond à ta position graphique, ton mélange mixte, t'approche d'un mélange assez riche des bordures de la méditerranée.

    Du coup, pour faire une liste adaptée, une fois n'est pas coutume (je ne m'attarde pas normalement sur les modernes et me contente des moyennes sans aller plus loin, mais ici l'objectif est différent), et j'ai fait une liste avec les individus.
    Comme on doit se focaliser sur ce qui se passe du ^coté de l'afrique du nord, je fais surtout "le ménage" chez les EU et dans un premier temps je ne garde que les français.
    Target: Leila
    Distance: 0.3119% / 0.00311935
    23.4 French_Provence
    12.0 Algerian
    9.8 French_Alsace
    9.4 Moroccan_South
    7.2 French_Nord
    6.0 Egyptian
    6.0 French_Auvergne
    5.4 French_Brittany
    4.4 Berber_Tunisia_Sen
    3.8 French_Paris
    3.4 French_Corsica
    3.2 Mozabite
    1.4 Berber_MAR_ERR
    1.4 Libyan
    1.0 French_South
    1.0 Syrian
    0.8 Moroccan_North
    0.4 French_Occitanie

    Logique, en absence d'italiens et d'espagnols, leur équivalent sont les provençaux, le ménage va donc êtreplus radical, et je ne garde que les nord Loire :
    Target: Leila
    Distance: 0.4661% / 0.00466072
    33.6 French_Paris
    23.8 Algerian
    11.4 French_Alsace
    6.8 French_Nord
    6.8 Moroccan_South
    6.4 Egyptian
    5.0 Syrian
    3.4 Moroccan_North
    1.2 French_Brittany
    0.8 Mozabite
    0.6 Libyan
    0.2 Berber_Algeria

    ça commence à devenir intéressant.
    Pour avoir une vision différente, malgré la forte relativité de la valeur pour un mixte je passe en add dist col 0.25 (oui,pour cet essai je renonce à nmonte pour gagner du temps):

    Target: Leila
    Distance: 0.9891% / 0.00989086 | ADC: 0.25x
    33.8 French_Paris
    28.4 Mozabite

    12.6 Syrian
    11.6 Algerian
    10.0 French_Alsace
    2.4 Egyptian
    1.2 French_Brittany

    Quand même, se contenter des français limite la vision, et après divers essais, je décide de rajouter les voisins : Belges, Allemands, Anglais et Dutch. Les syriens sont aussi surle PCA dans une position qui parasite sans doute les résultats, je décide donc de les enlever pour voir.
    En pen =0, ça nous donne :
    Target: Leila
    Distance: 0.4507% / 0.00450701
    23.8 Algerian
    22.0 French_Paris
    15.6 German
    9.4 Egyptian
    7.4 Belgian
    6.0 French_Alsace
    5.6 Libyan
    5.0 Moroccan_South
    3.0 French_Brittany
    1.8 Moroccan_North
    0.4 Berber_Algeria

    et en ADC0.25, ça donne :

    Target: Leila
    Distance: 0.8554% / 0.00855365 | ADC: 0.25x
    22.2 Mozabite
    14.6 German
    14.6 Algerian
    14.2 French_Alsace
    12.4 French_Paris

    10.4 Egyptian
    5.2 Dutch
    4.0 Libyan
    2.4 Belgian

    intéressant intéressant ! je l'aime bien ce résultat !
    Par curiosité je passe ça en ADC 0., juste pour voir

    Target: Leila
    Distance: 1.4405% / 0.01440470 | ADC: 0.5x
    49.6 French_Alsace (un large nord-est donc)
    27.4 Mozabite
    15.6 Algerian
    6.4 Egyptian
    1.0 French_Nord

    ce qui est intéressant avec ce dernier, c'est le quasi parfait 50/50, et qu'on y reconnait un peu ta généalogie EU. ça nous donne une petite idée de tes origines paternelles.
    Je ne peux pas dire s'il est tunisien ou quoi, Nationalité et génétique, ce n'est pas la même chose. En revanche, ça nous donne les tendances de ses similarités (une vision sur tes résultats EU donne une idée des pincettes qu'il faut prendre.)
    Mais assez clairement il a plus d'affinité vers les algériens, et plus particulièrement les mozabites, des berbères donc, avec une tendance non négligeable pour l'est de l'Afrique du nord (si j'enlève les égyptiens, ils sont remplacés dans une proportion identique par les lybiens)
    Dans cette liste, il y a aussi des pop Sub-Saharienne et Arabique, qui ne ressortent quasi jamais (dans des proportions tels qu'ils ne sont clairement là que pour des ajustements),ce qui tend à nous montrer une certaine homogénéité pour ton père.
    Mes listes anciennes ne sont pas faites pour ton type de mélange, mais je vais essayer quelques adaptations (ça va prendre un peu de temps)

  4. The Following 8 Users Say Thank You to fabrice E For This Useful Post:

     Agamemnon (09-17-2020),  Dalluin (09-16-2020),  JMcB (09-16-2020),  jstephan (09-18-2020),  leila geschwind (09-18-2020),  loxias (09-16-2020),  palamede (09-25-2020),  Rinema (09-19-2020)

  5. #23
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    merci beaucoup pour ton travail c'est super interessant je ne savais pas qu'on pouvais faire tant de choses avec les donnees G25

  6. The Following 2 Users Say Thank You to leila geschwind For This Useful Post:

     fabrice E (09-18-2020),  JMcB (09-18-2020)

  7. #24
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    Quote Originally Posted by leila geschwind View Post
    merci beaucoup pour ton travail c'est super interessant je ne savais pas qu'on pouvais faire tant de choses avec les donnees G25

    J'ai la petite "voix" d'Angles qui dirait sans aucun doute qu'on en fait trop

  8. The Following User Says Thank You to fabrice E For This Useful Post:

     JMcB (09-18-2020)

  9. #25
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    Quote Originally Posted by fabrice E View Post
    J'ai la petite "voix" d'Angles qui dirait sans aucun doute qu'on en fait trop
    Hehe, la petite voix d'angles... Le cas de Leila est un cas d'école, car on n'a pas tous les jours des individus comme elle, décomposables en deux composantes d'importance égale et quasiment orthogonales. Dans un tel cas je ne conteste pas l'utilisation de nMonte, à condition de se limiter à des modèles binaires. Ce que je conteste, tu le sais bien, c'est les modèles complexes avec des tas de sources plus ou moins redondantes. Enfin, je les conteste ... disons que je n'y crois pas du tout. Mais je n'en fais pas non plus une montagne...
    En North alom, de North venom
    En North fum naiz, en North manom

    (Roman de Rou, Wace, 1160-1170)

  10. The Following 4 Users Say Thank You to anglesqueville For This Useful Post:

     fabrice E (09-18-2020),  Helgenes50 (09-19-2020),  JMcB (09-18-2020),  loxias (09-18-2020)

  11. #26
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    T'inquiète, c'est juste un clin d'oeil.....bien quelque part tu es ma voix de la raison génétique.

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     anglesqueville (09-18-2020)

  13. #27
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    Hello Leïla
    A partir de G25, certains arrivent à reproduire des cartes plutôt parlantes et il y a quelqu'un ici qui s'en débrouille très bien.
    Voilà la mienne :
    Carte Marine 2 pop précis.png
    Dans mon cas il y a la Bretagne et la Kabylie d'englobés avec quelques débordements mais c'est très parlant et j'en suis vraiment satisfaite. Et je précise que cette carte est le cas donné pour 2 populations.

    Car pour 1 population, ça donne ceci :
    Carte Marine 1 population.png

    Voilà pourquoi j'ai sans cesse des résultats erronés sur les tests adn avec leur 61% Iberian sur MyHeritage (pour un parent breton et une maman kabyle), et la nouvelle mise à jour de Family Tree DNA qui me donne plus de 50% Europe du Sud, seulement 18-19% Afrique du Nord et Europe du Nord.

    Du coup Leïla, tu peux m'envoyer tes coordonnées G25 et j'enverrai un mp au gars concerné qui fait ces cartes si tu veux.

    Mais encore une fois pour t'aider à connaître les origines de ton père, le mieux à faire est de questionner tes matchs sur leurs origines et plus tu auras de matchs à donner la même région voire un périmètre, plus tu auras des chances de deviner l'origine de ton père.
    Moi mes matchs viennent tous à majorité du village kabyle de ma mère (ou alentours) et de Bretagne pour mon père (dont des villages communs aussi). Donc, tu ne pourras pas trouver plus précis que n'importe quels autres tests adn que tes propres correspondances adn qui sont à ta portée !
    23andme : 47.6% North African (Béjaïa & Sétif, Algeria) / 43.6% Northwestern European (Brittany, France), 4.7% Southern European
    G25 : 50.00 % French_Brittany_Rennes_B_46 + 50.00 % Algerian_Algerian43A23 0.008153
    Paternal lineage : I-M223 / I-Y3259 / I-CTS616 / I-Y3721 / I-Y3670 / I-L1229 / I-S18331 / I-Y6512 / I-Y38675
    Father's maternal lineage : H1b1-a (T16362C)
    Maternal lineage : T1a2f
    Mother's paternal lineage : G-Y85585 / G-Z36520 / G-FP3147 / G-Z36525 / G-BY37102*

  14. The Following User Says Thank You to Rinema For This Useful Post:

     leila geschwind (10-11-2020)

  15. #28
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    coucou je t'envoie ça sur messenger merci beaucoup c'est top

  16. #29
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    France Morocco Occitania
    Salut Leila,
    je pense qu'on a déja discuté sur Facebook (c'est Mohamed), ou alors je dois te confondre avec quelqu'un d'autre qui a la même problématique que toi.
    Je me félicite en tout cas, que tu aies fait un G25.
    Je me suis permis de prendre ton G25 et de le triturer un petit peu pour reconstituer une sorte de G25 de ton père biologique. Bien évidemment, il s'agit là d'une estimation car je n'ai pas le G25 de ta mère (d'ailleurs il aurait été intéressant que tu puisses l'obtenir pour affiner l'estimation).
    En tout cas, j'ai pris plusieurs hypothèses pour les origines de ta mère (Paris, Auvergne, Alsace, Nord) et une valeur moyenne. A partir de là, j'ai déterminé des valeurs virtuelles pour ton père biologique et j'obtiens la carte suivante avec un PCA simple (je n'ai marqué que les deux premières valeurs). Attention, il s'agit d'une estimation avec beaucoup d'hypothèses qu'il faudrait confirmer. De plus, le problème avec les populations maghrébines, c'est qu'il n'y a pas de structures géographiques comme on peut le voir en Europe (du fait de la grande part du nomadisme dans le passé). En conséquence, un Marocain peut parfois être plus proche génétiquement d'un Tunisien ou d'un Libyen que de son voisin de village.
    En fonction de chaque hypothèse prise pour l'origine de ta mère, j'obtiens un point sur la carte génétique. Selon cette carte l'image virtuelle de ton père biologique serait proche des Tunisiens et des Libyens (donc logiquement des Tunisiens du sud).


    pere Patricia.png

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     Dalluin (10-13-2020),  E_M81_I3A (10-13-2020),  leila geschwind (10-13-2020)

  18. #30
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    merci beaucoup mohamed c'est super intéressant tout ça c'est fou tout ce qu'on peut faire avec ces données

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